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人与小鼠脑组织转录组基因表达与功能比较研究及多巴胺D5受体与胃泌素受体在促尿钠排泄中的协同互作研究

摘要第8-11页
ABSTRACT第11-15页
第一部分 人与小鼠前额叶皮层、海马及纹状体转录组基因表达及功能比较分析第16-86页
    摘要第16-18页
    ABSTRACT第18-21页
    前言第21-24页
    材料与方法第24-39页
        1. 实验材料第24-30页
            1.1 GEO数据库第24-25页
            1.2 Affymetrix基因芯片第25-27页
            1.3 Expression Console软件第27-28页
            1.4 聚类分析算法第28页
            1.5 String数据库第28-29页
            1.6 MCODE网络模块挖掘算法第29页
            1.7 DAVID基因功能富集分析软件第29页
            1.8 人与小鼠PFC、HIP及STR组织第29-30页
            1.9 主要试剂和仪器第30页
        2. 实验方法第30-39页
            2.1 转录组芯片数据收集第30-31页
            2.2 相对高表达基因鉴定及功能富集分析第31-32页
            2.3 人与小鼠脑组织同源基因表达模式评估第32页
            2.4 物种特异表达的同源基因挖掘第32-33页
            2.5 特异表达同源基因实验验证第33-37页
            2.6 DEHGN构建第37页
            2.7 网络拓扑性质及hub节点分析第37-38页
            2.8 功能调控网络模块挖掘第38-39页
    结果第39-73页
        1. 人与小鼠脑组织转录组表达谱数据第39-41页
            1.1 人PFC、HIP和STR转录组表达谱第39-40页
            1.2 小鼠PFC、HIP和STR转录组表达谱第40-41页
        2. 人与小鼠脑组织高表达基因功能富集分析第41-48页
            2.1 人与小鼠PFC高表达基因生物功能第41-44页
            2.2 人与小鼠HIP高表达基因生物功能第44-46页
            2.3 人与小鼠STR高表达基因生物功能第46-48页
        3. 人与小鼠脑组织高表达基因功能比较第48-53页
            3.1 人与小鼠脑组织高表达基因显著富集的BP比较第49-52页
            3.2 人与小鼠脑组织高表达基因显著富集的KEGG通路比较第52-53页
        4. 人与小鼠同源脑组织基因表达模式分析第53-56页
        5. 物种特定脑组织特异表达的同源基因第56-59页
        6. 人脑组织DEHGN第59-73页
            6.1 人PFC DEHGN第59-63页
            6.2 人HIP DEHGN第63-68页
            6.3 人STR DEHGN第68-73页
    讨论第73-77页
    总结第77-78页
    参考文献第78-86页
第二部分 人与小鼠海马组织miRNA表达及功能比较分析第86-158页
    摘要第86-88页
    ABSTRACT第88-91页
    前言第91-95页
    材料与方法第95-110页
        1. 实验材料第95-99页
            1.1 人与小鼠海马组织第95页
            1.2 主要试剂和仪器第95页
            1.3 短序列分析包SOAP第95-96页
            1.4 常见miRNA数据库及靶基因分析软件第96-98页
            1.5 miRNA生物功能分析软件DIANA-miRPath第98-99页
            1.6 基因功能富集分析软件DAVID第99页
        2. 实验方法第99-110页
            2.1 脑组织总RNA提取第99页
            2.2 小RNA测序实验流程第99-100页
            2.3 测序碱基质量评估第100-101页
            2.4 原始Reads预处理第101页
            2.5 序列比对与注释第101-102页
            2.6 miRNA表达数据标准化第102页
            2.7 miRNA表达谱质量评估第102-103页
            2.8 变异系数分析第103页
            2.9 新miRNA鉴定第103-104页
            2.10 新鉴定的miRNA功能预测第104页
            2.11 富集表达的miRNA分析第104-105页
            2.12 物种特异表达的miRNA分析第105页
            2.13 同源miRNA表达模式评估第105页
            2.14 差异表达的同源miRNA分析第105-106页
            2.15 qRT-PCR实验验证第106-108页
            2.16 人海马差异表达的miRNA-mRNA功能调控网络构建第108-109页
            2.17 miRNA-mRNA功能调控网络功能分析第109-110页
    结果第110-145页
        1. 人与小鼠海马组织基本信息第110页
        2. 小RNA测序原始数据基本情况第110-113页
        3. 人与小鼠海马小RNA片段匹配情况及长度分布第113-115页
        4. miRNA表达谱质量第115-116页
        5. 人与小鼠海马小RNA种类及丰度比较第116-117页
        6. 新miRNA鉴定第117-127页
        7. 人与小鼠海马组织富集表达的miRNA分布及功能第127-131页
        8. 人与小鼠海马表达的miRNA家族比较第131-134页
        9. 人与小鼠海马同源miRNA表达模式保守第134-136页
        10. 人与小鼠海马差异表达的同源miRNA第136-139页
        11. 人海马差异表达的miRNA-mRNA功能调控网络第139-145页
    讨论第145-148页
    总结第148-149页
    参考文献第149-158页
第三部分 多巴胺D5受体与胃泌素受体相互作用及其促尿钠排泄效应研究第158-192页
    摘要第158-160页
    ABSTRACT第160-162页
    前言第162-163页
    材料与方法第163页
    1. 实验材料第163-166页
        1.1 细胞及实验动物第163页
        1.2 主要试剂第163页
        1.3 主要溶液配制第163-166页
        1.4 主要仪器设备第166页
    2. 实验方法第166-170页
        2.1 细胞培养第166-167页
        2.2 细胞共转染第167页
        2.3 免疫印迹第167页
        2.4 逆转录PCR及实时荧光定量PCR第167-168页
        2.5 cAMP浓度检测第168页
        2.6 免疫共沉淀第168页
        2.7 免疫荧光共定位第168-169页
        2.8 血压检测第169页
        2.9 钠排泄检测第169页
        2.10 统计分析第169-170页
    结果第170-183页
        1. D5R与CCKBR在HK-2细胞中协同互作第170-171页
        2. HK-2细胞多巴胺受体功能正常第171-172页
        3. D5R与CCKBR在NT细胞中协同互作第172-173页
        4. D5R与CCKBR相互作用特异性验证第173-176页
        5. D5R与CCKBR直接或间接互作第176-177页
        6. CCKB~(-/-)小鼠血压第177-178页
        7. D5R与CCKBR在BALB/c小鼠肾脏互作第178-180页
        8. CCKBR~(-/-)小鼠的尿钠排泄情况第180页
        9. D5R与CCKBR互作和尿钠排泄第180-183页
    讨论第183-185页
    总结第185-186页
    参考文献第186-192页
文献综述第192-210页
    参考文献第202-210页
缩略词汇第210-211页
个人简历第211-213页
致谢第213-214页

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