摘要 | 第4-6页 |
Abstract | 第6-7页 |
1 绪论 | 第11-20页 |
1.1 草原龙胆概述 | 第11页 |
1.2 MIXTA基因的研究进展 | 第11-17页 |
1.2.1 MIXTA基因的结构及分类 | 第11-14页 |
1.2.2 MIXTA及MIXTA-like的生物学功能 | 第14-17页 |
1.3 表皮蜡质的研究进展 | 第17页 |
1.4 基于RNA-seq的转录调控研究 | 第17-18页 |
1.5 本研究的目的和意义 | 第18-20页 |
2 草原龙胆EgMIXTA1转基因植株的鉴定 | 第20-38页 |
2.1 EgMIXTA1在草原龙胆转基因及野生型植株中的表达分析 | 第20-23页 |
2.1.1 材料与试剂 | 第20页 |
2.1.2 试验方法 | 第20-22页 |
2.1.3 结果与分析 | 第22-23页 |
2.2 EgMIXTA1,EgMIXTA23,EgMIXTA47组织特异性表达 | 第23-25页 |
2.2.1 材料与试剂 | 第23页 |
2.2.2 试验方法 | 第23-24页 |
2.2.3 结果与分析 | 第24-25页 |
2.3 草原龙胆转基因植株扫描电镜观察分析及失水率试验 | 第25-27页 |
2.3.1 材料与试剂 | 第25页 |
2.3.2 试验方法 | 第25页 |
2.3.3 结果与分析 | 第25-27页 |
2.4 Western blot检测草原龙胆EgMIXTA1蛋白的表达 | 第27-30页 |
2.4.1 材料与试剂 | 第27页 |
2.4.2 试验方法 | 第27-30页 |
2.4.3 结果与分析 | 第30页 |
2.5 草原龙胆Eg MIXTA1表达载体构建及亚细胞定位 | 第30-36页 |
2.5.1 草原龙胆EgMIXTA1表达载体构建 | 第30-35页 |
2.5.2 洋葱表皮细胞亚细胞定位 | 第35-36页 |
2.6 讨论 | 第36页 |
2.7 本章小结 | 第36-38页 |
3 生信预测EgMIXTA1调控靶基因及表达分析 | 第38-47页 |
3.1 EgMIXTA1基因系统进化树构建 | 第38-40页 |
3.1.1 试验方法 | 第38页 |
3.1.2 试验结果 | 第38-40页 |
3.2 生信预测EgMIXTA1调控靶基因 | 第40-43页 |
3.2.1 试验方法 | 第40-41页 |
3.2.2 结果与分析 | 第41-43页 |
3.3 EgMIXTA1调控的预测靶基因的表达水平分析 | 第43-45页 |
3.3.1 材料与试剂 | 第43页 |
3.3.2 试验方法 | 第43-44页 |
3.3.3 结果与分析 | 第44-45页 |
3.4 讨论 | 第45页 |
3.5 本章小结 | 第45-47页 |
4 基于RNA-seq的EgMIXTA1的转录调控研究 | 第47-76页 |
4.1 材料与试剂 | 第47页 |
4.1.1 试验材料 | 第47页 |
4.1.2 试验试剂 | 第47页 |
4.2 试验方法 | 第47-51页 |
4.2.1 植物材料 | 第47页 |
4.2.2 草原龙胆样品总RNA提取及mRNA分离 | 第47-48页 |
4.2.3 草原龙胆样品mRNA片段化及cDNA片段合成 | 第48页 |
4.2.4 草原龙胆样品测序文库的构建 | 第48页 |
4.2.5 草原龙胆样品文库质检及Illumina HiSeq测序 | 第48页 |
4.2.6 草原龙胆样品序列分析 | 第48-49页 |
4.2.7 草原龙胆样品转录物功能注释及分类 | 第49页 |
4.2.8 草原龙胆样品基因结构分析 | 第49页 |
4.2.9 草原龙胆样品基因表达量分析 | 第49-50页 |
4.2.10 草原龙胆样品差异表达分析 | 第50页 |
4.2.11 草原龙胆样品差异表达基因功能注释和富集分析 | 第50页 |
4.2.12 草原龙胆样品差异表达基因表达水平验证 | 第50-51页 |
4.3 结果与分析 | 第51-72页 |
4.3.1 草原龙胆样品总RNA质量检测 | 第51-52页 |
4.3.2 草原龙胆样品测序数据及其质量控制 | 第52-54页 |
4.3.3 草原龙胆样品转录组测序数据组装 | 第54-56页 |
4.3.4 草原龙胆样品转录组测序文库质量评估 | 第56-58页 |
4.3.5 草原龙胆样品Unigene功能注释 | 第58-59页 |
4.3.6 草原龙胆样品基因结构分析 | 第59-63页 |
4.3.7 草原龙胆样品基因表达量分析 | 第63页 |
4.3.8 草原龙胆样品差异表达分析 | 第63-66页 |
4.3.9 草原龙胆样品差异表达基因功能注释和富集分析 | 第66-68页 |
4.3.10 差异表达基因KEGG注释 | 第68-69页 |
4.3.11 差异表达基因表达水平验证 | 第69-72页 |
4.4 讨论 | 第72-75页 |
4.5 本章小结 | 第75-76页 |
结论 | 第76-78页 |
参考文献 | 第78-86页 |
攻读学位期间发表的学术论文 | 第86-87页 |
致谢 | 第87-88页 |