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马拉色菌脂肪酶SMG1酶学性质表征及晶体学研究

摘要第1-8页
Abstract第8-12页
主要符号表第12-18页
第一章 绪论第18-38页
   ·脂肪酶第18-22页
     ·脂肪酶结构特征第18-19页
     ·脂肪酶的“界面激活”现象第19-20页
     ·脂肪酶的催化机制第20-22页
   ·偏甘油酯脂肪酶第22-26页
     ·偏甘油酯脂肪酶重要的生理功能第22-24页
     ·偏甘油酯脂肪酶极具工业应用价值第24-26页
   ·蛋白质晶体学第26-30页
     ·蛋白质结晶的基础理论第26-27页
     ·影响蛋白质结晶的因素第27-28页
     ·蛋白质晶体解析的一般步骤第28-30页
   ·蛋白质模拟理论第30-34页
     ·蛋白质结构预测第31-32页
     ·分子动力学模拟第32-34页
   ·马拉色菌单酯和二酯脂肪酶第34-35页
     ·马拉色菌第34-35页
     ·球形马拉色菌单酯和二酯脂肪酶第35页
   ·研究发现,研究背景,意义和研究内容第35-38页
     ·研究背景第35-36页
     ·研究内容第36-38页
第二章 球形马拉色菌脂肪酶基因的克隆和表达第38-52页
   ·引言第38页
   ·材料与仪器第38-40页
     ·菌株和质粒第38-39页
     ·试剂第39页
     ·仪器第39页
     ·缓冲液、培养基第39-40页
   ·实验方法第40-47页
     ·脂肪酶 SMG1 基因序列的分析及其引物设计第40-42页
     ·PCR 扩增目的基因第42-43页
     ·构建 BSK-smg1 质粒第43页
     ·SKB-smg1 重组质粒转化到大肠杆菌 DH5α第43-44页
     ·阳性克隆的筛选与鉴定第44-45页
     ·构建毕赤酵母表达载体 pGAPZαA-smg1第45-46页
     ·SMG1 毕赤酵母重组菌株构建和筛选第46-47页
     ·SMG1 酶活的测定第47页
   ·结果与讨论第47-51页
     ·球形马拉色菌单酯和二酯脂肪酶序列分析第47-49页
     ·smg1 基因序列合成第49页
     ·组成型重组脂肪酶 SMG1 毕赤酵母菌株的构建第49-50页
     ·毕赤酵母重组表达菌株的筛选第50-51页
   ·小结第51-52页
第三章 马拉色菌脂肪酶 SMG1 的纯化和酶学特性研究第52-68页
   ·引言第52页
   ·材料与仪器第52-53页
     ·试剂第52页
     ·仪器第52页
     ·缓冲液第52-53页
   ·实验方法第53-57页
     ·粗酶液制备第53页
     ·粗酶液浓缩处理第53页
     ·阴离子交换层析第53-54页
     ·对硝基苯酚法测定脂肪酶酶活第54页
     ·单酯和二酯脂肪酶 SMG1 的最适催化温度和温度稳定性第54页
     ·单酯和二酯脂肪酶 SMG1 的最适催化 pH 和 pH 稳定性第54-55页
     ·单酯和二酯脂肪酶 SMG1 的底物特异性第55页
     ·单酯和二酯脂肪酶 SMG1 的有机溶剂耐受性第55页
     ·金属离子对于单酯和二酯脂肪酶 SMG1 的影响第55页
     ·单酯和二酯脂肪酶 SMG1 对于甘油二酯位置偏好性第55页
     ·单酯和二酯脂肪酶 SMG1 的界面催化特性第55-56页
     ·不同表面活性剂对于单酯和二酯脂肪酶 SMG1 酶活的影响第56-57页
   ·结果与讨论第57-66页
     ·重组脂肪酶 SMG1 的纯化第57页
     ·脂肪酶 SMG1 的最适催化温度和温度耐受性第57-58页
     ·脂肪酶 SMG1 的最适催化 pH 和 pH 稳定性第58-59页
     ·脂肪酶 SMG1 的底物特异性第59-60页
     ·脂肪酶 SMG1 对于甘油酯底物的位置选择性第60-61页
     ·有机溶剂对于脂肪酶 SMG1 催化活性的影响第61页
     ·金属离子对于脂肪酶 SMG1 酶活的影响第61-62页
     ·单酯和二酯脂肪酶 SMG1 的界面催化表现第62-64页
     ·表面活性剂对于单酯和二酯脂肪酶 SMG1 酶活的影响第64-66页
   ·小结第66-68页
第四章 马拉色菌脂肪酶 SMG1 的晶体学研究第68-83页
   ·引言第68页
   ·试剂与仪器第68-69页
   ·实验方法第69-71页
     ·脂肪酶 SMG1 分子排阻层析纯化第69页
     ·蛋白质浓度的测定第69页
     ·筛选结晶的蛋白质浓度第69-70页
     ·单酯和二酯脂肪酶 SMG1 结晶条件筛选和优化第70页
     ·单酯和二酯脂肪酶 SMG1 衍射数据的收集和处理第70-71页
   ·结果和讨论第71-81页
     ·单酯和二酯脂肪酶 SMG1 的凝胶排阻层析纯化第71-72页
     ·单酯和二酯脂肪酶 SMG1 结晶条件的筛选第72页
     ·单酯和二酯脂肪酶 SMG1 晶体结构第72-74页
     ·单酯和二酯脂肪酶 SMG1 的结构第74-75页
     ·单酯和二酯脂肪酶 SMG1 的催化三联体和“氧负离子洞”第75-76页
     ·单酯和二酯脂肪酶 SMG1 独特的“盖子”结构第76-81页
   ·小结第81-83页
第五章 单酯和二酯脂肪酶 SMG1 底物选择性的结构基础第83-94页
   ·引言第83页
   ·实验方法第83-85页
     ·构建单酯和二酯脂肪酶 SMG1 的开放结构第83-84页
     ·构建单酯和二酯脂肪酶 SMG1 与底物类似物的复合物结构第84-85页
     ·单酯和二酯脂肪酶 SMG1 的分子动力学模拟第85页
   ·结果与讨论第85-92页
     ·单酯和二酯脂肪酶 SMG1 的开放结构第85-87页
     ·单酯和二酯脂肪酶 SMG1-底物类似物复合结构第87-88页
     ·影响单酯和二酯脂肪酶 SMG1 底物选择性的关键氨基酸第88-90页
     ·单酯和二酯脂肪酶中保守的序列模式第90-92页
   ·小结第92-94页
结论与展望第94-97页
 结论第94-95页
 本研究的创新点第95页
 未来工作展望第95-97页
参考文献第97-112页
攻读博士学位期间取得的研究成果第112-113页
参与的主要研究课题第113-114页
致谢第114-115页
附件第115页

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