| 致谢 | 第4-5页 |
| 摘要 | 第5-11页 |
| 第一章 文献综述 | 第11-31页 |
| 1 悬铃木的研究进展 | 第11-15页 |
| 1.1 悬铃木的特性 | 第11-13页 |
| 1.2 悬铃木新品种的培育 | 第13-14页 |
| 1.3 悬铃木的抗逆性 | 第14-15页 |
| 1.4 悬铃木的价值 | 第15页 |
| 2 转录组学的研究进展 | 第15-19页 |
| 2.1 转录组学的定义 | 第15页 |
| 2.2 转录组学的研究方法 | 第15-17页 |
| 2.2.1 新一代测序技术 | 第16-17页 |
| 2.2.2 新一代测序下数字化基因表达谱技术 | 第17页 |
| 2.3 转录组学的研究应用 | 第17-19页 |
| 2.3.1 转录组学在植物研究领域中的应用 | 第17-18页 |
| 2.3.2 转录组学在植物抗逆分子生物学中应用 | 第18-19页 |
| 3 miRNA研究进展 | 第19-24页 |
| 3.1 miRNA的特点及作用机理 | 第19-21页 |
| 3.1.1 miRNA的特点 | 第19-20页 |
| 3.1.2 miRNA的作用机理 | 第20-21页 |
| 3.2 miRNA调控功能 | 第21-22页 |
| 3.2.1 miRNA调控植物生长发育 | 第21页 |
| 3.2.2 miRNA调节植物激素及调控信号传导过程 | 第21-22页 |
| 3.2.3 miRNA与逆境胁迫 | 第22页 |
| 3.3 miRNA研究方法 | 第22-23页 |
| 3.3.1 miRNA的鉴定 | 第22-23页 |
| 3.3.2 miRNA的表达检测技术 | 第23页 |
| 3.4 miRNA靶基因的预测和验证 | 第23-24页 |
| 4 植物铅胁迫的研究进展 | 第24-28页 |
| 4.1 铅(Pb)污染的现状 | 第24页 |
| 4.2 重金属铅胁迫对植物生长的影响及生理生化效应 | 第24-26页 |
| 4.2.1 铅胁迫对植物生长的影响 | 第24-25页 |
| 4.2.2 铅胁迫对植物光合作用的影响 | 第25页 |
| 4.2.3 铅胁迫对植物细胞膜透性的影响 | 第25-26页 |
| 4.2.4 铅胁迫对植物抗氧化酶系统的影响 | 第26页 |
| 4.2.5 铅胁迫下植物渗透调节 | 第26页 |
| 4.3 植物对铅的抗性 | 第26-28页 |
| 4.3.1 抑制重金属离子的跨膜转送 | 第27页 |
| 4.3.2 增强抗氧化系统对重金属的抗性 | 第27页 |
| 4.3.3 与植物细胞壁结合 | 第27页 |
| 4.3.4 液泡的区域化作用 | 第27-28页 |
| 4.3.5 根部富集 | 第28页 |
| 4.3.6 体外分泌物的作用 | 第28页 |
| 4.3.7 菌根作用 | 第28页 |
| 5 本研究的目的与意义 | 第28-31页 |
| 第二章 铅胁迫下悬铃木转录组研究 | 第31-51页 |
| 1 引言 | 第31页 |
| 2 材料与方法 | 第31-37页 |
| 2.1 材料 | 第31-32页 |
| 2.1.1 植物材料 | 第31页 |
| 2.1.2 主要试剂 | 第31-32页 |
| 2.1.3 主要仪器设备 | 第32页 |
| 2.2 方法 | 第32-37页 |
| 2.2.1 悬铃木总RNA的提取与检测 | 第32页 |
| 2.2.2 悬铃木转录组建库测序 | 第32-34页 |
| 2.2.3 悬铃木转录组信息分析 | 第34-37页 |
| 3 结果与分析 | 第37-50页 |
| 3.1 铅胁迫处理预试验 | 第37-38页 |
| 3.2 RNA的检测结果 | 第38页 |
| 3.3 悬铃木转录组信息分析 | 第38-42页 |
| 3.3.1 数据产出 | 第38-39页 |
| 3.3.2 Contig组装 | 第39页 |
| 3.3.3 Unigene组装 | 第39-40页 |
| 3.3.4 All-Unigene组装 | 第40-42页 |
| 3.4 All-Unigene功能分析 | 第42-50页 |
| 3.4.1 同源性比较 | 第42-43页 |
| 3.4.2 COG功能分类 | 第43-44页 |
| 3.4.3 GO功能分类 | 第44-45页 |
| 3.4.4 All-Unigene代谢通路分析 | 第45-49页 |
| 3.4.5 预测编码蛋白框(CDS) | 第49-50页 |
| 4 结论与讨论 | 第50-51页 |
| 第三章 铅胁迫悬铃木转录组的差异表达基因分析 | 第51-80页 |
| 1 引言 | 第51页 |
| 2 材料和生物信息学分析方法 | 第51-54页 |
| 2.1 材料 | 第51页 |
| 2.2 Unigene的表达量注释 | 第51页 |
| 2.3 差异表达基因的筛选 | 第51-52页 |
| 2.4 差异表达基因的qRT-PCR验证 | 第52-53页 |
| 2.5 差异Unigene的GO功能及显著性富集分析 | 第53页 |
| 2.6 差异表达Unigene的Pathway分析及其显著性富集分析 | 第53-54页 |
| 3 结果与分析 | 第54-76页 |
| 3.1 Unigene的表达量注释和差异表达基因的筛选 | 第54-59页 |
| 3.2 差异表达基因的qRT-PCR验证分析 | 第59页 |
| 3.3 差异表达Unigene GO功能显著性富集分析 | 第59-62页 |
| 3.4 差异表达基因的代谢途径富集分析 | 第62-65页 |
| 3.5 响应铅胁迫关键基因的候选 | 第65-76页 |
| 4 结论和讨论 | 第76-80页 |
| 第四章 铅胁迫对悬铃木miRNA变化的影响 | 第80-119页 |
| 1 引言 | 第80页 |
| 2 材料与方法 | 第80-85页 |
| 2.1 材料 | 第80页 |
| 2.2 方法 | 第80-85页 |
| 2.2.1 总RNA提取与检测 | 第80页 |
| 2.2.2 悬铃木sRNA建库测序 | 第80-81页 |
| 2.2.3 悬铃木sRNA信息分析 | 第81-83页 |
| 2.2.4 已知miRNA鉴定 | 第83页 |
| 2.2.5 新miRNA鉴定 | 第83页 |
| 2.2.6 miRNA差异表达分析 | 第83页 |
| 2.2.7 差异表达miRNA qRT-PCR验证 | 第83-85页 |
| 2.2.8 miRNA靶基因预测 | 第85页 |
| 3 结果与分析 | 第85-116页 |
| 3.1 sRNA库构建 | 第85-86页 |
| 3.2 sRNA文库的分类注释分析 | 第86-88页 |
| 3.3 已知miRNA的鉴定 | 第88页 |
| 3.4 新miRNA的鉴定 | 第88-102页 |
| 3.5 铅胁迫相关miRNA的表达量差异分析 | 第102页 |
| 3.6 响应铅胁迫的miRNA的qRT-PCR验证分析 | 第102-106页 |
| 3.7 铅胁迫响应的miRNA靶基因预测 | 第106-114页 |
| 3.8 靶基因GO功能分类 | 第114-116页 |
| 4 结论与讨论 | 第116-119页 |
| 4.1 sRNA库构建 | 第116页 |
| 4.2 铅胁迫响应的miRNA及其靶基因主要功能分析 | 第116-119页 |
| 第五章 主要研究结论、创新点及展望 | 第119-122页 |
| 1 主要研究结论 | 第119-120页 |
| 2 主要创新点 | 第120页 |
| 3 展望 | 第120-122页 |
| 参考文献 | 第122-137页 |
| Abstract | 第137-139页 |
| 作者简历 | 第140页 |
