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四川部分地区禽源空肠弯曲菌的分离鉴定、分子分型及毒力相关基因检测

中文摘要第4-6页
Abstract第6-7页
缩略词第8-14页
第一章 文献综述第14-29页
    1 空肠弯曲菌的生物学性状第14-20页
        1.1 弯曲菌分类第14页
        1.2 形态特性第14-15页
        1.3 培养特性第15页
        1.4 生化特性第15页
        1.5 空肠弯曲菌的流行病学特征第15-16页
        1.6 禽源空肠弯曲菌的污染现状第16-19页
            1.6.1 国外禽源空肠弯曲菌的污染现状第16-17页
            1.6.2 国内禽源空肠弯曲菌的污染现状第17-19页
        1.7 空肠弯曲菌的检测方法第19-20页
            1.7.1 细菌培养法第19页
            1.7.2 空肠弯曲菌和结肠弯曲菌的多重PCR鉴定第19-20页
    2 空肠弯曲菌分型方法的研究进展第20-24页
        2.1 多位点序列分型(MLST)第20-21页
        2.2 脉冲场凝胶电泳分型(PFGE)第21页
        2.3 肠杆菌保守基因重复序列分型(ERIC-PCR)第21-22页
        2.4 限制片段长度多态性(RFLP)第22-23页
        2.5 随机扩增多态性分析(RAPD)第23页
        2.6 各种分型方法的比较第23-24页
    3 空肠弯曲菌毒力因子的研究进展第24-28页
        3.1 对人的致病性第24-25页
        3.2 与粘附、侵袭有关的毒力因子第25-27页
            3.2.1 鞭毛蛋白flaA第25页
            3.2.2 纤连结合蛋白cadF第25页
            3.2.3 磷脂酶活性蛋白基因pldA第25-26页
            3.2.4 粘附蛋白(PEB1A)第26页
            3.2.5 粘附定植相关基因racR第26页
            3.2.6 趋化蛋白cheY、cheW第26-27页
            3.2.7 侵袭蛋白ciaB和iamA第27页
            3.2.8 pVir质粒第27页
        3.3 空肠弯曲菌的外毒素第27页
        3.4 空肠弯曲菌的内毒素第27-28页
        3.5 热休克蛋白dnaJ和grpE第28页
    4 研究的目的意义第28-29页
第二章 禽源空肠弯曲菌的分离鉴定第29-42页
    1 材料与方法第29-33页
        1.1 材料第29-31页
            1.1.1 样品第29-30页
            1.1.2 培养基和主要试剂第30页
            1.1.3 试验仪器与设备第30-31页
        1.2 方法第31-33页
            1.2.1 样品采集与运输第31页
            1.2.3 分离纯化第31页
            1.2.4 保种第31页
            1.2.5 多重PCR鉴定第31-32页
            1.2.6 生化鉴定第32-33页
        1.3 空肠弯曲菌分离率统计第33页
        1.4 数据分析第33页
    2 结果第33-39页
        2.1 细菌形态第33-34页
        2.2 多重PCR鉴定第34-35页
        2.3 生化鉴定第35-36页
        2.4 空肠弯曲菌的分离结果第36-39页
            2.4.1 不同场空肠弯曲菌的分离情况第36-37页
            2.4.2 不同动物空肠弯曲菌的分离情况第37-38页
            2.4.3 不同养殖方式空肠弯曲菌的分离情况第38页
            2.4.4 不同地区空肠弯曲菌的分离情况第38-39页
            2.4.5 不同样本来源空肠弯曲菌的分离情况第39页
    3 讨论第39-41页
        3.1 禽源空肠弯曲菌的分离情况第39页
        3.2 不同动物、地区、养殖方式及样本来源分离率的差异第39-41页
    4 小结第41-42页
第三章 空肠弯曲菌的ERIC-PCR及MLST分型第42-65页
    1 材料第42-43页
        1.1 菌株第42页
        1.2 试剂及器材第42-43页
    2 方法第43-45页
        2.1 ERIC-PCR分型第43-44页
            2.1.1 ERIC-PCR引物第43页
            2.1.2 ERIC-PCR扩增第43页
            2.1.3 ERIC-PCR分型重复性试验第43页
            2.1.4 ERIC-PCR指纹图谱分析第43-44页
        2.2 MLST分型第44-45页
            2.2.1 引物第44-45页
            2.2.3 ST(sequence type)型确定第45页
            2.2.4 遗传进化分析第45页
    3 结果与分析第45-61页
        3.1 ERIC-PCR分型结果第45-52页
            3.1.1 ERIC-PCR分型重复性结果第45-47页
            3.1.2 ERIC-PCR对48株空肠弯曲菌分型第47页
            3.1.3 ERIC-PCR聚类分析第47-49页
            3.1.4 各地区市场和养殖场空肠弯曲菌的类型分布第49-52页
        3.2 MLST分型第52-56页
            3.2.1 MLST扩增第52页
            3.2.2 MLST分型结果与分析第52-56页
        3.3 MLST分型和ERIC-PCR分型的比较第56页
        3.4 空肠弯曲菌的遗传进化分析第56-61页
    4 讨论第61-64页
        4.1 ERIC-PCR分型第61-62页
        4.2 MLST分型第62-63页
        4.3 空肠弯曲菌ERIC-PCR和MLST分型比较分析第63-64页
    5 小结第64-65页
第四章 空肠弯曲菌的的毒力相关基因检测第65-74页
    1 材料第65页
        1.1 菌株第65页
        1.2 试剂及仪器第65页
    2 方法第65-67页
        2.1 毒力基因引物设计第65-67页
        2.2 毒力基因扩增第67页
        2.3 统计学分析第67页
    3 结果第67-71页
        3.1 毒力相关基因扩增结果第67-68页
        3.2 空肠弯曲菌分离株毒力相关基因分析第68-71页
            3.2.1 空肠弯曲菌分离株毒力基因总体检出情况第68页
            3.2.2 不同地点毒力相关基因检出情况第68-69页
            3.2.3 不同动物毒力相关基因的检出情况第69-70页
            3.2.4 不同养殖方式毒力相关基因检出情况第70-71页
    4 讨论第71-73页
    5 小结第73-74页
结论第74-75页
参考文献第75-86页
致谢第86-87页
附录第87-88页
研究生期间发表的论文及取得的成果第88页

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