| 摘要 | 第6-8页 |
| ABSTRACT | 第8-9页 |
| 英文缩写词表 | 第16-18页 |
| 第一章 绪论 | 第18-26页 |
| 1.1 HUMAN PEGIVIRUSES(HPGVs)分类及命名 | 第18-19页 |
| 1.2 HPGV-1介绍 | 第19-22页 |
| 1.2.1 HPgV-1病毒基因组 | 第19-20页 |
| 1.2.2 HPgV-1的传播及流行 | 第20页 |
| 1.2.3 HPgV-1的检测 | 第20-21页 |
| 1.2.4 HPgV-1基因的分型和分布 | 第21页 |
| 1.2.5 HPgV-1的临床作用 | 第21-22页 |
| 1.3 HPGV-2介绍 | 第22-23页 |
| 1.4 云南省特殊地理位置 | 第23页 |
| 1.5 本论文研究的目的意义和技术路线 | 第23-26页 |
| 1.5.1 本论文研究的目的意义 | 第23-24页 |
| 1.5.2 本论文研究的技术路线 | 第24-26页 |
| 第二章 HPGV-1在云南省HIV-1感染人群中的流行性及临床作用 | 第26-42页 |
| 2.1 引言 | 第26页 |
| 2.2 材料与方法 | 第26-33页 |
| 2.2.1 样本及信息 | 第26-27页 |
| 2.2.2 试剂及耗材 | 第27页 |
| 2.2.3 扩增引物 | 第27页 |
| 2.2.4 数据分析及工具 | 第27-28页 |
| 2.2.5 方法和步骤 | 第28-32页 |
| 2.2.5.1 病毒RNA的提取 | 第28-29页 |
| 2.2.5.2 样本HPgV-1阳性检测——5'UTR巢式PCR扩增 | 第29-32页 |
| 2.2.6 数据处理 | 第32-33页 |
| 2.2.6.1 病毒cDNA核酸序列编辑加工及系统进化分析 | 第32-33页 |
| 2.2.6.2 统计分析 | 第33页 |
| 2.3 实验结果 | 第33-39页 |
| 2.3.1 HPgV-1阳性样本检测及E2基因片段扩增电泳及测序结果 | 第33页 |
| 2.3.2 流行病学及人口学特征 | 第33-35页 |
| 2.3.3 HPgV-1感染情况 | 第35-36页 |
| 2.3.4 HPgV-1基因型分布 | 第36-38页 |
| 2.3.5 HPgV-1的临床作用 | 第38-39页 |
| 2.4 讨论 | 第39-41页 |
| 2.5 本章小结 | 第41-42页 |
| 第三章 HPGV-1病毒全长基因组扩增及重组检测分析 | 第42-58页 |
| 3.1 引言 | 第42页 |
| 3.2 材料与方法 | 第42-45页 |
| 3.2.1 样品 | 第42-43页 |
| 3.2.2 试剂及耗材 | 第43页 |
| 3.2.2.1 试剂盒及试剂 | 第43页 |
| 3.2.2.2 仪器设备 | 第43页 |
| 3.2.3 扩增引物 | 第43-44页 |
| 3.2.4 数据分析及工具 | 第44页 |
| 3.2.5 方法和步骤 | 第44-45页 |
| 3.2.5.1 病毒RNA的提取 | 第44-45页 |
| 3.2.5.2 HPgV-1全长基因组各片段基因扩增 | 第45页 |
| 3.2.6 数据处理 | 第45页 |
| 3.3 实验结果 | 第45-55页 |
| 3.3.1 HPgV-1全长基因组拼接 | 第45页 |
| 3.3.2 HPgV-1系统进化分析 | 第45-51页 |
| 3.3.3 HPgV-1全长基因组基因亚型的确定 | 第51-52页 |
| 3.3.4 HPgV-1分类建议 | 第52-55页 |
| 3.3.4.1 HPgV-1基因型的鉴定 | 第53-54页 |
| 3.3.4.2 HPgV-1基因亚型的鉴定 | 第54页 |
| 3.3.4.3 HPgV-1重组形式的命名 | 第54-55页 |
| 3.4 讨论 | 第55-57页 |
| 3.5 本章小结 | 第57-58页 |
| 第四章 HPGV-2在云南省HIV-1感染人群中的流行性及病毒全长基因组分析 | 第58-69页 |
| 4.1 引言 | 第58页 |
| 4.2 材料与方法 | 第58-61页 |
| 4.2.1 样本及信息 | 第58页 |
| 4.2.2 试剂及耗材 | 第58-59页 |
| 4.2.2.1 试剂盒及试剂 | 第58页 |
| 4.2.2.2 仪器设备 | 第58-59页 |
| 4.2.3 扩增引物 | 第59-60页 |
| 4.2.4 数据分析及工具 | 第60页 |
| 4.2.5 方法和步骤 | 第60-61页 |
| 4.2.5.1 病毒RNA的提取 | 第60页 |
| 4.2.5.2 HCV筛查 | 第60-61页 |
| 4.2.5.3 HPgV-2的检测和鉴定 | 第61页 |
| 4.2.5.4 HPgV-2的全长基因组扩增 | 第61页 |
| 4.2.6 数据处理 | 第61页 |
| 4.3 实验结果 | 第61-66页 |
| 4.3.1 HCV的筛查 | 第61页 |
| 4.3.2 HPgV-2的检测和鉴定 | 第61-62页 |
| 4.3.2.1 HPgV-2的检测引物验证 | 第61-62页 |
| 4.3.2.2 HPgV-2的检测和鉴定 | 第62页 |
| 4.3.3 HPgV-2的感染情况及临床指标 | 第62-63页 |
| 4.3.4 HPgV-2全长基因组扩增及系统进化分析 | 第63-66页 |
| 4.4 讨论 | 第66-68页 |
| 4.5 本章小结 | 第68-69页 |
| 第五章 结论及展望 | 第69-73页 |
| 5.1 HPGV-1在云南省艾滋患者中的流行特点及后续传播追踪研究 | 第69-70页 |
| 5.2 HPGV-1的系统进化及遗传演变探究 | 第70-71页 |
| 5.3 HPGV-1的命名法建议及遗传数据库补充 | 第71页 |
| 5.4 HPGV-1的临床作用及对HIV-1抑制机制探究 | 第71页 |
| 5.5 HPGV-2在云南省艾滋患者中的流行性及后续检测追踪 | 第71-72页 |
| 5.6 HPGV-2的临床作用及致病性研究 | 第72页 |
| 5.7 HPGV-2的系统进化及种内种间遗传演变探究 | 第72-73页 |
| 致谢 | 第73-75页 |
| 参考文献 | 第75-80页 |
| 附录A 攻读硕士期间发表论文目录 | 第80页 |
