| 摘要 | 第1-10页 |
| ABSTRACT | 第10-15页 |
| 第一章 海洋细菌多样性及研究方法与地理学分布简述 | 第15-24页 |
| 引言 | 第15页 |
| ·海洋细菌的多样性和地理学分布研究进展 | 第15-16页 |
| ·主要海洋环境及其特点 | 第15-16页 |
| ·海洋细菌研究简述 | 第16-18页 |
| ·海洋细菌分布特征与主要类群 | 第16页 |
| ·海洋细菌多样性研究进展 | 第16-17页 |
| ·海洋细菌生态学功能和意义 | 第17-18页 |
| ·海洋细菌在微食物环中的作用 | 第17页 |
| ·海洋细菌在碳化学循环中的作用 | 第17-18页 |
| ·海洋细菌在氮化学循环中的作用 | 第18页 |
| ·海洋细菌在硫化学循环中的作用 | 第18页 |
| ·海洋微生物多样性的研究方法 | 第18-21页 |
| ·传统方法 | 第18-19页 |
| ·原位研究法 | 第18-19页 |
| ·分离培养法 | 第19页 |
| ·分子生物学方法 | 第19-21页 |
| ·16S rDNA序列分析 | 第19页 |
| ·变性/温度梯度凝胶电泳技术（DGGE/TGGE） | 第19-20页 |
| ·分子标记技术 | 第20页 |
| ·实时定量PCR(real-time quantitative PCR) | 第20页 |
| ·分子杂交技术 | 第20页 |
| ·高通量测序技术应用 | 第20-21页 |
| ·单细胞测序技术 | 第21页 |
| ·东海陆架环境特征 | 第21-23页 |
| ·东海陆架地貌地质特征 | 第21-22页 |
| ·东海陆架水文特征 | 第22-23页 |
| ·本研究的目的与意义 | 第23-24页 |
| 第二章 东海陆架表层沉积物细菌多样性与地理分布 | 第24-43页 |
| ·实验材料与方法 | 第24-30页 |
| ·实验材料 | 第24-25页 |
| ·主要实验试剂与设备 | 第25-27页 |
| ·实验方法 | 第27-30页 |
| ·样品总DNA的提取与纯化 | 第27页 |
| ·PCR扩增和产物回收 | 第27-28页 |
| ·PCR产物的连接和转化 | 第28-29页 |
| ·菌液PCR筛选和测序 | 第29页 |
| ·序列分析 | 第29-30页 |
| ·实验结果与分析 | 第30-39页 |
| ·沉积物细菌 16S r DNA文库数据分析 | 第30-31页 |
| ·沉积物细菌群落结构和分布分析 | 第31-32页 |
| ·变形菌门系统发育树分析 | 第32-35页 |
| ·其他门类细菌系统发育树分析 | 第35-39页 |
| ·沉积物细菌群落组成空间分布分析 | 第39页 |
| ·讨论 | 第39-43页 |
| ·东海陆架沉积物细菌类群多样性 | 第39-40页 |
| ·东海陆架沉积物特殊群落细菌的地理分布与生态功能 | 第40-41页 |
| ·沉积物细菌群落结构与地理区域的影响 | 第41-43页 |
| 第三章 东海沿岸表层海水浮游细菌群落结构及与环境因子相关性研究 | 第43-55页 |
| ·材料与方法 | 第43-45页 |
| ·实验材料 | 第43-44页 |
| ·主要实验试剂与设备 | 第44页 |
| ·实验方法 | 第44-45页 |
| ·样品总DNA的提取与纯化 | 第44-45页 |
| ·PCR扩增和产物回收 | 第45页 |
| ·PCR产物的连接和转化 | 第45页 |
| ·菌液PCR筛选和测序 | 第45页 |
| ·序列分析 | 第45页 |
| ·实验结果与分析 | 第45-52页 |
| ·海水样品理化参数 | 第45-46页 |
| ·浮游细菌克隆文库数据分析 | 第46-48页 |
| ·浮游细菌群落结构分析 | 第48-50页 |
| ·浮游细菌群落组成空间分布分析 | 第50-52页 |
| ·讨论 | 第52-55页 |
| ·站点典型优势菌群及其生态功能 | 第52页 |
| ·特殊浮游细菌类群和生态功能 | 第52-53页 |
| ·站点浮游细菌群落空间分布及其与环境因子的关系 | 第53-55页 |
| 参考文献 | 第55-61页 |
| 致谢 | 第61-62页 |
| 在读期间发表的学术论文及研究成果 | 第62页 |
