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苹果抗轮纹病品种鉴定及SA诱导后抗病差异表达基因的RNA-Seq分析

摘要第2-6页
Summary第6-10页
第一章 文献综述第13-37页
    1.1 苹果轮纹病的研究概况第13-18页
        1.1.1 苹果轮纹病病原菌研究第14页
        1.1.2 苹果轮纹病的发生与危害第14-15页
        1.1.3 苹果轮纹病菌的生物学特性及侵染规律第15-17页
        1.1.4 苹果轮纹病的防控技术第17-18页
    1.2 寄主与病原菌的互作机制第18-23页
        1.2.1 病原菌对寄主的致病途径第19-20页
        1.2.2 寄主对病原菌的抗病途径第20-23页
    1.3 植物抗病机制研究进展第23-28页
        1.3.1 植物抗病基因第24页
        1.3.2 病原菌致病基因第24-25页
        1.3.3 病程相关蛋白第25-28页
    1.4 苹果树抗病育种第28-30页
        1.4.1 苹果抗病育种第28-29页
        1.4.2 苹果抗轮纹病种质资源的鉴定和评价第29-30页
    1.5 水杨酸在系统获得抗性研究中的应用第30-34页
    1.6 转录组学研究第34-36页
    1.7 选题目的和意义第36-37页
第二章 中国主要苹果种质资源对轮纹病的抗性鉴定第37-48页
    2.1 材料与方法第37-39页
        2.1.1 材料第37页
        2.1.2 人工接种方法第37-38页
        2.1.3 人工接种调查与抗病性评价第38页
        2.1.4 田间自然发病调查第38-39页
    2.2 结果与分析第39-45页
        2.2.1 人工接种试验结果第39-41页
        2.2.2 不同苹果品种对枝干轮纹病的抗性鉴定第41-45页
    2.3 讨论第45-46页
    2.4 结论第46-48页
第三章 SA诱导对苹果抗性相关酶活性的影响分析第48-59页
    3.1 材料与方法第48-49页
        3.1.1 植物材料和处理第48页
        3.1.2 测定方法第48-49页
    3.2 结果分析第49-56页
        3.2.1 苯丙氨酸解氨酶(PAL)活性分析第49-51页
        3.2.2 过氧化物酶(POD)活性分析第51-53页
        3.2.3 β-1,3-葡聚糖酶活性分析第53-55页
        3.2.4 多酚氧化酶(PPO)活性分析第55-56页
    3.3 讨论第56-57页
    3.4 结论第57-59页
第四章 SA诱导苹果抗病相关基因的RNA-seq差异表达分析第59-92页
    4.1 材料与方法第60-66页
        4.1.1 植物材料和处理第60页
        4.1.2 样品准备第60页
        4.1.3 总RNA提取与质量检测第60页
        4.1.4 cDNA文库构建和Illumina HiSeq ~(TM)2500 测序第60-61页
        4.1.5 数据基本处理与分析第61页
        4.1.6 RNA-Seq整体质量评估第61-62页
        4.1.7 基因表达分析第62页
        4.1.8 差异表达分析第62-63页
        4.1.9 基因功能注释第63页
        4.1.10 数据个性化分析第63-66页
    4.2 结果与分析第66-88页
        4.2.1 样品总RNA的质量检测第66-68页
        4.2.2 测序结果统计第68页
        4.2.3 RNA-Seq整体质量评估结果第68-69页
        4.2.4 不同苹果基因型差异基因分析(未处理)第69-73页
        4.2.5 不同苹果基因型SA诱导后差异基因分析(SA处理)第73-76页
        4.2.6 同一苹果基因型SA诱导前后差异基因分析第76-84页
        4.2.7 苯丙烷氨类代谢途径第84-85页
        4.2.8 水杨酸信号途径第85-86页
        4.2.9 实时荧光定量PCR验证第86-88页
    4.3 讨论第88-89页
    4.4 结论第89-92页
第五章 结论与讨论第92-98页
    5.1 结论第92-95页
    5.2 讨论第95-98页
参考文献第98-114页
致谢第114-115页
个人简介第115-116页
导师简介第116-117页

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