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利用CRISPR-Cas9技术构建RBM24基因敲除小鼠胚胎干细胞系

摘要第4-6页
Abstract第6-8页
第一章 前言第15-43页
    1.1 心脏的发生及调控机制第15-23页
        1.1.1 心脏的结构与功能第15-23页
            1.1.1.1 心脏的发生及调控第15-17页
            1.1.2.1 心管、心脏循环的发生与调控第17-18页
            1.1.2.2 心室的发生及调控第18页
            1.1.2.3 心房的发生及调控第18-19页
            1.1.2.4 心肌增殖及调控第19页
            1.1.2.5 心脏瓣膜的发生及调控第19页
            1.1.2.6 心脏与血管的连接第19-20页
            1.1.2.7 心脏疾病及治疗方法第20-23页
    1.2 胚胎干细胞向心肌细胞的分化及调控第23-26页
        1.2.1 胚胎干细胞的概况第23-24页
        1.2.2 胚胎干细胞向心肌细胞的分化过程第24-26页
    1.3 RNA结合蛋白(RNA BNDING PROTEIN)第26-36页
        1.3.1 RNA结合蛋白的结构和功能第26-27页
        1.3.2 RBM24基因第27-34页
            1.3.2.1 RBM24基因的结构第28-30页
            1.3.2.2 RBM24基因的功能第30页
            1.3.2.3 RBM24基因调控MicroRNA第30页
            1.3.2.4 RBM24调控斑马鱼和小鼠的心脏发育第30-32页
            1.3.2.5 RBM24调控ESC分化第32-33页
            1.3.2.6 RBM24可作为剪接因子发挥功能第33-34页
        1.3.3 RBM24基因与其他基因的相互作用第34-36页
            1.3.3.1 RBM24基因与p21基因第34-35页
            1.3.3.2 RBM24基因与p63基因第35页
            1.3.3.3 RBM24基因与MYOG基因第35-36页
    1.4 Crisprcas9第36-43页
        1.4.1 现阶段的基因编辑技术第37页
        1.4.2 CRISPR-Cas9的发现与发展第37-38页
        1.4.3 Ⅱ型CRISPR-Cas9系统第38-39页
        1.4.4 由CRISPR-Cas9介导的基因组编辑技术第39页
        1.4.5 引导RNA的选择第39-40页
        1.4.6 目标DNA序列的设计第40页
        1.4.7 Cas9与gRNA转染细胞策略第40-41页
        1.4.8 提高目标特异性的策略第41页
        1.4.9 CRISPR-Cas9基因组编辑技术的应用与拓展第41-43页
第二章 材料与方法第43-67页
    2.1 实验材料第43-44页
        2.1.1 细胞株第43页
        2.1.2 感受态和表达载体质粒第43页
        2.1.3 实验小鼠第43页
        2.1.4 PCR和qPCR引物第43-44页
    2.2 主要仪器和耗材第44-45页
    2.3 主要试剂第45-48页
    2.4 实验内容与方法第48-67页
        2.4.1 真核基因表达质粒的构建第48-56页
            2.4.1.1 细胞的总RNA提取第48-49页
            2.4.1.2 RNA反转录合成cDNA模板第49页
            2.4.1.3 以cDNA为模板扩增目的基因第49-50页
            2.4.1.4 PCR产物琼脂糖凝胶跑胶电泳第50-51页
            2.4.1.5 从PCR产物中回收目的片段第51-52页
            2.4.1.6 DNA限制性内切酶酶切DNA片段和载体片段第52页
            2.4.1.7 从酶切产物中回收DNA第52-53页
            2.4.1.8 载体去磷酸化处理第53-54页
            2.4.1.9 目的片段和载体的连接第54页
            2.4.1.10 连接物的转化第54-55页
            2.4.1.11 质粒小量提取第55-56页
        2.4.2 原代小鼠胚胎成纤维细胞(MEF)的制备第56-57页
        2.4.3 细胞培养第57-60页
            2.4.3.1 细胞复苏第57-58页
            2.4.3.1 细胞传代第58-59页
            2.4.3.2 细胞冻存第59页
            2.4.3.3 细胞计数第59-60页
            2.4.3.5 小鼠胚胎干细胞mESCs的分化第60页
        2.4.4 细胞转染第60-62页
            2.4.4.1 PEI转染法第60-61页
            2.4.4.2 电转染法第61-62页
        2.4.5 Western Blot免疫印迹分析第62-64页
            2.4.5.1 细胞内总蛋白提取第62页
            2.4.5.2 BCA法检测蛋白浓度第62-63页
            2.4.5.3 Western Blot免疫印迹第63-64页
        2.4.6 细胞免疫荧光染色第64-65页
        2.4.7 实时荧光定量PCR (qRT-PCR)第65-66页
        2.4.8 RNA-seq分析第66-67页
第三章 结果分析第67-86页
    3.1 双gRNA引导的人源RBM24的敲除第67-69页
    3.2 cas9的构建第69-70页
    3.3 载体的测序以及对HEK-293FT转染成功第70-71页
    3.4 对HEK-293T细胞RNA结合蛋白RBM24的exon1敲除检测第71-73页
    3.5 对敲除的片段进行测序验证第73-74页
    3.6 构建适用于小鼠胚胎干细胞敲除RBM24的PX458M (PX459M)第74-75页
    3.7 探究小鼠胚胎干细胞的分化过程中RBM24的表达变化情况第75-76页
    3.8 通过流式细胞术分选Cas9阳性细胞第76-77页
    3.9 对分选出细胞进行初步的鉴定第77-79页
    3.10 对流式细胞术分选出来的细胞进一步纯化第79-80页
    3.11 对敲除后的细胞进行后续干性检测第80-82页
    3.12 敲除RNA结合蛋白RBM24后对小鼠胚胎干细胞分化的影响第82-83页
    3.13 RBM24敲除的小鼠胚胎心脏数据分析第83-86页
第四章 结果讨论第86-89页
第五章 结论第89-90页
参考文献第90-93页
致谢第93页

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