| 摘要 | 第1-5页 |
| Abstract | 第5-8页 |
| 1 项目背景与相关领域研究进展 | 第8-22页 |
| ·DNA测序技术的发展 | 第8-18页 |
| ·第一代测序技术 | 第9-12页 |
| ·第二代测序技术 | 第12-16页 |
| ·第三代测序技术 | 第16-18页 |
| ·小结 | 第18页 |
| ·马鹿鹿茸研究现状 | 第18-21页 |
| ·马鹿 | 第18页 |
| ·鹿茸 | 第18页 |
| ·鹿茸再生机理 | 第18-21页 |
| ·鹿茸再生对人类的意义 | 第21页 |
| ·本章小结 | 第21-22页 |
| 2 实验部分 | 第22-25页 |
| ·材料与方法 | 第22页 |
| ·鹿茸软骨组织RNA提取 | 第22页 |
| ·基于Solexa平台的新一代测序 | 第22-23页 |
| ·数据处理 | 第23-25页 |
| ·短读段数据的装配 | 第23-24页 |
| ·拼接序列的blast/Mapping/Annation | 第24-25页 |
| 3 实验结果 | 第25-37页 |
| ·RNA质量检测结果 | 第25-26页 |
| ·RNA电泳结果 | 第25页 |
| ·RNA分光光度结果 | 第25页 |
| ·样品送样数据 | 第25-26页 |
| ·短读段数据的装配结果 | 第26-31页 |
| ·参考装配的数据结果 | 第26-28页 |
| ·自体装配的数据结果 | 第28-31页 |
| ·Blast2go结果 | 第31-34页 |
| ·E-value分布 | 第31-32页 |
| ·序列长度分布 | 第32页 |
| ·序列相似性分析结果 | 第32-33页 |
| ·物种相似性分析结果 | 第33页 |
| ·Top-hit物种分布 | 第33-34页 |
| ·基因功能预测结果 | 第34-37页 |
| ·基因注释分析 | 第34-36页 |
| ·蛋白质直系同源簇功能分类 | 第36-37页 |
| 讨论 | 第37-39页 |
| 参考文献 | 第39-45页 |
| 附录 | 第45-64页 |
| 攻读学位期间发表的学术论文 | 第64-65页 |
| 致谢 | 第65-66页 |