| 摘要 | 第1-5页 |
| Abstract | 第5-9页 |
| 1 绪论 | 第9-19页 |
| ·引言 | 第9页 |
| ·研究背景 | 第9-15页 |
| ·生物信息学发展概述 | 第9-12页 |
| ·蛋白质 | 第12-14页 |
| ·蛋白质热稳定性 | 第14-15页 |
| ·国内外研究现状 | 第15-17页 |
| ·蛋白质的序列特征提取 | 第15-16页 |
| ·提高蛋白质热稳定性的研究 | 第16-17页 |
| ·论文主要内容与结构安排 | 第17-19页 |
| 2 基于细菌同源蛋白数据集预测蛋白质热稳定性 | 第19-35页 |
| ·引言 | 第19-20页 |
| ·材料与方法 | 第20-25页 |
| ·细菌同源蛋白数据集 | 第20-22页 |
| ·方法 | 第22-25页 |
| ·提取共有同源蛋白 | 第22-23页 |
| ·提取氨基酸频率特征 | 第23-24页 |
| ·进化树的构建 | 第24页 |
| ·确定对与最适生长温度关系最大的序列位置 | 第24-25页 |
| ·计算氨基酸指数 | 第25页 |
| ·结果与分析 | 第25-33页 |
| ·共有同源蛋白的提取 | 第25-27页 |
| ·氨基酸频率与最适生长温度的相关性 | 第27页 |
| ·氨基酸指数分析 | 第27-29页 |
| ·蛋白质二级结构信息 | 第29页 |
| ·进化分析 | 第29-33页 |
| ·讨论 | 第33页 |
| ·本章小结 | 第33-35页 |
| 3 基于酶数据集预测蛋白质热稳定性突变位置 | 第35-49页 |
| ·引言 | 第35-36页 |
| ·材料与方法 | 第36-41页 |
| ·酶数据集的获取和构建 | 第36-37页 |
| ·方法 | 第37-41页 |
| ·短片段模糊匹配 | 第37-40页 |
| ·基于酶数据集建立特征短片段库 | 第40-41页 |
| ·利用特征短片段库扫描蛋白质序列 | 第41页 |
| ·结果 | 第41-47页 |
| ·特征短片段库的选取 | 第41-43页 |
| ·与其他特征提取方法进行对比 | 第43-44页 |
| ·ProTherm数据库验证 | 第44-47页 |
| ·讨论 | 第47-48页 |
| ·本章小结 | 第48-49页 |
| 4 淀粉酶热稳定性方面的突变预测 | 第49-59页 |
| ·引言 | 第49-51页 |
| ·材料与方法 | 第51-54页 |
| ·材料 | 第51-52页 |
| ·方法 | 第52-54页 |
| ·仅通过中温淀粉酶序列进行单点突变设计 | 第52-53页 |
| ·结合中温淀粉酶和高温淀粉酶的序列和结构特点进行突变设计 | 第53页 |
| ·分子动力学模拟——计算空间能量值 | 第53-54页 |
| ·结果与分析 | 第54-57页 |
| ·仅通过中温淀粉酶序列设计突变体的结果 | 第54页 |
| ·结合中温淀粉酶和高温淀粉酶的序列和结构特点设计突变结果 | 第54-55页 |
| ·蛋白质突变实验结果分析 | 第55-57页 |
| ·讨论 | 第57页 |
| ·本章小结 | 第57-59页 |
| 5 结论 | 第59-62页 |
| 参考文献 | 第62-68页 |
| 致谢 | 第68-69页 |
| 攻读学位期间发表的论文 | 第69-70页 |
| 附录一 表目录 | 第70-71页 |
| 附录二 图目录 | 第71-72页 |