| 中文摘要 | 第7-9页 |
| Abstract | 第9-11页 |
| 缩略词表 | 第12-14页 |
| 引言 | 第14-16页 |
| 第一部分 研究内容 | 第16-90页 |
| 第一章 果蝠冠状病毒GCCDC1鉴定及其特征性p10基因的起源和功能研究 | 第18-58页 |
| 1.1 材料和方法 | 第20-34页 |
| 1.1.1 实验材料 | 第20-23页 |
| 1.1.2 实验方法 | 第23-34页 |
| 1.2 结果 | 第34-53页 |
| 1.2.1 蝙蝠样本检测 | 第34页 |
| 1.2.2 细胞培养与病毒分离 | 第34页 |
| 1.2.3 病毒命名及全基因组测序 | 第34-35页 |
| 1.2.4 病毒全基因组分析 | 第35-41页 |
| 1.2.5 进化分析 | 第41-44页 |
| 1.2.6 呼肠孤病毒p10基因重组到Ro-BatCoV GCCDC1基因组中的证据 | 第44-47页 |
| 1.2.7 Ro-BatCoV GCCDC1亚基因组结构 | 第47-49页 |
| 1.2.8 p10基因是一个功能基因 | 第49-53页 |
| 1.3 讨论 | 第53-58页 |
| 第二章 蝙蝠冠状病毒HKU9 spike蛋白推测的受体结合结构域:Beta冠状病毒受体结合基序的进化 | 第58-80页 |
| 2.1 材料和方法 | 第60-66页 |
| 2.1.1 实验材料 | 第60-61页 |
| 2.1.2 主要实验仪器 | 第61-62页 |
| 2.1.3 实验方法 | 第62-66页 |
| 2.2 结果 | 第66-77页 |
| 2.2.1 HKU9-RBD的表达与纯化 | 第66-67页 |
| 2.2.2 HKU9 Spike蛋白结构特征及HKU9-RBD序列特点 | 第67-68页 |
| 2.2.3 HKU9-RBD与SARS-CoV及MERS-CoV受体的结合情况 | 第68-71页 |
| 2.2.4 HKU9-RBD晶体生长条件 | 第71页 |
| 2.2.5 重原子结合试验 | 第71页 |
| 2.2.6 HKU9-RBD晶体结构 | 第71-73页 |
| 2.2.7 Beta冠状病毒中RBD核心亚结构域的结构保守性 | 第73-74页 |
| 2.2.8 同源相互作用模式将外部亚结构域锚定在核心亚结构域上 | 第74-77页 |
| 2.3 讨论 | 第77-80页 |
| 第三章 云南省墨江哈尼族自治县废弃矿洞中不明原因重症肺炎事件病原学初步调查 | 第80-90页 |
| 3.1 材料和方法 | 第81-83页 |
| 3.1.1 试剂和材料 | 第81页 |
| 3.1.2 样本采集 | 第81页 |
| 3.1.3 样本处理 | 第81页 |
| 3.1.4 核酸提取 | 第81-82页 |
| 3.1.5 引物设计 | 第82-83页 |
| 3.1.6 样本检测 | 第83页 |
| 3.1.7 序列同源与进化分析 | 第83页 |
| 3.2 结果 | 第83-87页 |
| 3.2.1 样本检测 | 第83-85页 |
| 3.2.2 序列同源与进化分析 | 第85-87页 |
| 3.3 讨论 | 第87-90页 |
| 第二部分 文献综述 | 第90-126页 |
| 第四章 新发动物源性病原及其对人类的致病性 | 第92-104页 |
| 第一节 新发传染病概念及分类 | 第92页 |
| 第二节 近30年来出现的新发传染病 | 第92-95页 |
| 第三节 新发传染病频发的生态和环境因素 | 第95-99页 |
| 第四节 野生动物在新发传染病跨物种传播中的作用 | 第99-104页 |
| 第五章 蝙蝠与新发传染病 | 第104-114页 |
| 第一节 流感和冠状病毒的跨物种传播 | 第104-105页 |
| 第二节 蝙蝠的生物学和生态学特性 | 第105-109页 |
| 第三节 蝙蝠体内携带的重要病原 | 第109-111页 |
| 第四节 蝙蝠在疾病根除计划中的作用 | 第111-114页 |
| 第六章 新病毒发现技术 | 第114-126页 |
| 第一节 病毒发现的传统方法和技术 | 第114-116页 |
| 第二节 新病毒发现的分子生物学技术 | 第116-124页 |
| 简并引物PCR检测技术 | 第117-120页 |
| 差减杂交技术 | 第120-121页 |
| DNA酶处理-序列非依赖性单引物扩增技术(DNase-SISPA) | 第121-122页 |
| 以cDNA扩增片段长度多态性为基础的病毒发现(VIDISCA) | 第122-124页 |
| 第三节 宏基因组学和新一代测序技术 | 第124-126页 |
| 参考文献 | 第126-142页 |
| 全文总结 | 第142-144页 |
| 文章发表 | 第144-145页 |
| 致谢 | 第145-147页 |
