基于一种图方法识别转录因子结合位点
| 摘要 | 第1-5页 |
| Abstract | 第5-8页 |
| 引言 | 第8-9页 |
| 第一章 绪论 | 第9-13页 |
| ·生物信息学 | 第9-10页 |
| ·课题背景 | 第10页 |
| ·国内外研究现状 | 第10-11页 |
| ·本文主要研究工作 | 第11-12页 |
| ·本章小结 | 第12-13页 |
| 第二章 转录因子结合位点识别方法简介 | 第13-19页 |
| ·引言 | 第13页 |
| ·基于共调控基因启动子序列的方法 | 第13-17页 |
| ·基于单词的方法 | 第13-14页 |
| ·概率算法 | 第14-16页 |
| ·机器学习算法 | 第16页 |
| ·其他算法 | 第16-17页 |
| ·集成方法 | 第17页 |
| ·基于系统发生足迹的方法 | 第17-18页 |
| ·基于共调控基因的启动子序列和系统发生足迹的方法 | 第18页 |
| ·本章小结 | 第18-19页 |
| 第三章 背景知识简介 | 第19-22页 |
| ·位置频率矩阵 | 第19-20页 |
| ·似然比检验 | 第20-21页 |
| ·马尔科夫模型 | 第21页 |
| ·信息含量 | 第21页 |
| ·本章小结 | 第21-22页 |
| 第四章 基于图的方法识别TFBS | 第22-27页 |
| ·引言 | 第22页 |
| ·寻找核 | 第22-24页 |
| ·建图 | 第22-23页 |
| ·搜索子图 | 第23-24页 |
| ·似然比检验 | 第24-25页 |
| ·合并 | 第25页 |
| ·扩展模式 | 第25-26页 |
| ·排序 | 第26页 |
| ·本章小结 | 第26-27页 |
| 第五章 算法实现和结果分析 | 第27-36页 |
| ·引言 | 第27页 |
| ·算法实现 | 第27-31页 |
| ·实验数据 | 第27-31页 |
| ·实验环境 | 第31页 |
| ·对比实验 | 第31页 |
| ·性能参数 | 第31页 |
| ·结果分析 | 第31-35页 |
| ·实验结果 | 第31-34页 |
| ·结果对比 | 第34-35页 |
| ·本章小结 | 第35-36页 |
| 总结 | 第36-37页 |
| 参考文献 | 第37-40页 |
| 致谢 | 第40-41页 |
| 在学期间公开发表论文及著作情况 | 第41页 |
