摘要 | 第8-11页 |
ABSTRACT | 第11-15页 |
第一部分 人与小鼠前额叶皮层、海马及纹状体转录组基因表达及功能比较分析 | 第16-86页 |
摘要 | 第16-18页 |
ABSTRACT | 第18-21页 |
前言 | 第21-24页 |
材料与方法 | 第24-39页 |
1. 实验材料 | 第24-30页 |
1.1 GEO数据库 | 第24-25页 |
1.2 Affymetrix基因芯片 | 第25-27页 |
1.3 Expression Console软件 | 第27-28页 |
1.4 聚类分析算法 | 第28页 |
1.5 String数据库 | 第28-29页 |
1.6 MCODE网络模块挖掘算法 | 第29页 |
1.7 DAVID基因功能富集分析软件 | 第29页 |
1.8 人与小鼠PFC、HIP及STR组织 | 第29-30页 |
1.9 主要试剂和仪器 | 第30页 |
2. 实验方法 | 第30-39页 |
2.1 转录组芯片数据收集 | 第30-31页 |
2.2 相对高表达基因鉴定及功能富集分析 | 第31-32页 |
2.3 人与小鼠脑组织同源基因表达模式评估 | 第32页 |
2.4 物种特异表达的同源基因挖掘 | 第32-33页 |
2.5 特异表达同源基因实验验证 | 第33-37页 |
2.6 DEHGN构建 | 第37页 |
2.7 网络拓扑性质及hub节点分析 | 第37-38页 |
2.8 功能调控网络模块挖掘 | 第38-39页 |
结果 | 第39-73页 |
1. 人与小鼠脑组织转录组表达谱数据 | 第39-41页 |
1.1 人PFC、HIP和STR转录组表达谱 | 第39-40页 |
1.2 小鼠PFC、HIP和STR转录组表达谱 | 第40-41页 |
2. 人与小鼠脑组织高表达基因功能富集分析 | 第41-48页 |
2.1 人与小鼠PFC高表达基因生物功能 | 第41-44页 |
2.2 人与小鼠HIP高表达基因生物功能 | 第44-46页 |
2.3 人与小鼠STR高表达基因生物功能 | 第46-48页 |
3. 人与小鼠脑组织高表达基因功能比较 | 第48-53页 |
3.1 人与小鼠脑组织高表达基因显著富集的BP比较 | 第49-52页 |
3.2 人与小鼠脑组织高表达基因显著富集的KEGG通路比较 | 第52-53页 |
4. 人与小鼠同源脑组织基因表达模式分析 | 第53-56页 |
5. 物种特定脑组织特异表达的同源基因 | 第56-59页 |
6. 人脑组织DEHGN | 第59-73页 |
6.1 人PFC DEHGN | 第59-63页 |
6.2 人HIP DEHGN | 第63-68页 |
6.3 人STR DEHGN | 第68-73页 |
讨论 | 第73-77页 |
总结 | 第77-78页 |
参考文献 | 第78-86页 |
第二部分 人与小鼠海马组织miRNA表达及功能比较分析 | 第86-158页 |
摘要 | 第86-88页 |
ABSTRACT | 第88-91页 |
前言 | 第91-95页 |
材料与方法 | 第95-110页 |
1. 实验材料 | 第95-99页 |
1.1 人与小鼠海马组织 | 第95页 |
1.2 主要试剂和仪器 | 第95页 |
1.3 短序列分析包SOAP | 第95-96页 |
1.4 常见miRNA数据库及靶基因分析软件 | 第96-98页 |
1.5 miRNA生物功能分析软件DIANA-miRPath | 第98-99页 |
1.6 基因功能富集分析软件DAVID | 第99页 |
2. 实验方法 | 第99-110页 |
2.1 脑组织总RNA提取 | 第99页 |
2.2 小RNA测序实验流程 | 第99-100页 |
2.3 测序碱基质量评估 | 第100-101页 |
2.4 原始Reads预处理 | 第101页 |
2.5 序列比对与注释 | 第101-102页 |
2.6 miRNA表达数据标准化 | 第102页 |
2.7 miRNA表达谱质量评估 | 第102-103页 |
2.8 变异系数分析 | 第103页 |
2.9 新miRNA鉴定 | 第103-104页 |
2.10 新鉴定的miRNA功能预测 | 第104页 |
2.11 富集表达的miRNA分析 | 第104-105页 |
2.12 物种特异表达的miRNA分析 | 第105页 |
2.13 同源miRNA表达模式评估 | 第105页 |
2.14 差异表达的同源miRNA分析 | 第105-106页 |
2.15 qRT-PCR实验验证 | 第106-108页 |
2.16 人海马差异表达的miRNA-mRNA功能调控网络构建 | 第108-109页 |
2.17 miRNA-mRNA功能调控网络功能分析 | 第109-110页 |
结果 | 第110-145页 |
1. 人与小鼠海马组织基本信息 | 第110页 |
2. 小RNA测序原始数据基本情况 | 第110-113页 |
3. 人与小鼠海马小RNA片段匹配情况及长度分布 | 第113-115页 |
4. miRNA表达谱质量 | 第115-116页 |
5. 人与小鼠海马小RNA种类及丰度比较 | 第116-117页 |
6. 新miRNA鉴定 | 第117-127页 |
7. 人与小鼠海马组织富集表达的miRNA分布及功能 | 第127-131页 |
8. 人与小鼠海马表达的miRNA家族比较 | 第131-134页 |
9. 人与小鼠海马同源miRNA表达模式保守 | 第134-136页 |
10. 人与小鼠海马差异表达的同源miRNA | 第136-139页 |
11. 人海马差异表达的miRNA-mRNA功能调控网络 | 第139-145页 |
讨论 | 第145-148页 |
总结 | 第148-149页 |
参考文献 | 第149-158页 |
第三部分 多巴胺D5受体与胃泌素受体相互作用及其促尿钠排泄效应研究 | 第158-192页 |
摘要 | 第158-160页 |
ABSTRACT | 第160-162页 |
前言 | 第162-163页 |
材料与方法 | 第163页 |
1. 实验材料 | 第163-166页 |
1.1 细胞及实验动物 | 第163页 |
1.2 主要试剂 | 第163页 |
1.3 主要溶液配制 | 第163-166页 |
1.4 主要仪器设备 | 第166页 |
2. 实验方法 | 第166-170页 |
2.1 细胞培养 | 第166-167页 |
2.2 细胞共转染 | 第167页 |
2.3 免疫印迹 | 第167页 |
2.4 逆转录PCR及实时荧光定量PCR | 第167-168页 |
2.5 cAMP浓度检测 | 第168页 |
2.6 免疫共沉淀 | 第168页 |
2.7 免疫荧光共定位 | 第168-169页 |
2.8 血压检测 | 第169页 |
2.9 钠排泄检测 | 第169页 |
2.10 统计分析 | 第169-170页 |
结果 | 第170-183页 |
1. D5R与CCKBR在HK-2细胞中协同互作 | 第170-171页 |
2. HK-2细胞多巴胺受体功能正常 | 第171-172页 |
3. D5R与CCKBR在NT细胞中协同互作 | 第172-173页 |
4. D5R与CCKBR相互作用特异性验证 | 第173-176页 |
5. D5R与CCKBR直接或间接互作 | 第176-177页 |
6. CCKB~(-/-)小鼠血压 | 第177-178页 |
7. D5R与CCKBR在BALB/c小鼠肾脏互作 | 第178-180页 |
8. CCKBR~(-/-)小鼠的尿钠排泄情况 | 第180页 |
9. D5R与CCKBR互作和尿钠排泄 | 第180-183页 |
讨论 | 第183-185页 |
总结 | 第185-186页 |
参考文献 | 第186-192页 |
文献综述 | 第192-210页 |
参考文献 | 第202-210页 |
缩略词汇 | 第210-211页 |
个人简历 | 第211-213页 |
致谢 | 第213-214页 |