| 个人简历 | 第3-8页 |
| 中文摘要 | 第8-12页 |
| 英文摘要 | 第12-18页 |
| 前言 | 第18-28页 |
| 参考文献 | 第26-28页 |
| 第一部分 基于大数据膀胱癌核心lncRNA的临床价值及部分验证 | 第28-84页 |
| 前言 | 第28-31页 |
| 1 材料和方法 | 第31-39页 |
| 1.1 测序数据来源及处理工具 | 第31-32页 |
| 1.2 获取膀胱癌中的差异表达lncRNAs(DELs) | 第32-33页 |
| 1.3 用DELs构建预后风险评分 | 第33-34页 |
| 1.4 使用其他数据集验证膀胱癌预后DELs的表达情况 | 第34-35页 |
| 1.5 预后DELs的功能分析 | 第35页 |
| 1.6 低风险和高风险组的差异表达基因的潜在机制 | 第35-36页 |
| 1.7 DELs与邻近蛋白质编码基因之间的关系 | 第36页 |
| 1.8 基于细胞系和膀胱癌组织的四种DELs和 HIST4H4 的表达水平的内部验证 | 第36-39页 |
| 2 结果 | 第39-72页 |
| 2.1 膀胱癌中的DELs | 第39-42页 |
| 2.2 基于DELs构建预后风险评分模型 | 第42-51页 |
| 2.3 使用其他数据验证四个DELs在膀胱癌中的临床意义 | 第51-55页 |
| 2.4 使用细胞系和临床膀胱癌组织样品检测四种DELs的表达 | 第55-56页 |
| 2.5 与预后DELs共表达的基因网络 | 第56-59页 |
| 2.6 低风险评分组和高风险评分组之间膀胱癌中差异表达基因(DEGs)的获取和功能评估 | 第59-66页 |
| 2.7 预后相关DEL AC010168.2 潜在的生物学功能分析 | 第66-72页 |
| 3 讨论 | 第72-76页 |
| 4 结论 | 第76-78页 |
| 参考文献 | 第78-84页 |
| 第二部分 snoRNA在膀胱癌中的差异表达及SCARNA12 的临床意义和相关基因网络研究 | 第84-131页 |
| 前言 | 第84-87页 |
| 1 材料和方法 | 第87-94页 |
| 1.1 测序数据来源及处理工具 | 第87-88页 |
| 1.2 数据标准化处理及统计分析 | 第88页 |
| 1.3 细胞系及组织水平验证挖掘snoRNA结果 | 第88-90页 |
| 1.4 SCARNA12 功能分析 | 第90-91页 |
| 1.5 原位杂交实验 | 第91-94页 |
| 2 结果 | 第94-123页 |
| 2.1 膀胱癌中差异表达的小分子RNA | 第94页 |
| 2.2 膀胱癌中snoRNA表达及差异表达谱的实验验证 | 第94-104页 |
| 2.3 SCARNA12 挖掘和功能分析 | 第104-121页 |
| 2.4 原位杂交实验 | 第121-123页 |
| 3 讨论 | 第123-128页 |
| 4 结论 | 第128-129页 |
| 参考文献 | 第129-131页 |
| 第三部分 SCARNA12 对膀胱癌细胞生物学功能的影响 | 第131-187页 |
| 前言 | 第131-132页 |
| 1 材料和方法 | 第132-170页 |
| 1.1 SCARNA12 CRISPR-CAS9 质粒载体构建 | 第132-153页 |
| 1.2 GRNAZ质粒转染T24 细胞并筛选验证 | 第153-157页 |
| 1.3 QPCR验证单克隆细胞的SCARNA12和PHB2 表达量 | 第157-161页 |
| 1.4 细胞实验 | 第161-167页 |
| 1.5 动物实验 | 第167-170页 |
| 2 结果 | 第170-182页 |
| 2.1 细胞实验结果 | 第170-181页 |
| 2.2 裸鼠成瘤实验结果 | 第181-182页 |
| 3 讨论 | 第182-184页 |
| 4 结论 | 第184-185页 |
| 参考文献 | 第185-187页 |
| 第四部分 SCARNA12 在膀胱癌中的潜在互作蛋白及信号通路调节研究 | 第187-241页 |
| 前言 | 第187-188页 |
| 1 实验材料和方法 | 第188-204页 |
| 1.1 测序材料 | 第188-189页 |
| 1.2 数据处理方法 | 第189-194页 |
| 1.3 RNA纯化染色质分离技术检测SCARNA12 结合 | 第194-202页 |
| 1.4 转录调控结合分析 | 第202-204页 |
| 2 结果 | 第204-235页 |
| 2.1 测序数据上游分析结果 | 第204-206页 |
| 2.2 下游DEGS分析 | 第206-218页 |
| 2.3 整合分析 | 第218-223页 |
| 2.4 CHIRP结果 | 第223-228页 |
| 2.5 BART分析结果 | 第228-235页 |
| 3 讨论 | 第235-238页 |
| 4 结论 | 第238-239页 |
| 参考文献 | 第239-241页 |
| 第五部分 膀胱癌中SCARNA12 与可变剪接事件的关系研究 | 第241-274页 |
| 前言 | 第241-243页 |
| 1 材料和方法 | 第243页 |
| 2 分析方法 | 第243-245页 |
| 2.1 分析软件及环境 | 第243页 |
| 2.2 数据展示 | 第243-244页 |
| 2.3 统计分析 | 第244页 |
| 2.4 功能预测分析 | 第244-245页 |
| 3 结果 | 第245-268页 |
| 3.1 测序数据的SCARNA12 的可变剪接分析 | 第245-253页 |
| 3.2 组织水平SCARNA12 表达相关可变剪接事件 | 第253-255页 |
| 3.3 SCARNA12 可能影响膀胱癌的可变剪接事件 | 第255-258页 |
| 3.4 全面回顾膀胱癌组织中MRNA剪接事件 | 第258-260页 |
| 3.5 膀胱癌生存预后相关的可变剪接事件功能分析 | 第260-268页 |
| 4 讨论 | 第268-270页 |
| 5 结论 | 第270-272页 |
| 参考文献 | 第272-274页 |
| 全文讨论 | 第274-276页 |
| 综述 | 第276-297页 |
| 参考文献 | 第292-297页 |
| 附录 | 第297-302页 |
| 一、中英文缩略语对照表 | 第297-299页 |
| 二、补充表格和图片 | 第299-302页 |
| 致谢 | 第302-305页 |
| 攻读学位期间发表的学术论文 | 第305-308页 |
