| 摘要 | 第3-4页 |
| Abstract | 第4页 |
| 引言 | 第6-8页 |
| 1 基本理论 | 第8-14页 |
| 1.1 肽简介 | 第8页 |
| 1.2 蛋白质的结构 | 第8-9页 |
| 1.3 ABEEMσπ方法 | 第9-11页 |
| 1.4 分子力场方法（MM） | 第11-12页 |
| 1.5 ABEEMσπ/MM方法 | 第12-13页 |
| 1.6 从头算方法 | 第13-14页 |
| 2 应用ABEEMσπ/MM方法计算一些有机分子及寡肽分子的总能量 | 第14-38页 |
| 2.1 应用ABEEMσπ/MM方法计算一些有机分子的总能量 | 第14-31页 |
| 2.1.1 环烷烃分子的总能量 | 第14-18页 |
| 2.1.2 醇类分子的总能量 | 第18-23页 |
| 2.1.3 醛类分子的总能量 | 第23-27页 |
| 2.1.4 酸类分子的总能量 | 第27-30页 |
| 2.1.5 小结 | 第30-31页 |
| 2.2 应用ABEEMσπ/MM方法计算寡肽分子的总能量 | 第31-38页 |
| 2.2.1 模型分子的命名及的价态能量参数的确定 | 第31-33页 |
| 2.2.2 在反β-折叠构象下寡肽分子的总能量 | 第33-35页 |
| 2.2.3 在α-右手螺旋构象下寡肽分子的总能量 | 第35-36页 |
| 2.2.4 小结 | 第36-38页 |
| 3 从头算MP2方法与ABEEMσπ/MM方法计算分子总能量所用时间比较及新旧标号的对比 | 第38-41页 |
| 3.1 从头算MP2方法与ABEEMσπ/MM方法计算分子总能量所用时间比较 | 第38-39页 |
| 3.2 新旧标号的对比 | 第39-41页 |
| 结论 | 第41-42页 |
| 参考文献 | 第42-45页 |
| 攻读硕士学位期间发表学术论文情况 | 第45-46页 |
| 致谢 | 第46页 |
