| 摘要 | 第4-6页 |
| Abstract | 第6-7页 |
| 1 绪论 | 第12-25页 |
| 1.1 引言 | 第12页 |
| 1.2 芜菁介绍 | 第12-14页 |
| 1.3 花青素合成与调控的研究进展 | 第14-21页 |
| 1.3.1 花青素的生物合成途径简介 | 第14-17页 |
| 1.3.2 表观遗传和环境因素影响花青素合成研究进展 | 第17-19页 |
| 1.3.3 UV-A诱导芜菁花青素合成特性 | 第19-21页 |
| 1.4 突变体库构建及花青素合成相关突变体研究进展 | 第21-22页 |
| 1.5 高通量测序技术研究进展 | 第22-24页 |
| 1.6 研究的目的及意义 | 第24-25页 |
| 2 不同短波光诱导下津田芜菁差异表达基因的RNA-seq数据分析 | 第25-42页 |
| 2.1 引言 | 第25页 |
| 2.2 材料与方法 | 第25-29页 |
| 2.2.1 数据库 | 第25页 |
| 2.2.2 数据软件 | 第25页 |
| 2.2.3 实验光源 | 第25-26页 |
| 2.2.4 试验试剂及仪器 | 第26页 |
| 2.2.5 试验方法 | 第26-29页 |
| 2.3 结果与分析 | 第29-39页 |
| 2.3.1 不同短波光诱导下芜菁基因群表达模式分析 | 第29-30页 |
| 2.3.2 不同短波光诱导下芜菁差异表达基因挖掘 | 第30-31页 |
| 2.3.3 不同短波光诱导下芜菁差异表达基因的Gene Ontology (GO)富集分析 | 第31-32页 |
| 2.3.4 芜菁花青素合成途径、光信号途径和ROS途径相关基因的聚类分析 | 第32-36页 |
| 2.3.5 芜菁花青素合成途径及其共表达途径基因的表达分析 | 第36-39页 |
| 2.4 讨论 | 第39-41页 |
| 2.5 本章小结 | 第41-42页 |
| 3 EMS诱变全紫色突变体R15的鉴定、遗传分析与基因定位 | 第42-68页 |
| 3.1 引言 | 第42页 |
| 3.2 材料与方法 | 第42-45页 |
| 3.2.1 试验材料 | 第42页 |
| 3.2.2 试验光源 | 第42-43页 |
| 3.2.3 试验试剂及仪器 | 第43页 |
| 3.2.4 试验方法 | 第43-45页 |
| 3.3 结果与分析 | 第45-65页 |
| 3.3.1 野生型津田芜菁与EMS诱变全紫色突变体R15的表型分析 | 第45-46页 |
| 3.3.2 HPLC比较分析野生型津田芜菁与EMS诱变全紫色突变体R15中花青素类化合物组成成分 | 第46-48页 |
| 3.3.3 EMS诱变全紫色突变体R15根表皮花青素合成途径相关基因的表达分析 | 第48-49页 |
| 3.3.4 EMS诱变全紫色突变体R15回交群体的构建及遗传分析 | 第49-51页 |
| 3.3.5 EMS诱变全紫色突变体R15的BC3F2群体中突变型后代和野生型亲本的DNA提取及高通量测序 | 第51-52页 |
| 3.3.6 高通量测序数据质量控制及数据分析 | 第52-56页 |
| 3.3.7 MutMap分析 | 第56-61页 |
| 3.3.8 突变候选基因注释 | 第61-62页 |
| 3.3.9 筛选鉴定的SNP突变位点的测序验证 | 第62-64页 |
| 3.3.10 比较分析突变基因PIP5K6在光照条件与黑暗条件下的表达变化 | 第64页 |
| 3.3.11 EMS全紫色突变体R15与不同来源的全白色突变体中PIP5K6基因表达比较分析 | 第64-65页 |
| 3.4 讨论 | 第65-67页 |
| 3.5 本章小结 | 第67-68页 |
| 4 EMS诱变全白色突变体W68的鉴定、遗传分析与基因定位 | 第68-89页 |
| 4.1 引言 | 第68页 |
| 4.2 材料与方法 | 第68-72页 |
| 4.2.1 试验材料 | 第68页 |
| 4.2.2 试验光源 | 第68页 |
| 4.2.3 试验试剂及仪器 | 第68-69页 |
| 4.2.4 试验方法 | 第69-72页 |
| 4.3 结果与分析 | 第72-87页 |
| 4.3.1 野生型津田芜菁与EMS诱变全白色突变体W68的表型分析 | 第72页 |
| 4.3.2 TILLING方法筛选鉴定花青素合成途径相关基因的突变 | 第72-74页 |
| 4.3.3 EMS诱变全白色突变体W68回交群体的构建及遗传分析 | 第74-75页 |
| 4.3.4 EMS诱变全白色突变体W68根表皮花青素合成途径相关基因表达分析 | 第75-77页 |
| 4.3.5 EMS诱变全白色突变体W68的BC3F2群体中突变型后代和野生型亲本DNA提取和高通量测序 | 第77-78页 |
| 4.3.6 高通量测序数据质量控制及数据分析 | 第78-81页 |
| 4.3.7 MutMap分析 | 第81-83页 |
| 4.3.8 突变候选基因注释 | 第83-84页 |
| 4.3.9 候选SNP突变位点的测序验证 | 第84-85页 |
| 4.3.10 比较分析突变基因AAR2同源蛋白基因在野生型与突变体中的表达变化 | 第85-86页 |
| 4.3.11 W68与不同来源的突变体中AAR2同源蛋白基因的基因表达比较分析 | 第86-87页 |
| 4.4 讨论 | 第87-88页 |
| 4.5 本章小结 | 第88-89页 |
| 结论 | 第89-90页 |
| 参考文献 | 第90-98页 |
| 附录 | 第98-107页 |
| 攻读学位期间发表的学术论文 | 第107-108页 |
| 致谢 | 第108-110页 |
| 附件 | 第110-111页 |
