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复杂环境下蛋白质结构、功能与稳定性的NMR研究

致谢第4-6页
摘要第6-8页
ABSTRACT第8-9页
1 引言第12-33页
    1.1 蛋白质的三维结构研究第12页
    1.2 蛋白质的核磁共振研究第12-27页
        1.2.1 核磁共振基本原理第13-14页
        1.2.2 核磁共振研究蛋白质结构的主要参数第14-16页
        1.2.3 顺磁技术在蛋白质结构解析以及动态学研究中的应用第16-20页
        1.2.4 蛋白质动力学性质研究第20-23页
        1.2.5 ~(19)F核磁共振方法在生物大分子研究中的应用第23-27页
    1.3 蛋白质稳定性第27-29页
    1.4 蛋白质的环境效应第29-31页
    1.5 反胶束模型第31-33页
2 反胶束限域环境下钙调蛋白结构的NMR研究第33-60页
    2.1 引言第33-34页
    2.2 材料与方法第34-39页
        2.2.1 钙调蛋白以及MLCK多肽氨基酸序列第34页
        2.2.2 钙调蛋白样品的表达与纯化第34-37页
        2.2.3 化学试剂第37页
        2.2.4 反胶束体系以及样品制备第37页
        2.2.5 核磁共振实验以及数据分析第37-39页
    2.3 结果与讨论第39-59页
        2.3.1 CTAB反胶束包裹对钙调蛋白~1H-~(15)N HSQC谱图的影响第39-40页
        2.3.2 CTAB反胶束包裹后钙调蛋白二级结构分析第40-42页
        2.3.3 CTAB反胶束包裹后钙调蛋白后运动相关时间τ_c第42页
        2.3.4 CTAB反胶束包裹后钙调蛋白后尺寸分析第42-44页
        2.3.5 CTAB反胶束包裹后钙调蛋白后结构变化第44-48页
        2.3.6 CTAB反胶束包裹后钙调蛋白侧链指认以及NOE约束获得第48-50页
        2.3.7 CTAB反胶束包裹后钙调蛋白氢键信息第50-51页
        2.3.8 CTAB反胶束包裹后钙调蛋白结构计算以及结构分析第51-56页
        2.3.9 CTAB反胶束包裹后复合物CaM-MLCK的结构变化第56-59页
    2.4 结论第59-60页
3 反胶束限域环境下钙调蛋白动力学和功能的NMR研究第60-79页
    3.1 引言第60-61页
    3.2 材料与方法第61-64页
        3.2.1 化学试剂第61页
        3.2.2 蛋白质与多肽氨基酸序列第61-62页
        3.2.3 蛋白质的表达与纯化第62-63页
        3.2.4 多肽滴定钙调蛋白NMR实验第63-64页
    3.3 结果与讨论第64-77页
        3.3.1 CTAB反胶束中CaM主链酰胺~(15)N的弛豫数据第64-67页
        3.3.2 肌球蛋白轻链激酶MLCK与钙调蛋白相互作用第67-68页
        3.3.3 α-突触蛋白的AcN19与钙调蛋白相互作用第68-71页
        3.3.4 生长抑素Somatostatin与钙调蛋白的相互作用第71-76页
        3.3.5 生长抑素Somatostatin与TR_2C的相互作用第76-77页
        3.3.6 钙调蛋白在反胶束中的功能分析第77页
    3.4 结论第77-79页
4 蛋白质在复杂环境中折叠以及结合的热力学第79-97页
    4.1 引言第79-81页
    4.2 材料与方法第81-84页
        4.2.1 蛋白样品的制备第81-83页
        4.2.2 核磁共振实验第83-84页
    4.3 结果与讨论第84-96页
        4.3.1 KH1蛋白突变体在稀溶液的~1H-~(15)N HSQC谱图和19F谱第84-86页
        4.3.2 尿素和氧化三甲胺对KH1 S193D突变体稳定性影响第86-88页
        4.3.3 拥挤环境对KH1 S193D突变体稳定性影响第88-91页
        4.3.4 限域环境对KH1稳定性影响第91-96页
    4.4 结论第96-97页
5 总结与展望第97-99页
参考文献第99-112页
附录第112-137页
    附表A. CaM在反胶束中的~1H、~(13)C和~(15)N化学位移指认结果第112-126页
    附表B. CaM在稀溶液和反胶束中观测到~1HN的PCSs第126-129页
    附表C. CaM在稀溶液和反胶束中观测到~(15)N的PCSs第129-132页
    附表D. CaM在稀溶液和反胶束中观测到~(15)N的RDCs第132-135页
    附表E. CaM-MLCK在稀溶液和反胶束中观测的PCSs和RDCs第135-137页
作者简介及在学期间发表的学术论文与研究成果第137-138页

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