| 摘要 | 第5-7页 |
| Abstract | 第7-8页 |
| 一 文献综述 | 第9-23页 |
| 1.1 引言 | 第9页 |
| 1.2 种子休眠和激素的关系 | 第9-11页 |
| 1.3 种子休眠和活性氧(reactive oxygen species,ROS)代谢的关系 | 第11-12页 |
| 1.4 植物miRNA研究进展 | 第12-22页 |
| 1.4.1 植物miRNA形成过程 | 第12-13页 |
| 1.4.2 植物miRNA作用机制 | 第13-14页 |
| 1.4.2.1 miRNA介导mRNA的剪切 | 第13页 |
| 1.4.2.2 miRNA介导的翻译抑制 | 第13-14页 |
| 1.4.2.3 miRNA介导的DNA甲基化 | 第14页 |
| 1.4.3 高通量测序技术介绍 | 第14-17页 |
| 1.4.3.1 高通量测序技术的发展 | 第14-15页 |
| 1.4.3.2 高通量测序流程简介 | 第15页 |
| 1.4.3.3 高通量测序技术的应用 | 第15-17页 |
| 1.4.3.4 第三代测序技术 | 第17页 |
| 1.4.4 miRNA的研究及其靶基因的预测 | 第17-22页 |
| 1.4.4.1 miRNA的预测鉴定 | 第17-18页 |
| 1.4.4.2 miRNA的表达水平鉴定 | 第18-19页 |
| 1.4.4.3 miRNA相关靶基因预测鉴定 | 第19-20页 |
| 1.4.4.4 miRNA相关功能分析 | 第20-22页 |
| 1.5 本研究的意义 | 第22-23页 |
| 二 材料与方法 | 第23-31页 |
| 2.1 试验材料 | 第23页 |
| 2.2 试验方法 | 第23-31页 |
| 2.2.1 豆梨种子层积和萌发率测定 | 第23页 |
| 2.2.2 豆梨种子内源激素含量测定 | 第23-24页 |
| 2.2.3 豆梨种子糖类物质测定 | 第24页 |
| 2.2.4 豆梨种子活性氧组织化学检测 | 第24-25页 |
| 2.2.5 豆梨种子总RNA提取以及测序 | 第25页 |
| 2.2.6 miRNA高通量测序分析 | 第25-27页 |
| 2.2.6.1 miRNA的种类分析 | 第25-26页 |
| 2.2.6.2 新miRNA预测 | 第26页 |
| 2.2.6.3 miRNA表达差异分析 | 第26页 |
| 2.2.6.4 差异miRNA靶基因预测及功能注释 | 第26-27页 |
| 2.2.7 实时荧光定量PCR | 第27-31页 |
| 三 结果与分析 | 第31-51页 |
| 3.1 豆梨种子休眠前后激素含量变化 | 第31-32页 |
| 3.2 豆梨种子休眠前后ROS组织染色观察 | 第32页 |
| 3.3 豆梨种子休眠前后糖类物质变化 | 第32-33页 |
| 3.4 miRNA测序分析 | 第33-50页 |
| 3.4.1 miRNA测序结果 | 第33-34页 |
| 3.4.2 Known miRNA鉴定 | 第34-37页 |
| 3.4.3 novel miRNA预测 | 第37-38页 |
| 3.4.4 miRNA表达差异分析 | 第38-44页 |
| 3.4.5 miRNA靶基因预测 | 第44-45页 |
| 3.4.6 激素代谢相关路径 | 第45-46页 |
| 3.4.7 糖代谢相关路径 | 第46-48页 |
| 3.4.8 ROS代谢相关路径 | 第48-50页 |
| 3.5 qRT-PCR验证 | 第50-51页 |
| 四 结论与讨论 | 第51-55页 |
| 4.1 种子休眠和植物激素的关系 | 第51-52页 |
| 4.2 种子休眠和ROS的关系 | 第52页 |
| 4.3 种子休眠和糖类物质代谢的关系 | 第52-53页 |
| 4.4 种子休眠和miRNA间的关系 | 第53-55页 |
| 参考文献 | 第55-62页 |
| 附录 | 第62-77页 |
| 附录Ⅰ 鉴定出的known miRNA详细信息 | 第62-67页 |
| 附录Ⅱ miRNA靶基因 | 第67-77页 |
| 致谢 | 第77-78页 |
| 攻读学位期间科研情况 | 第78-79页 |