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三七消减文库构建和皂甙合成关键酶基因克隆及表达

正文目录第1-11页
图片目录第11-13页
表格目录第13-14页
中文摘要第14-17页
英文摘要第17-20页
第一章 三七根的抑制消减文库构建第20-46页
 摘要第21-22页
 1 引言第22-24页
 2 材料与方法第24-34页
   ·材料第24-26页
     ·植物材料第24页
     ·菌株和载体第24-25页
     ·培养基及试剂第25页
     ·引物和接头第25-26页
   ·方法第26-34页
     ·总RNA的提取第26-27页
     ·SMART cDNA的合成第27页
     ·合成的cDNA的RsaⅠ消化第27-28页
     ·酶切产物的纯化第28页
     ·Driver和Tester cDNA的制备第28-29页
     ·消减杂交第29页
     ·Nested PCR扩增消减杂交产物第29-30页
     ·差减效率的检测第30-31页
     ·三七根抑制消减文库的构建第31-33页
       ·连接第31页
       ·E.coli JM109 感受态细胞制备第31页
       ·转化第31页
       ·三七根抑制消减文库cDNA片段大小检测第31-32页
       ·质粒DNA提取第32-33页
     ·电泳检测第33-34页
 3 结果第34-40页
   ·三七消减文库构建的策略第34页
   ·RNA的分离纯化第34-36页
   ·cDNA的SMART合成和RsaⅠ酶切第36页
   ·抑制消减杂交PCR第36-37页
   ·消减效率的检测第37-38页
   ·抑制消减文库的构建第38-39页
   ·消减cDNA文库中cDNA片段大小的检测第39-40页
 4 讨论第40-43页
   ·高质量和足够量的RNA是构建高质量cDNA文库的前提第40-41页
   ·构建三七根cDNA消减文库的重要性第41页
   ·选择抑制消减杂交作为研究方法的依据第41-43页
 小结第43-44页
 参考文献第44-46页
第二章 三七差异表达基因的分析第46-84页
 摘要第47-48页
 1 引言第48-50页
 2 材料与方法第50-56页
   ·常用溶液的配制第50-51页
   ·斑点杂交筛选第51-54页
     ·尼龙膜的准备第51页
     ·探针制备第51-53页
     ·斑点杂交第53-54页
   ·差异基因的测序和同源性分析第54页
   ·RT-PCR分析第54-56页
     ·RT-PCR反应体系和条件第54-55页
     ·PCR扩增产物的定量检测第55页
     ·引物的设计第55-56页
 3 结果第56-76页
   ·差异表达基因筛选策略第56页
   ·差异表达基因的斑点杂交第56页
   ·差异基因的测序和同源性分析第56-65页
   ·差异表达基因的RT—PCR分析第65-66页
   ·差异表达基因与皂甙合成相关性分析第66-74页
     ·皂甙合成关键酶基因分析第66-69页
     ·与皂甙合成相关基因功能分析第69-74页
   ·消减文库中部分基因分析第74-76页
     ·末端尿苷酸转移酶第74页
     ·果胶脂酶第74页
     ·促分泌的过氧化物酶第74-75页
     ·14-3-3蛋白第75页
     ·二氢硫辛酰胺琥珀酰(基)转移酶第75-76页
 4 讨论第76-78页
   ·三七3年生根和1年生根cDNA中存在着差异表达的基因第76-77页
   ·差异基因数量和皂甙合成的可能性分析第77页
   ·三七3年生根成为主要的药用部位的分子生物学分析第77-78页
 小结第78-79页
 参考文献第79-84页
第三章 三七EST序列生物信息学分析第84-114页
 摘要第85-86页
 1 引言第86-88页
 2 材料与方法第88-91页
   ·相关软件和程序的获取与安装第88页
   ·EST序列的获取第88页
   ·序列组装第88-89页
   ·信号肽预测第89-90页
   ·跨膜区预测第90页
   ·亚细胞定位第90页
   ·蛋白质结构功能域的分析第90页
   ·功能位点分析第90-91页
 3 结果第91-107页
   ·生物信息学分析策略第91-92页
   ·序列组装第92-93页
   ·蛋白质功能的分类第93-94页
   ·蛋白质亚细胞定位分析第94页
   ·信号肽分析第94-100页
   ·跨膜结构的分析第100-101页
   ·功能结构域的分析第101页
   ·功能位点的分析第101-107页
 4 讨论第107-109页
   ·EST序列组装的重要性第107页
   ·EST结构的预测有助于新基因功能的分析第107-108页
   ·EST结构的预测为基因提供与之相关的辅助信息第108-109页
 小结第109-110页
 参考文献第110-114页
第四章 三七鲨烯环氧酶基因的克隆与表达分析第114-149页
 摘要第115-116页
 1 引言第116-118页
 2 材料与方法第118-123页
   ·实验材料与试剂第118页
   ·实验方法第118-123页
     ·三七根、茎、叶总RNA的分离与cDNA合成第118页
     ·扩增三七鲨烯环氧酶基因编码区的引物设计第118页
     ·PCR扩增三七鲨烯环氧酶基因第118-119页
     ·PCR产物的纯化第119页
     ·DNA连接反应和大肠杆菌的转化第119页
     ·质粒提取第119页
     ·重组质粒的PCR和限制性内切酶酶切鉴定第119页
     ·测序及序列数据分析第119-120页
     ·荧光定量PCR第120-123页
 3 结果第123-141页
   ·三七鲨烯环氧酶基因克隆和时空表达策略第123页
   ·RNA的提取和cDNA的合成第123-125页
   ·三七鲨烯环氧酶cDNA的克隆与鉴定第125-128页
     ·三七鲨烯环氧酶cDNA的PCR扩增第125页
     ·三七鲨烯环氧酶cDNA克隆及鉴定第125-126页
     ·三七鲨烯环氧酶cDNA的序列分析第126-128页
   ·三七鲨烯环氧酶基因密码子偏爱性分析第128-129页
   ·三七鲨烯环氧酶序列同源性分析第129-133页
   ·三七鲨烯环氧酶信号肽和疏水性分析第133-135页
   ·三七鲨烯环氧酶中重要基序分析第135页
   ·三七鲨烯环氧酶基因进化树分析第135-137页
   ·三七鲨烯环氧酶基因的表达第137-141页
     ·常规PCR扩增第137页
     ·标准品获取第137页
     ·实时荧光定量PCR的评价和优化第137-140页
     ·三七鲨烯环氧酶基因的时空表达和转录水平第140-141页
 4 讨论第141-144页
   ·三七皂甙合成酶基因与人参的比较第141-142页
   ·三七鲨烯环氧酶基因与其它物种比较第142-143页
   ·三七鲨烯环氧酶基因时空表达的意义第143-144页
 小结第144-145页
 参考文献第145-149页
文献综述第149-184页
 摘要第150-152页
 1 三七的生物学特性第152-154页
   ·三七名称的考证第152页
   ·三七植物学特征第152-154页
 2 三七的道地性第154-159页
   ·道地药材生物学原理第154-156页
   ·三七道地性分析第156-159页
     ·三七道地性与其地质背景系统(GBS)、土壤理化状况的关系第156-157页
     ·土壤pH第157页
     ·三七药材道地性与土壤微量元素的关系第157-158页
     ·气象条件对三七药材道地性的影响第158-159页
 3 三七的药理研究进展第159-164页
   ·心血管系统第159-162页
     ·降低心肌耗氧量,改善心肌缺血第159页
     ·抗心律失常第159-160页
     ·降血脂,防止动脉粥样硬化第160页
     ·降血压第160页
     ·抗血栓、抗血小板聚集第160-161页
     ·抗休克第161页
     ·影响血液流变学特性第161-162页
     ·抗氧化作用第162页
   ·三七在肿瘤防治中的作用第162-163页
   ·抗衰老作用第163页
   ·对神经系统的影响第163页
     ·镇静作用第163页
     ·镇痛作用第163页
   ·对免疫系统的影响第163-164页
 4 三七化学成分的研究进展第164-173页
   ·三七的皂甙第165-172页
     ·三七的皂甙成分第165-168页
     ·三七各部位皂甙含量第168-172页
   ·氨基酸成分第172页
   ·黄酮类成分第172页
   ·糖类成分第172-173页
   ·有机酸第173页
   ·无机成分第173页
 5 次生萜类生物合成的代谢途径第173-183页
   ·萜类生物合成途径第174-177页
     ·甲羟戊酸途径第174页
       ·非甲羟戊酸途径第174-177页
   ·生物合成的酶第177-183页
     ·HMGR酶第178页
     ·DXPS酶第178-179页
     ·DXR酶第179页
     ·烯丙基转移酶第179-180页
     ·萜类合成酶第180-183页
 6 三七的分子生物学研究进展第183-184页
展望第184-194页
在读期间发表或被接收的论文第194-195页
致谢第195-196页

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