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毛白杨花发育遗传调控研究

摘要第1-8页
ABSTRACT第8-18页
引言第18-20页
1 文献综述第20-32页
   ·植物开花发育基因表达调控研究概况第20-25页
     ·杨树成花诱导过程研究进展第20-21页
     ·植物花的发端第21-24页
     ·花器官发育与性别决定第24-25页
   ·microRNA与植物开花调控第25-28页
     ·microRNA与开花相关基因表达调控第25-27页
     ·microRNA响应环境因子对花器官发育的调控第27-28页
   ·DNA甲基化调控花发育第28-30页
     ·DNA甲基化修饰与与开花相关基因表达调控第28-29页
     ·环境胁迫通过表观遗传修饰影响花器官发育第29-30页
   ·立题依据与技术路线第30-32页
2 毛白杨花器官表型变异多态性研究第32-46页
   ·材料与方法第32-35页
     ·试验材料第32-33页
     ·表型性状测定第33页
     ·统计分析方法第33-35页
   ·结果与分析第35-42页
     ·毛白杨花器官种源间表型性状的形态变异特征第35页
     ·毛白杨花器官种源内表型性状的形态变异第35-37页
     ·花器官表型性状的重复力第37页
     ·毛白杨种源间的表型分化第37-41页
     ·主成分分析第41-42页
     ·毛白杨花序形态变异类型第42页
   ·讨论第42-46页
3 毛白杨花器官性别特异的基因表达,激素以及DNA甲基化水平分析第46-76页
   ·材料与方法第47-51页
     ·试验材料第47页
     ·基因组DNA的提取第47页
     ·总RNA提取第47页
     ·第一链cDNA合成第47页
     ·基因芯片杂交与数据分析第47-48页
     ·差异表达基因注释第48页
     ·Gene ontology富集分析第48-49页
     ·差异表达基因的荧光定量分析第49-50页
     ·启动子分析第50-51页
     ·激素含量测定第51页
     ·DNA甲基化水平分析第51页
     ·统计分析第51页
   ·结果与分析第51-70页
     ·基因芯片差异表达分析第51-58页
     ·性别差异表达基因筛选第58页
     ·荧光定量验证基因芯片数据第58-59页
     ·开花途径相关基因性别差异表达模式第59-63页
     ·生殖发育相关基因的性别差异表达模式第63页
     ·形态发育相关基因性别差异表达模式第63页
     ·植物激素代谢相关基因的性别异表达模式第63-64页
     ·花发育过程中植物激素性别差异的变化趋势第64-66页
     ·激素含量变化与候选基因表达模式的相关性分析第66页
     ·杨树性别决定区域基因差异表达第66-68页
     ·DNA甲基化水平及其相关基因的差异表达模式第68-70页
   ·讨论第70-76页
     ·杨树雌雄花器官性别特异的花发育进程第70页
     ·花序分生组织基因以及生殖相关基因的差异表达第70-71页
     ·植物激素及相关合成基因调控花器官发育进程第71-72页
     ·植物激索信号调节基因表达第72-73页
     ·DNA甲基化修饰调控花发育进程第73-76页
4 毛白杨雌雄花器官差异表达microRNA分析第76-116页
   ·试验方法第77-79页
     ·植物材料第77页
     ·总RNA提取第77页
     ·microRNA测序数据的生物信息学分析第77页
     ·保守microRNA鉴定第77-78页
     ·microRNA的靶基因预测方法第78页
     ·qRT-PCR第78-79页
   ·结果与分析第79-93页
     ·microRNA序列分析第79-80页
     ·雄全同株个体保守microRNA类型第80-83页
     ·毛白杨雄全同株个体novel microRNA鉴定第83-87页
     ·杨树性别决定区段microRNA及靶基因定位第87-89页
     ·microRNAs靶基因预测第89页
     ·microRNAs与其靶基因在花器官中的表达模式第89-93页
     ·花器官特异表达microRNA与其靶基因的调控网络第93页
   ·讨论第93-116页
     ·保守microRNA表达分析第94-95页
     ·Novel microRNA在花器官中的表达分析第95页
     ·性别决定区段Novel microRNA表达分析第95-96页
     ·microRNA调控网络分析第96-116页
5 毛白杨雌雄花器官DNA甲基化分析第116-132页
   ·试验方法第116-121页
     ·植物材料第116页
     ·总RNA提取第116-117页
     ·第一链cDNA合成第117页
     ·显微观察第117页
     ·MSAP分析第117-118页
     ·Methylation-specific PCR(MSP)扩增第118-120页
     ·荧光定量PCR第120-121页
   ·结果与分析第121-128页
     ·雄全同株花器官形态学观察以及显微观察第121-122页
     ·雌雄花器官MSAP分析第122-123页
     ·雌雄花器官特异的DNA甲基化模式第123页
     ·MSAP多态性片段序列分析第123-127页
     ·PtGT2,PtPAL3和PtCER4基因表达分析第127-128页
     ·花器官时空特异的DNA甲基化模式第128页
   ·讨论第128-132页
     ·雌雄花器官差异的DNA甲基化模式第129-130页
     ·基因转录区的DNA甲基化修饰与基因表达的关系第130页
     ·重要候选基因筛选第130-132页
6 毛白杨雌雄花器官发育过程中生理生化研究第132-148页
   ·材料方法第133-135页
     ·植物材料第133页
     ·气象数据第133页
     ·温度胁迫处理实验第133页
     ·生理生化指标测定第133-134页
     ·总RNA提取第134页
     ·第一链cDNA合成第134页
     ·差异表达基因的荧光定量分析第134-135页
   ·结果与分析第135-142页
     ·杨树雌雄花器官生长过程第135-136页
     ·雌雄花器官抗氧化酶系统季节性变化趋势第136-138页
     ·雌雄花器官生化指标季节性变化趋势第138-141页
     ·雌雄花器官钙离子含量季节性变化趋势第141-142页
     ·抗氧化系统和钙离子运输相关基因表达模式第142页
   ·讨论第142-148页
     ·雌雄花器官特异的抗氧化还原酶活性及相关基因表达第143页
     ·雌雄花器官特异的MDA、可溶性糖以及可溶性蛋白含量第143-146页
     ·雌雄花器官特异的钙离子浓度及相关基因表达第146-148页
7 SUPERMAN基因核苷酸多样性以及表达分析第148-168页
   ·材料与方法第149-152页
     ·植物材料第149页
     ·总RNA提取与cDNA合成第149页
     ·SUP基因克隆测序第149-150页
     ·差异表达基因的荧光定量分析第150-151页
     ·PtoSUP基因模型鉴定第151页
     ·进化分析第151-152页
     ·核苷酸多样性分析第152页
     ·启动子分析第152页
   ·结果与分析第152-165页
     ·毛白杨SUPERMAN基因家族鉴定第152-154页
     ·杨树SUP基因进化发育以及密码子偏好性分析第154-158页
     ·PtoSUP基因表达的时空特异性第158页
     ·PtoSUP家族基因受激素诱导表达第158-161页
     ·PtoSUP基因抑制B类功能基因表达第161-162页
     ·PtoSUP基因在不同类型花器官中的表达模式第162页
     ·PtoSUP1基因单核苷酸多态性第162-165页
   ·讨论第165-168页
     ·杨属SUP基因家族的结构趋异以及表达模式第165页
     ·SUP基因调控杨树花器官发育第165-166页
     ·SUP1基因经历纯化选择作用第166-168页
8 结论与展望第168-174页
   ·结论第168-170页
   ·研究展望第170-174页
参考文献第174-192页
个人简介第192-194页
导师简介1第194-196页
导师简介2第196-198页
硕博期间发表的论文与登录的基因第198-200页
致谢第200页

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