| 摘要 | 第1-4页 |
| ABSTRACT | 第4-9页 |
| 第一章 文献综述 | 第9-23页 |
| ·我国现阶段污水处理的重要意义 | 第9-12页 |
| ·污水来源、分类 | 第9页 |
| ·污水的性质、污染指标及对环境的危害 | 第9-10页 |
| ·污水的物理性质及指标 | 第9-10页 |
| ·污水的化学性质及污染指标 | 第10页 |
| ·污水处理方法 | 第10-12页 |
| ·环境中分子微生物学诊断技术 | 第12-17页 |
| ·研究中用到的分子生物学技术原理简介 | 第14页 |
| ·PCR 基本原理 | 第14-15页 |
| ·实时荧光定量 PCR 技术原理 | 第15-16页 |
| ·454 焦磷酸测序方法简介 | 第16-17页 |
| ·生物脱氮过程简介 | 第17-19页 |
| ·氨氧化作用 | 第18页 |
| ·硝化作用 | 第18页 |
| ·反硝化作用 | 第18-19页 |
| ·生物脱氮过程影响因素 | 第19-21页 |
| ·硝化反应的影响因素 | 第19-20页 |
| ·反硝化反应的影响因素 | 第20-21页 |
| ·研究目的、意义与研究内容 | 第21-23页 |
| ·本课题研究的目的与意义 | 第21-22页 |
| ·本课题研究的内容 | 第22-23页 |
| 第二章 454 焦磷酸测序法分析 MABR 系统多样性 | 第23-45页 |
| ·膜与膜组件 | 第23页 |
| ·MABR 装置及工艺过程 | 第23-26页 |
| ·454 焦磷酸测序法分析 MABR 系统多样性 | 第26-44页 |
| ·DNA 的提取 | 第26-27页 |
| ·PCR 扩增实验 | 第27页 |
| ·琼脂糖凝胶 PCR 产物纯化 | 第27-29页 |
| ·PCR 产物检验 | 第29-33页 |
| ·454 焦磷酸测序流程 | 第33-35页 |
| ·测序流程 | 第33-34页 |
| ·信息分析流程说明 | 第34页 |
| ·流程图示 | 第34-35页 |
| ·信息分析流程说明 | 第35页 |
| ·测序数据统计分析 | 第35-38页 |
| ·OTU-based 分析 | 第38页 |
| ·OTU 简介 | 第38页 |
| ·OTU 分析主要步骤 | 第38页 |
| ·Alpha-diversity 分析 | 第38-40页 |
| ·指数介绍（estimator） | 第38-40页 |
| ·指数分析结果统计 | 第40页 |
| ·稀释性曲线 | 第40-43页 |
| ·稀释性曲线简介 | 第40-41页 |
| ·稀释性曲线分析结果 | 第41-43页 |
| ·分类学分析（Taxonomy） | 第43页 |
| ·分类学分析简介（classify） | 第43页 |
| ·分类学分析主要步骤 | 第43页 |
| ·分类学分析结果说明 | 第43-44页 |
| ·在门分类水平上进行分类 | 第43页 |
| ·在属分类水平上进行分类 | 第43-44页 |
| ·在种分类水平上进行分类 | 第44页 |
| ·本章小结 | 第44-45页 |
| 第三章 实时荧光定量 PCR 的应用 | 第45-73页 |
| ·技术路线 | 第46页 |
| ·质粒的准备过程 | 第46-51页 |
| ·PCR 反应 | 第46-47页 |
| ·PCR 产物的纯化 | 第47-48页 |
| ·连接转化 | 第48页 |
| ·质粒基因片段的检验 | 第48-49页 |
| ·提取质粒 | 第49-50页 |
| ·质粒 OD 值的测定 | 第50-51页 |
| ·nirS 拷贝数的测定 | 第51-56页 |
| ·nirS 引物的选择 | 第51页 |
| ·nirS 标品 DNA 确定 | 第51页 |
| ·nirS qPCR 预实验 | 第51-56页 |
| ·退火温度确定 | 第52-53页 |
| ·qPCR 条件验证 | 第53-54页 |
| ·nirS 标准曲线绘制 | 第54-55页 |
| ·样品 DNA nirS qPCR | 第55-56页 |
| ·16S DNA 拷贝数的测定 | 第56-64页 |
| ·16SDNA 引物的选择 | 第56页 |
| ·16S DNA 质粒 DNA 确定 | 第56-57页 |
| ·16S DNA qPCR 预实验 | 第57-64页 |
| ·退火温度确定 | 第57-59页 |
| ·不同细菌 16S rDNA 引物比较 | 第59-62页 |
| ·标准曲线 | 第62-63页 |
| ·样品 16S rDNA 拷贝数测定 | 第63-64页 |
| ·AOB 拷贝数的测定 | 第64-69页 |
| ·AOB 引物的选择 | 第64页 |
| ·AOB 标品 DNA 确定 | 第64-65页 |
| ·退火温度确定 | 第65-67页 |
| ·AOB 标准曲线绘制 | 第67页 |
| ·样品 AOB 拷贝数测定 | 第67-69页 |
| ·各功能基因拷贝数汇总 | 第69-71页 |
| ·本章小结 | 第71-73页 |
| 第四章 结论与展望 | 第73-76页 |
| ·主要创新点 | 第73-74页 |
| ·展望 | 第74-76页 |
| 参考文献 | 第76-82页 |
| 发表论文和参加科研情况说明 | 第82-83页 |
| 致谢 | 第83页 |