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罗非鱼不同群体mtDNA D-loop区遗传多样性分析

摘要第1-9页
ABSTRACT第9-11页
第一章 文献综述第11-30页
 1 鱼类遗传多样性的研究意义第11-13页
   ·遗传多样性的定义第11-12页
   ·研究遗传多样性的意义第12-13页
     ·评价群体的遗传结构第12页
     ·揭示物种的起源与进化第12页
     ·有利于生物遗传改良或育种第12-13页
     ·珍稀濒危物种保护第13页
 2 鱼类遗传多样性的研究方法及应用第13-20页
   ·形态学多态性的研究第13-14页
   ·染色体多态性研究第14-15页
   ·蛋白质(同工酶)多态性的研究第15-16页
   ·DNA多态性的研究第16-20页
     ·RFLP技术(Restriction fragment length polymorphism,RFLP)第17页
     ·RAPD技术(Randomly Amplified Polymorphic DNA,RAPD)第17-18页
     ·AFLP技术(Amplified Fragment Length Polymophism,AFLP)第18页
     ·DAF技术(DNA Amplification Fingerprinting,DAF)第18-19页
     ·微卫星DNA(Microsatellite)第19-20页
     ·线粒体DNA(mtDNA)多态性的研究第20页
 3 mtDNA的介绍及D-loop区研究概况第20-28页
   ·mtDNA的结构第20-21页
   ·鱼类mtDNA的特征第21-23页
     ·分子较小第21页
     ·编码效率高第21-22页
     ·母系遗传第22页
     ·核质互作第22页
     ·mtDNA的同质性第22页
     ·进化速度快第22-23页
     ·多态性第23页
   ·鱼类mtDNA多态性检测的方法第23-24页
     ·限制性内切酶片段长度多态法(RFLP)第23-24页
     ·直接测序法第24页
   ·鱼类mtDNA多态性的应用进展第24-26页
     ·在鱼类系统学中的应用第24-25页
     ·在鱼类分子群体遗传学中的应用第25页
     ·在鱼类种间杂交渐渗中的应用第25-26页
   ·mtDNA控制区(D-loop区)第26-28页
     ·控制区结构第26-27页
     ·鱼类mtDNAD-loop区研究概况第27-28页
 4 罗非鱼线粒体DNA的研究概况第28-29页
 5 本试验的意义与目的第29-30页
第二章 罗非鱼不同群体mtDNA控制区遗传多样性分析第30-57页
 1 前言第30页
 2 实验材料第30-31页
   ·材料第30-31页
   ·实验试剂第31页
 3 实验步骤第31-40页
   ·罗非鱼采血方法第31-32页
     ·本方法所用化学试剂及材料第31页
     ·尾部静脉采血的具体步骤第31-32页
   ·基因组DNA的提取及检测第32-34页
     ·本方法所用化学试剂与实验仪器第32页
     ·本方法中溶液的配置第32-33页
     ·基因组DNA提取的具体步骤第33页
     ·基因组DNA的检测(琼脂糖凝胶电泳检测)第33-34页
   ·引物的设计与筛选第34-35页
     ·所用试剂与实验仪器第34页
     ·引物设计第34页
     ·PCR反应体系第34-35页
   ·扩增产物的回收和纯化第35页
   ·质粒的构建第35-38页
     ·所用试剂与实验仪器第35-36页
     ·所用溶液的配置第36页
     ·感受态细胞的制备第36-37页
     ·连接与转化第37-38页
   ·质粒DNA的提取第38-39页
   ·阳性克隆的鉴定第39页
   ·数据处理第39-40页
 4 结果第40-51页
   ·基因组DNA的提取第40页
   ·引物的筛选和PCR反应程序的优化第40页
   ·阳性克隆的鉴定第40-41页
   ·测序第41页
   ·罗非鱼D-loop区部分序列结构特征第41-48页
     ·序列碱基组成第41-42页
     ·D-loop序列结构特征第42-43页
     ·核苷酸序列的变异情况第43-47页
     ·罗非鱼线粒体DNA D-Loop区单倍型分析第47-48页
   ·罗非鱼群体系统发育树的构建第48-50页
   ·罗非鱼群体的系统发生关系第50-51页
     ·群体之间的遗传距离分析第50页
     ·群体间Fst与Nm值第50-51页
 5 讨论第51-57页
   ·试验方法的确定第51-52页
   ·罗非鱼D-loop序列结构特征第52-53页
   ·罗非鱼群体的遗传分化第53-54页
   ·罗非鱼群体的遗传多样性第54页
   ·引种后遗传多样性的变化第54-57页
全文总结第57-59页
参考文献第59-65页
附录第65-67页
致谢第67-69页
攻读学位期间参与课题研究目录第69页

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