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拟南芥AtDPBF4基因克隆及生物信息学分析与表达研究

摘要第1-9页
Abstract第9-11页
英文缩略词表(Abbreviations)第11-12页
第一章 绪论第12-22页
   ·拟南芥的生物学特征第12页
     ·形态学描述第12页
     ·种植特点第12页
   ·拟南芥的遗传学特性第12-14页
     ·普通遗传学特性第12-13页
     ·分子遗传学特性第13-14页
   ·拟南芥在植物抗逆机理中的研究第14-19页
     ·植物抗逆机理的研究第14-15页
     ·拟南芥在植物ABA信号传导中的应用研究第15-16页
     ·响应ABA信号传导转录因子(ABI)的研究第16-19页
   ·大肠杆菌表达系统的研究第19-21页
     ·T7表达系统第19-20页
     ·影响外源蛋白表达的因素第20-21页
       ·宿主与载体第20页
       ·培养条件第20-21页
   ·本研究的目的与主要内容第21-22页
第二章 拟南芥AtDPBF4基因的分子克隆第22-34页
   ·实验材料第22-25页
     ·植物材料第22页
     ·宿主菌第22页
     ·载体第22页
     ·引物第22页
     ·主要试剂第22-23页
     ·主要仪器第23页
     ·培养基和缓冲液第23-25页
       ·培养基第23-24页
       ·试剂配制第24-25页
   ·方法第25-30页
     ·拟南芥AtDPBF4基因的克隆第25-28页
       ·拟南芥总RNA的提取第25-26页
       ·拟南芥总RNA质量检测及浓度测定第26页
       ·cDNA第一链合成第26页
       ·PCR法体外扩增拟南芥AtDPBF4基因第26-27页
       ·扩增产物的胶回收第27-28页
       ·PCR扩增产物的克隆第28页
     ·感受态细胞的制备及连接产物的转化实验第28-30页
       ·大肠杆菌DH5α感受态细胞的制备及转化实验第28-29页
       ·重组质粒pM-AtDPBF4的鉴定第29-30页
       ·测序鉴定及序列分析第30页
   ·结果与分析第30-34页
     ·拟南芥总RNA的提取鉴定第30-31页
     ·拟南芥AtDPBF4基因的扩增结果第31页
     ·重组pM-AtDPBF4质粒的鉴定第31-32页
     ·AtDPBF4基因测序及序列分析第32-34页
第三章 AtDPBF4基因序列结构分析与功能预测第34-43页
   ·分析方法第34-37页
     ·核苷酸序列分析第34页
       ·ORF(open reading frame)的预测第34页
       ·核酸GC含量分布第34页
     ·蛋白质性质分析第34-37页
       ·蛋白质物理化学性质分析第34页
       ·疏水性预测和分析第34-35页
       ·信号肽的预测第35页
       ·蛋白质结构的预测第35-37页
       ·蛋白序列跨膜区分析第37页
       ·蛋白质在细胞内的定位分析第37页
       ·系统发育分析第37页
   ·结果与讨论第37-43页
     ·ORF(open reading frame)的预测第37页
     ·核酸GC含量分布第37-38页
     ·蛋白质性质分析第38-43页
       ·蛋白质物理化学性质分析第38-39页
       ·信号肽的预测第39-40页
       ·蛋白质结构的预测第40-41页
       ·蛋白序列跨膜区分析第41-42页
       ·蛋白质在细胞内的定位分析第42页
       ·系统发育分析第42-43页
第四章 拟南芥AtDPBF4基因在原核细胞中的表达第43-57页
   ·材料与方法第43-50页
     ·主要菌种及质粒第43页
     ·主要试剂第43-44页
     ·主要设备第44-45页
     ·实验方法第45-50页
       ·大肠杆菌BL21感受态细胞的制备第45页
       ·重组pM-AtDPBF4和pET-32a质粒转化大肠杆菌BL21第45页
       ·碱裂解法提取重组质粒pM-AtDPBF4和pET-32a质粒第45页
       ·质粒的限制性内切酶酶切反应及目的片段的凝胶回收第45页
       ·表达载体pET32a-AtDPBF4的构建第45-46页
       ·阳性重组质粒的鉴定第46-47页
       ·大肠杆菌BL21/pET32a-AtDPBF4生长曲线的测定第47页
       ·重组质粒pET32a-AtDPBF4在大肠杆菌BL21中的表达第47-50页
   ·结果与分析第50-54页
     ·阳性转化子的筛选第50-51页
     ·重组质粒大小的鉴定第51-52页
     ·重组表达载体pET32a-AtDPBF4的酶切和PCR鉴定第52页
     ·大肠杆菌BL21/pET32a-AtDPBF4生长曲线的测定第52页
     ·重组表达载体pET32a-AtDPBF4阳性克隆表达鉴定第52-54页
       ·重组蛋白的表达与表达形式分析第53页
       ·诱导剂浓度对重组蛋白表达的影响第53页
       ·诱导培养时间对重组蛋白表达的影响第53-54页
       ·诱导培养温度对重组蛋白表达的影响第54页
   ·结论第54-55页
   ·讨论第55-57页
参考文献第57-62页
附录A 攻读学位期间所发表的学术论文目录第62-63页
致谢第63页

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