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落叶松体细胞胚胎发生过程中DNA甲基化分析及MET1、DDM1克隆研究

摘要第1-7页
Abstract第7-16页
第一章 绪论第16-35页
   ·引言第16-18页
     ·研究背景第16-17页
     ·研究目的与意义第17页
     ·项目来源与经费支持第17-18页
   ·DNA甲基化研究现状第18-23页
     ·胚性细胞系的DNA甲基化第19页
     ·转座子与DNA甲基化变化第19-20页
     ·DNA甲基化抑制剂第20-21页
     ·基因编码区甲基化对转录的影响第21页
     ·与DNA甲基化相关的组蛋白修饰第21-22页
     ·基于大规模测序的DNA序列甲基化研究第22页
     ·DNA甲基化影响转录机制第22-23页
   ·DNA甲基转移酶研究进展第23-32页
     ·MET1(DNA METHYLTRANSFERASE 1)第25-27页
     ·CMT3(Chromomethylase 3)第27-28页
     ·DRM(domains rearranged methylase)第28页
     ·DDM1(decrease in DNA methylation1)第28-31页
     ·DDM1 与DNA甲基化及MET1 的相互作用第31-32页
   ·研究目标和主要研究内容第32-34页
     ·研究目标第32-33页
     ·主要研究内容第33-34页
   ·研究技术路线第34-35页
第二章 落叶松体细胞胚发生过程中DNA甲基化水平变化分析第35-54页
   ·材料与方法第35-39页
     ·实验材料第35-36页
     ·主要试剂第36页
     ·方法第36-39页
   ·实验结果第39-49页
     ·DNA提取及检测结果第39页
     ·双酶切结果第39-40页
     ·预扩增结果第40页
     ·筛选引物第40-41页
     ·条带统计与分析第41页
     ·体细胞胚发生时期对应总甲基化率的变化情况第41-45页
     ·甲基化率的离差分析第45-49页
   ·讨论第49-52页
     ·与胚发育相关的DNA甲基化第49-50页
     ·与位点有关的DNA甲基化第50-51页
     ·DNA复制中的甲基化缺失机制第51-52页
     ·其他影响DNA甲基化的因素第52页
   ·小结第52-54页
第三章 落叶松体细胞胚胎发生过程中DNA甲基化模式变化分析第54-67页
   ·材料与方法第54-57页
     ·实验材料第54-55页
     ·主要试剂及配制第55-56页
     ·差异条带回收测序第56-57页
   ·实验结果第57-64页
     ·相邻两时期的甲基化模式比较第57-60页
     ·与原胚团时期相比甲基化模式变化分析第60-64页
   ·讨论第64-66页
     ·落叶松体细胞胚胎发生过程中存在着频繁的甲基化和去甲基化事件第64-65页
     ·与原胚团时期相比,各体细胞胚胎发生时期也存在着频繁的超甲基化和去甲基化事件第65页
     ·差异条带回收结果第65-66页
   ·小结第66-67页
第四章 落叶松体细胞胚DNA甲基转移酶MET1 全长cDNA克隆与系统进化分析第67-87页
   ·材料与方法第67-75页
     ·实验材料第67-68页
     ·实验方法第68-75页
   ·实验结果第75-84页
     ·RNA提取第75-76页
     ·UBQ验证反转录结果第76页
     ·MET1 基因特异片段分析第76-77页
     ·3' RACE和5' RACE扩增结果第77-78页
     ·序列拼接与比对结果第78-84页
   ·讨论第84-85页
     ·反转录结果验证方法第84页
     ·菌液PCR快速鉴定第84页
     ·DNA甲基转移酶基因MET1 的分离方法第84-85页
     ·DNA甲基转移酶基因MET1 的序列同源性第85页
   ·小结第85-87页
第五章 落叶松体细胞胚染色质重塑因子DDM1 全长cDNA克隆与系统进化分析第87-94页
   ·材料与方法第87-89页
     ·实验材料第87页
     ·实验方法第87-89页
   ·实验结果第89-92页
     ·5' RACE结果第89页
     ·序列拼接与ORF查找第89-90页
     ·蛋白序列比对结果第90-91页
       ·PFAM蛋白结构预测第90页
       ·CDD蛋白结构域预测第90-91页
     ·系统进化树构建第91-92页
   ·讨论第92页
     ·搜索SSH差减文库发现与DNA甲基化相关的基因片段第92页
     ·DDM1 与MET1 的相互作用研究第92页
   ·小结第92-94页
     ·落叶松DDM1 蛋白结构域预测第92-93页
     ·DDM1 系统进化树构建第93-94页
第六章 结论第94-96页
   ·结论第94页
   ·创新点第94-95页
   ·展望第95-96页
参考文献第96-103页
附录A 缩略词第103-105页
附录B 回收差异片段的详细信息第105-108页
在读期间的学术研究第108-109页
致谢第109页

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