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荔枝组织特异表达基因分析及叶片特异启动子的分离与鉴定

摘要第4-5页
Abstract第5-6页
1 引言第10-19页
    1.1 转录组测序(RNA-seq)技术及其应用研究进展第10-12页
        1.1.1 转录组及RNA-seq概述第10页
        1.1.2 转录组测序技术应用研究进展第10-12页
        1.1.3 荔枝转录组研究进展第12页
    1.2 启动子分类及研究进展第12-15页
        1.2.1 组成型启动子第12-13页
        1.2.2 诱导型启动子第13页
        1.2.3 组织特异性启动子第13-15页
    1.3 荔枝基因及启动子研究进展第15-16页
        1.3.1 荔枝基因研究进展第15页
        1.3.2 荔枝基因启动子研究进展第15-16页
    1.4 转基因转化方法的研究进展第16-17页
        1.4.1 基因枪法第16页
        1.4.2 农杆菌介导法第16-17页
        1.4.3 花粉管通道法第17页
    1.5 研究目的及意义第17-18页
    1.6 研究内容第18-19页
2 材料与基本实验操作第19-21页
    2.1 材料、试剂与仪器第19-21页
        2.1.1 植物材料第19页
        2.1.2 转录组数据获得及分析第19页
        2.1.3 克隆载体和实验菌株第19页
        2.1.4 酶和试剂第19-20页
        2.1.5 引物合成及测序第20页
        2.1.6 实验仪器第20页
        2.1.7 试剂配制第20-21页
3 方法第21-35页
    3.1 转录组数据分析第21页
    3.2 实时荧光定量PCR验证第21-27页
        3.2.1 荧光定量PCR引物设计第22页
        3.2.2 荔枝RNA提取第22-23页
        3.2.3 cDNA第一链的合成第23-24页
        3.2.4 PCR克隆组织特异表达基因第24页
        3.2.5 PCR产物回收第24-25页
        3.2.6 回收产物连接和转化第25页
        3.2.7 提取质粒第25-26页
        3.2.8 实时荧光定量PCR标准品的构建方法第26页
        3.2.9 实时荧光定量PCR(RT-PCR)反应第26-27页
    3.3 启动子克隆与植物表达载体的构建第27-30页
        3.3.1 提取荔枝基因组DNA(改良CTAB法)第27页
        3.3.2 启动子及LcTLP基因克隆第27-28页
        3.3.3 表达载体的构建第28-30页
        3.3.4 连接目的片段第30页
        3.3.5 酶切验证第30页
    3.4 基因枪瞬时表达验证第30-32页
        3.4.1 质粒提取第30-31页
        3.4.2 微弹制备第31页
        3.4.3 基因枪轰击材料第31页
        3.4.4 GUS组织化学染色第31-32页
    3.5 表达载体通过农杆菌介导花粉管侵入法转化荔枝第32-35页
        3.5.1 制备农杆菌感受态第32页
        3.5.2 冻融法转化农杆菌第32页
        3.5.3 花粉管导入法第32-33页
        3.5.4 实验操作第33页
        3.5.5 转基因植株的检测第33-35页
4 结果与分析第35-61页
    4.1 转录组分析结果第35-46页
        4.1.1 表达分析第35-36页
        4.1.2 GO分析和KEGG分析结果第36-46页
    4.2 实时荧光定量PCR检测结果第46-50页
        4.2.1 荔枝各组织RNA的提取以及反转录检测第46-47页
        4.2.2 RT-PCR引物的溶解曲线分析第47-48页
        4.2.3 标准曲线绘制第48-49页
        4.2.4 九个基因在荔枝不同组织中的表达第49-50页
    4.3 荔枝LcFKBP16-2与LcGRX基因的生物信息学分析第50-51页
    4.4 启动子及LcTLP基因克隆第51页
    4.5 启动子序列调控元件分析第51-56页
    4.6 植物表达载体的构建第56页
    4.7 基因枪瞬时检测第56-57页
    4.8 花粉管导入法阳性植株检测第57-61页
5 讨论第61-63页
    5.1 关于组织特异表达基因功能和代谢通路分析第61页
    5.2 启动子结构元件与功能的关系第61页
    5.3 荔枝转基因转化方法的研究第61-63页
6 结论第63-64页
参考文献第64-69页
缩略语表第69-70页
致谢第70页

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