摘要 | 第5-7页 |
abstract | 第7-9页 |
第一章 文献综述 | 第12-24页 |
1.1 副溶血弧菌的概况 | 第12-17页 |
1.1.1 副溶血弧菌 | 第12-13页 |
1.1.2 副溶血弧菌的毒力 | 第13-16页 |
1.1.3 副溶血弧菌的耐药情况 | 第16页 |
1.1.4 副溶血弧菌的检测方法 | 第16-17页 |
1.2 副溶血弧菌的多位点序列分型 | 第17-18页 |
1.3 副溶血弧菌的遗传多样性 | 第18-19页 |
1.4 高通量测序技术在副溶血弧菌中的应用 | 第19-20页 |
1.5 细菌中重要的移动元件 | 第20-22页 |
1.5.1 质粒 | 第20页 |
1.5.2 插入序列 | 第20-21页 |
1.5.3 基因岛 | 第21-22页 |
1.6 课题目的和意义 | 第22页 |
1.7 技术路线 | 第22-24页 |
第二章 实验材料和方法 | 第24-40页 |
2.1 实验材料 | 第24-26页 |
2.1.1 菌株和质粒 | 第24页 |
2.1.2 所用仪器设备和试剂 | 第24-26页 |
2.2 实验方法 | 第26-40页 |
2.2.1 样品采集和弧菌的分离纯化和鉴定 | 第26页 |
2.2.2 提取副溶血弧菌基因组 | 第26-28页 |
2.2.3 毒力基因的检测 | 第28-29页 |
2.2.4 最小抑菌浓度测定 | 第29-30页 |
2.2.5 MLST分型 | 第30-32页 |
2.2.6 高通量测序及生物信息学方法 | 第32-34页 |
2.2.7 副溶血弧菌攻毒实验 | 第34-35页 |
2.2.8 基因克隆 | 第35-38页 |
2.2.9 副溶血弧菌的生长曲线和传代实验 | 第38-40页 |
第三章 实验结果 | 第40-68页 |
3.1 副溶血弧菌快速检测方法的建立 | 第40-42页 |
3.2 副溶血弧菌在不同采样点的分布特征 | 第42-43页 |
3.3 副溶血弧菌毒力基因分布特点 | 第43-44页 |
3.4 副溶血弧菌耐药水平分析 | 第44-45页 |
3.5 我国沿海地区副溶血弧菌的遗传多样性分析 | 第45-50页 |
3.5.1 通过ST型证明副溶血弧菌遗传多样性 | 第45-47页 |
3.5.2 通过亲缘关系分析证明副溶血弧菌遗传多样性 | 第47-50页 |
3.6 移动元件对副溶血弧菌遗传多样性的影响 | 第50-60页 |
3.6.1 质粒和转座子介导的pirAB的传播 | 第50-52页 |
3.6.2 插入序列导致的看家基因的丢失 | 第52-56页 |
3.6.3 基因岛的插入破坏recA基因 | 第56-60页 |
3.7 副溶血弧菌的传代实验证明ISVal1具有插入活性 | 第60-64页 |
3.7.1 质粒的选择和改造结果 | 第60-61页 |
3.7.2 不同盐度和温度对副溶血弧菌生长的影响 | 第61-62页 |
3.7.3 传代实验证明ISVal1可以插入到染色体上 | 第62-64页 |
3.8 攻毒实验验证pirAB和tc-like毒力 | 第64-68页 |
第四章 分析与讨论 | 第68-70页 |
第五章 结论与展望 | 第70-72页 |
参考文献 | 第72-80页 |
致谢 | 第80-82页 |
作者简介 | 第82页 |