中文摘要 | 第4-6页 |
Abstract | 第6-7页 |
缩略词 | 第8-14页 |
第一章 文献综述 | 第14-29页 |
1 空肠弯曲菌的生物学性状 | 第14-20页 |
1.1 弯曲菌分类 | 第14页 |
1.2 形态特性 | 第14-15页 |
1.3 培养特性 | 第15页 |
1.4 生化特性 | 第15页 |
1.5 空肠弯曲菌的流行病学特征 | 第15-16页 |
1.6 禽源空肠弯曲菌的污染现状 | 第16-19页 |
1.6.1 国外禽源空肠弯曲菌的污染现状 | 第16-17页 |
1.6.2 国内禽源空肠弯曲菌的污染现状 | 第17-19页 |
1.7 空肠弯曲菌的检测方法 | 第19-20页 |
1.7.1 细菌培养法 | 第19页 |
1.7.2 空肠弯曲菌和结肠弯曲菌的多重PCR鉴定 | 第19-20页 |
2 空肠弯曲菌分型方法的研究进展 | 第20-24页 |
2.1 多位点序列分型(MLST) | 第20-21页 |
2.2 脉冲场凝胶电泳分型(PFGE) | 第21页 |
2.3 肠杆菌保守基因重复序列分型(ERIC-PCR) | 第21-22页 |
2.4 限制片段长度多态性(RFLP) | 第22-23页 |
2.5 随机扩增多态性分析(RAPD) | 第23页 |
2.6 各种分型方法的比较 | 第23-24页 |
3 空肠弯曲菌毒力因子的研究进展 | 第24-28页 |
3.1 对人的致病性 | 第24-25页 |
3.2 与粘附、侵袭有关的毒力因子 | 第25-27页 |
3.2.1 鞭毛蛋白flaA | 第25页 |
3.2.2 纤连结合蛋白cadF | 第25页 |
3.2.3 磷脂酶活性蛋白基因pldA | 第25-26页 |
3.2.4 粘附蛋白(PEB1A) | 第26页 |
3.2.5 粘附定植相关基因racR | 第26页 |
3.2.6 趋化蛋白cheY、cheW | 第26-27页 |
3.2.7 侵袭蛋白ciaB和iamA | 第27页 |
3.2.8 pVir质粒 | 第27页 |
3.3 空肠弯曲菌的外毒素 | 第27页 |
3.4 空肠弯曲菌的内毒素 | 第27-28页 |
3.5 热休克蛋白dnaJ和grpE | 第28页 |
4 研究的目的意义 | 第28-29页 |
第二章 禽源空肠弯曲菌的分离鉴定 | 第29-42页 |
1 材料与方法 | 第29-33页 |
1.1 材料 | 第29-31页 |
1.1.1 样品 | 第29-30页 |
1.1.2 培养基和主要试剂 | 第30页 |
1.1.3 试验仪器与设备 | 第30-31页 |
1.2 方法 | 第31-33页 |
1.2.1 样品采集与运输 | 第31页 |
1.2.3 分离纯化 | 第31页 |
1.2.4 保种 | 第31页 |
1.2.5 多重PCR鉴定 | 第31-32页 |
1.2.6 生化鉴定 | 第32-33页 |
1.3 空肠弯曲菌分离率统计 | 第33页 |
1.4 数据分析 | 第33页 |
2 结果 | 第33-39页 |
2.1 细菌形态 | 第33-34页 |
2.2 多重PCR鉴定 | 第34-35页 |
2.3 生化鉴定 | 第35-36页 |
2.4 空肠弯曲菌的分离结果 | 第36-39页 |
2.4.1 不同场空肠弯曲菌的分离情况 | 第36-37页 |
2.4.2 不同动物空肠弯曲菌的分离情况 | 第37-38页 |
2.4.3 不同养殖方式空肠弯曲菌的分离情况 | 第38页 |
2.4.4 不同地区空肠弯曲菌的分离情况 | 第38-39页 |
2.4.5 不同样本来源空肠弯曲菌的分离情况 | 第39页 |
3 讨论 | 第39-41页 |
3.1 禽源空肠弯曲菌的分离情况 | 第39页 |
3.2 不同动物、地区、养殖方式及样本来源分离率的差异 | 第39-41页 |
4 小结 | 第41-42页 |
第三章 空肠弯曲菌的ERIC-PCR及MLST分型 | 第42-65页 |
1 材料 | 第42-43页 |
1.1 菌株 | 第42页 |
1.2 试剂及器材 | 第42-43页 |
2 方法 | 第43-45页 |
2.1 ERIC-PCR分型 | 第43-44页 |
2.1.1 ERIC-PCR引物 | 第43页 |
2.1.2 ERIC-PCR扩增 | 第43页 |
2.1.3 ERIC-PCR分型重复性试验 | 第43页 |
2.1.4 ERIC-PCR指纹图谱分析 | 第43-44页 |
2.2 MLST分型 | 第44-45页 |
2.2.1 引物 | 第44-45页 |
2.2.3 ST(sequence type)型确定 | 第45页 |
2.2.4 遗传进化分析 | 第45页 |
3 结果与分析 | 第45-61页 |
3.1 ERIC-PCR分型结果 | 第45-52页 |
3.1.1 ERIC-PCR分型重复性结果 | 第45-47页 |
3.1.2 ERIC-PCR对48株空肠弯曲菌分型 | 第47页 |
3.1.3 ERIC-PCR聚类分析 | 第47-49页 |
3.1.4 各地区市场和养殖场空肠弯曲菌的类型分布 | 第49-52页 |
3.2 MLST分型 | 第52-56页 |
3.2.1 MLST扩增 | 第52页 |
3.2.2 MLST分型结果与分析 | 第52-56页 |
3.3 MLST分型和ERIC-PCR分型的比较 | 第56页 |
3.4 空肠弯曲菌的遗传进化分析 | 第56-61页 |
4 讨论 | 第61-64页 |
4.1 ERIC-PCR分型 | 第61-62页 |
4.2 MLST分型 | 第62-63页 |
4.3 空肠弯曲菌ERIC-PCR和MLST分型比较分析 | 第63-64页 |
5 小结 | 第64-65页 |
第四章 空肠弯曲菌的的毒力相关基因检测 | 第65-74页 |
1 材料 | 第65页 |
1.1 菌株 | 第65页 |
1.2 试剂及仪器 | 第65页 |
2 方法 | 第65-67页 |
2.1 毒力基因引物设计 | 第65-67页 |
2.2 毒力基因扩增 | 第67页 |
2.3 统计学分析 | 第67页 |
3 结果 | 第67-71页 |
3.1 毒力相关基因扩增结果 | 第67-68页 |
3.2 空肠弯曲菌分离株毒力相关基因分析 | 第68-71页 |
3.2.1 空肠弯曲菌分离株毒力基因总体检出情况 | 第68页 |
3.2.2 不同地点毒力相关基因检出情况 | 第68-69页 |
3.2.3 不同动物毒力相关基因的检出情况 | 第69-70页 |
3.2.4 不同养殖方式毒力相关基因检出情况 | 第70-71页 |
4 讨论 | 第71-73页 |
5 小结 | 第73-74页 |
结论 | 第74-75页 |
参考文献 | 第75-86页 |
致谢 | 第86-87页 |
附录 | 第87-88页 |
研究生期间发表的论文及取得的成果 | 第88页 |