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病原诱导启动子和组织特异性启动子的分离克隆和功能鉴定

中文摘要第1-9页
Abstract第9-11页
第一章 病原诱导型启动子的分离和鉴定第11-77页
 1.前言第11-38页
   ·启动子概述第12-15页
     ·启动子的结构和功能第12-15页
   ·已克隆的启动子概述第15-17页
     ·组成型的启动子第16页
     ·组织特异性表达的启动子第16页
     ·诱导表达的启动子第16-17页
   ·研究启动子功能的技术方法第17-23页
     ·启动子的预测工具第18页
     ·准确定位转录起始点的技术—5’陕速扩增cDNA末端(5’RACE)第18-19页
     ·启动子的克隆方法第19-20页
       ·启动子探针型质粒载体第19页
       ·利用PCR的方法克隆启动子第19-20页
     ·启动子强弱和功能的定性、定量检测第20-21页
     ·鉴别RNA聚合酶等反式作用因子在启动子上结合位点的方法第21-23页
       ·DNAase法第21-22页
       ·凝胶阻滞实验第22页
       ·硫酸二甲酯(DMS)法第22页
       ·甲基化干扰实验第22页
       ·随机PCR第22-23页
       ·蛋白质-核酸杂交实验第23页
     ·利用EXOIII/SI酶的作用构建缺失克隆第23页
   ·植物中的转录因子简介第23-26页
     ·转录因子的结构特征第24-26页
   ·植物中的WRKY基因家族概述第26-33页
     ·WRKY转录因子的结构第27-28页
     ·W-盒第28-29页
     ·WRKY转录因子的生物学功能第29-32页
       ·抗病相关功能第29-30页
       ·衰老相关的调控第30页
       ·对损伤诱导表达的调控第30-31页
       ·对发育的调控第31页
       ·对代谢途径的调控第31-32页
     ·WRKY蛋白的诱导激发物第32-33页
       ·植物激素的胁迫第32-33页
       ·冷、热害及干旱的胁迫第33页
   ·植物抗病的分子机理研究第33-38页
     ·启动子分析在植物抗病机理研究中的作用第33页
     ·植物抗病机理的研究概述第33-34页
     ·植物抗病反应中涉及的基因第34-35页
       ·植物的抗病主效基因第34页
       ·植物的抗病相关基因第34-35页
     ·抗病基因产物和病原物的识别第35-36页
     ·植物抗病反应中的信号分子第36-38页
       ·水杨酸第36-37页
       ·乙烯第37页
       ·茉莉酸第37-38页
 2.研究的目的和意义第38页
 3.材料和方法第38-50页
   ·水稻材料和接种鉴定第38-39页
     ·水稻品种第38页
     ·白叶枯病的菌株及接种方法第38-39页
   ·基因组及cDNA文库第39页
   ·载体、菌株和质粒第39页
   ·DNA的抽提及Southern杂交第39-40页
   ·总RNA的抽提及操作第40页
   ·启动子序列分析第40-42页
   ·P_(WRKY13)启动子全长和缺失片段的获得第42-43页
   ·农杆菌介导的遗传转化第43页
     ·全长及缺失启动子片段的遗传转化第43页
     ·启动子的瞬时表达系统第43页
   ·GUS的定量及定性分析第43-44页
   ·激素处理第44页
   ·凝胶阻滞(gel retardation assay)第44-45页
     ·核蛋白的抽提第44页
     ·凝胶阻滞第44-45页
   ·定点突变第45-46页
   ·酵母单杂交第46页
   ·蛋白质的亚细胞定位第46-49页
   ·蛋白的原核表达第49-50页
 4.结果与分析第50-67页
   ·P_(WRKY13)启动子的结构第50-51页
   ·全长及截短启动子片段的表达模式第51-54页
   ·P_(WRKY13)启动子上与病原诱导相关的顺式作用位点第54-59页
   ·鉴定的病原诱导响应位点对基因的表达具有正或负调控的作用第59-61页
   ·筛选P_(WRKY13)调控位点上的结合蛋白及验证第61-64页
   ·P_(WRKY13)调控位点上结合蛋白的表达模式第64-66页
   ·激素对P_(WRKY13)启动子的效应第66-67页
 5.讨论第67-77页
   ·WRKY13是被一系列顺式和反式作用因子调控的第67-70页
   ·激素与P_(WRKY13)启动子第70-72页
   ·P_(WRKY13)启动子上的调控蛋白第72-74页
   ·P_(WRKY13)启动子可能的调控模式第74-77页
第二章 组织特异性启动子的分离和鉴定第77-138页
 1.前言第77-80页
 2.研究的目的和意义第80页
 3.材料和方法第80-90页
   ·P_(D540)启动子全长与缺失片段的获得第80-81页
   ·其它载体构建第81-83页
   ·用于凝胶阻滞的探针第83页
   ·定点突变第83-84页
   ·实时定量PCR第84页
   ·酵母单杂交第84-85页
   ·亚细胞定位第85页
   ·蛋白的原核表达第85页
   ·转基因植株中Bt蛋白含量的测定第85-90页
 4.结果与分析第90-109页
   ·P_(D540)及截短的启动子片段的表达模式第90-91页
   ·P_(D540)启动子的结构特征第91-93页
   ·启动子缺失片段的组织表达模式第93-94页
   ·负调控组织特异性表达的启动子片段的功能验证第94-96页
   ·包含组织特异性调控顺式作用位点的DNA区段第96-99页
   ·P_(D540)上调控组织特异表达的顺式作用位点第99-101页
   ·顺式位点的定点突变分析第101-102页
   ·P_(D540)启动子驱动抗虫基因的表达第102-104页
   ·启动子上顺式作用位点的结合蛋白及其体外验证第104-107页
   ·P_(D540)启动子上顺式位点上互作蛋白的表达模式第107-109页
 5.讨论第109-138页
   ·P_(D540)包含调控组织特异表达的顺式作用位点第109-111页
   ·P_(D540)启动子可能的调控模式第111-112页
   ·P_(D540)启动子上的结合蛋白第112-114页
   ·P_(D540)启动子的应用第114页
   ·启动子研究的方法第114-115页
   ·构建超级启动子第115-138页
附录1:部分试验的详细步骤第138-151页
附录2:用于P_(WRKY13)及P_(D540)凝胶阻滞研究的探针第151-163页
附录3:已发表和待发表的论文、会议摘要及申请的专利第163-165页
致谢第165页

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