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布朗葡萄藻A型和L型的转录组分析

致谢第5-6页
摘要第6-7页
Abstract第7页
1 绪论第13-20页
    1.1 化石燃料使用现状第13-14页
        1.1.1 化石燃料的可持续性第13页
        1.1.2 化石燃料对环境的影响第13-14页
    1.2 生物燃料第14-15页
        1.2.1 生物乙醇第14页
        1.2.2 生物柴油第14页
        1.2.3 生物燃料的影响第14-15页
    1.3 微藻与生物燃料第15-16页
        1.3.1 微藻燃料第15页
        1.3.2 微藻燃料的优点第15-16页
        1.3.3 微藻燃料的缺点第16页
        1.3.4 用于燃料生产的微藻第16页
    1.4 布朗葡萄藻第16-18页
        1.4.1 布朗葡萄藻的化学种第17页
        1.4.2 布朗葡萄藻油脂的合成代谢途径第17-18页
        1.4.3 布朗葡萄藻研究进展第18页
    1.5 研究意义第18-19页
    1.6 研究内容第19-20页
        1.6.1 A型布朗葡萄藻的转录组拼接与分析第19页
        1.6.2 L型布朗葡萄藻的转录组拼接与分析第19-20页
2 A型布朗葡萄藻转录组分析第20-44页
    2.1 研究方法第20-25页
        2.1.1 微藻培养第20-21页
        2.1.2 叶绿素含量测定第21页
        2.1.3 光合效率测定第21页
        2.1.4 荧光显微分析第21页
        2.1.5 B.braunii 779细胞油脂和碳氢化合物组成分析第21-22页
        2.1.6 基于18S rDNA序列的进化分析第22页
        2.1.7 二代测序分析第22-24页
        2.1.8 B.braunii 779转录组注释第24页
        2.1.9 基于代谢途径寻找潜在的共同调控转录的ESTs集第24页
        2.1.10 统计分析第24-25页
    2.2 结果第25-42页
        2.2.1 B.braunii 779在氮饥饿刺激下油脂及烃含量增加第25-28页
        2.2.2 B.braunii 779属于A型化学种第28-29页
        2.2.3 B.braunii 779的转录组与Coccomyxa subellipsoidea相近第29-31页
        2.2.4 779转录组与其他A型转录组存在大量同源序列第31-34页
        2.2.5 对数期细胞内涉及能量代谢的EST大量表达第34-35页
        2.2.6 氮饥饿导致photosynthesis和ribosome功能关联的EST表达量下调第35-38页
        2.2.7 氮饥饿分别诱导低表达和高表达EST上调和下调第38-39页
        2.2.8 氮饥饿时细胞对长链脂肪酸生物合成途径EST的调控第39-40页
        2.2.9 氮饥饿时细胞对角鲨烯相关的生物合成途径EST的调控第40-42页
    2.3 小结第42-44页
3 L型布朗葡萄藻转录组分析第44-65页
    3.1 研究方法第44-49页
        3.1.1 L型布朗葡萄藻的获得与培养第44-45页
        3.1.2 荧光显微分析第45页
        3.1.3 AC768碳氢化合物成分分析第45页
        3.1.4 AC768核糖体DNA进化分析第45-46页
        3.1.5 AC768转录组的de novo拼接第46-47页
        3.1.6 AC768转录组注释第47页
        3.1.7 AC768代谢途径分析第47-48页
        3.1.8 AC768中LOS-L序列PCR分析第48页
        3.1.9 统计分析第48页
        3.1.10 布朗葡萄藻化学种间转录组分析比较第48-49页
    3.2 结果第49-64页
        3.2.1 AC768在BB培养基中的细胞特征第49-51页
        3.2.2 AC768与Botryococcus braunii Songkla Nakarin亲缘相近第51-52页
        3.2.3 AC768转录组的de novo拼接第52页
        3.2.4 AC768细胞内转录最活跃的代谢途径第52-58页
        3.2.5 酶Lycopaoctaene synthase与酶squalene synthase相似第58-60页
        3.2.6 AC768中发现LOS-L蛋白序列第60-63页
        3.2.7 L型AC768与A型和B型转录组的比较第63-64页
    3.3 小结第64-65页
4 总结与展望第65-67页
    4.1 研究总结第65-66页
    4.2 展望第66-67页
参考文献第67-71页
附录第71-72页
作者简历第72页

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