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中国沿海地区副溶血弧菌流行病学调查及遗传多样性分析

摘要第5-7页
abstract第7-9页
第一章 文献综述第12-24页
    1.1 副溶血弧菌的概况第12-17页
        1.1.1 副溶血弧菌第12-13页
        1.1.2 副溶血弧菌的毒力第13-16页
        1.1.3 副溶血弧菌的耐药情况第16页
        1.1.4 副溶血弧菌的检测方法第16-17页
    1.2 副溶血弧菌的多位点序列分型第17-18页
    1.3 副溶血弧菌的遗传多样性第18-19页
    1.4 高通量测序技术在副溶血弧菌中的应用第19-20页
    1.5 细菌中重要的移动元件第20-22页
        1.5.1 质粒第20页
        1.5.2 插入序列第20-21页
        1.5.3 基因岛第21-22页
    1.6 课题目的和意义第22页
    1.7 技术路线第22-24页
第二章 实验材料和方法第24-40页
    2.1 实验材料第24-26页
        2.1.1 菌株和质粒第24页
        2.1.2 所用仪器设备和试剂第24-26页
    2.2 实验方法第26-40页
        2.2.1 样品采集和弧菌的分离纯化和鉴定第26页
        2.2.2 提取副溶血弧菌基因组第26-28页
        2.2.3 毒力基因的检测第28-29页
        2.2.4 最小抑菌浓度测定第29-30页
        2.2.5 MLST分型第30-32页
        2.2.6 高通量测序及生物信息学方法第32-34页
        2.2.7 副溶血弧菌攻毒实验第34-35页
        2.2.8 基因克隆第35-38页
        2.2.9 副溶血弧菌的生长曲线和传代实验第38-40页
第三章 实验结果第40-68页
    3.1 副溶血弧菌快速检测方法的建立第40-42页
    3.2 副溶血弧菌在不同采样点的分布特征第42-43页
    3.3 副溶血弧菌毒力基因分布特点第43-44页
    3.4 副溶血弧菌耐药水平分析第44-45页
    3.5 我国沿海地区副溶血弧菌的遗传多样性分析第45-50页
        3.5.1 通过ST型证明副溶血弧菌遗传多样性第45-47页
        3.5.2 通过亲缘关系分析证明副溶血弧菌遗传多样性第47-50页
    3.6 移动元件对副溶血弧菌遗传多样性的影响第50-60页
        3.6.1 质粒和转座子介导的pirAB的传播第50-52页
        3.6.2 插入序列导致的看家基因的丢失第52-56页
        3.6.3 基因岛的插入破坏recA基因第56-60页
    3.7 副溶血弧菌的传代实验证明ISVal1具有插入活性第60-64页
        3.7.1 质粒的选择和改造结果第60-61页
        3.7.2 不同盐度和温度对副溶血弧菌生长的影响第61-62页
        3.7.3 传代实验证明ISVal1可以插入到染色体上第62-64页
    3.8 攻毒实验验证pirAB和tc-like毒力第64-68页
第四章 分析与讨论第68-70页
第五章 结论与展望第70-72页
参考文献第72-80页
致谢第80-82页
作者简介第82页

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