益生菌Lactobacillus casei Zhang全基因组序列的测定及比较分析
| 摘要 | 第1-4页 |
| Abstract | 第4-9页 |
| 1 引言 | 第9-20页 |
| ·微生物基因组学简介 | 第9-12页 |
| ·基因组学的概念 | 第9页 |
| ·微生物基因组学研究的意义和发展现状 | 第9-10页 |
| ·微生物基因组的测序策略 | 第10-11页 |
| ·微生物基因组学和生物信息学 | 第11-12页 |
| ·微生物基因组学的发展趋势 | 第12页 |
| ·乳酸菌基因组学的研究及应用 | 第12-18页 |
| ·乳酸菌概述 | 第12-13页 |
| ·乳酸菌的益生作用及评价标准 | 第13-14页 |
| ·乳酸菌基因组 | 第14-16页 |
| ·乳酸菌基因组的基本特点 | 第14-15页 |
| ·乳酸菌基因组测序策略 | 第15页 |
| ·乳酸菌基因组学研究 | 第15-16页 |
| ·L. casei Zhang 研究背景 | 第16-18页 |
| ·L. casei Zhang 的来源 | 第16-17页 |
| ·L. casei Zhang 的益生特性 | 第17页 |
| ·L. casei Zhang 的发酵特性 | 第17-18页 |
| ·L. casei Zhang 的蛋白质组学研究 | 第18页 |
| ·L. casei Zhang 的转录组学研究 | 第18页 |
| ·立题的意义与研究内容 | 第18-20页 |
| ·立题的意义 | 第18-19页 |
| ·课题的主要研究内容 | 第19-20页 |
| 2 材料和方法 | 第20-25页 |
| ·实验材料 | 第20-21页 |
| ·菌株 | 第20页 |
| ·主要试剂 | 第20页 |
| ·主要仪器与设备 | 第20-21页 |
| ·主要溶液和培养基 | 第21页 |
| ·实验方法 | 第21-25页 |
| ·菌株培养及其总 DNA 的提取 | 第21-22页 |
| ·Shot-gun 文库构建 | 第22-23页 |
| ·测序模板的制备 | 第23-24页 |
| ·克隆菌的培养 | 第23页 |
| ·模板的提取 | 第23-24页 |
| ·测序反应 | 第24页 |
| ·PCR 反应 | 第24页 |
| ·PCR 产物纯化和上机 | 第24页 |
| ·大规模测序和序列拼接 | 第24页 |
| ·基因组序列注释 | 第24-25页 |
| 3 结果与讨论 | 第25-58页 |
| ·L. casei Zhang 染色体基因组 | 第25-50页 |
| ·染色体基因组基本特点 | 第25-26页 |
| ·基因组共线性分析 | 第26-28页 |
| ·氨基酸的生物合成和蛋白水解系统 | 第28-30页 |
| ·碳水化合物代谢 | 第30-31页 |
| ·糖类转运蛋白 | 第31-36页 |
| ·肌醇代谢 | 第36-41页 |
| ·胞外多糖（EPS）合成相关基因簇 | 第41-45页 |
| ·双组分调节系统 | 第45页 |
| ·黏附蛋白 | 第45-47页 |
| ·乳酸菌素 | 第47-48页 |
| ·应激反应 | 第48-49页 |
| ·噬菌体样序列 | 第49-50页 |
| ·结论 | 第50页 |
| ·质粒基因组 | 第50-58页 |
| ·质粒基因组基本特点 | 第50-53页 |
| ·质粒基因组比较分析 | 第53-58页 |
| ·毒素-抗毒素系统 | 第53-54页 |
| ·接合转移基因簇 | 第54-55页 |
| ·黏附性 | 第55页 |
| ·质粒比较基因组 | 第55-56页 |
| ·结论 | 第56-58页 |
| 致谢 | 第58-59页 |
| 参考文献 | 第59-70页 |
| 附录 | 第70-85页 |
| 作者简介 | 第85-86页 |
