| 摘要 | 第1-8页 |
| ABSTRACT | 第8-10页 |
| 第一章 绪论 | 第10-15页 |
| ·引言 | 第10页 |
| ·研究现状 | 第10-13页 |
| ·基因序列数据库 | 第13页 |
| ·研究意义 | 第13-15页 |
| 第二章 序列比对问题的研究现状 | 第15-24页 |
| ·序列比对问题 | 第15-22页 |
| ·序列比对问题的研究现状 | 第22-23页 |
| ·研究序列比对的实验数据来源 | 第23-24页 |
| ·本章小结 | 第24页 |
| 第三章 Q-学习（Q-LEARNING）算法的基本概念和实现方法 | 第24-36页 |
| ·学习 | 第24-25页 |
| ·马尔科夫决策过程 MDP（MARKOV DECISION PROCESSES） | 第25-26页 |
| ·强化学习 | 第26-27页 |
| ·WATKINS Q 学习 | 第27-31页 |
| ·Q 学习算法的改进 | 第31-36页 |
| ·Q 学习的应用 | 第36页 |
| ·本章小结 | 第36页 |
| 第四章 基于Q-学习的生物序列比对方法 | 第36-44页 |
| ·算法思想 | 第37页 |
| ·相关定义 | 第37-38页 |
| ·算法模型示意图 | 第38-39页 |
| ·SAQL 算法描述 | 第39-41页 |
| ·SAQL 算法复杂度分析 | 第41-42页 |
| ·试验测试 | 第42-44页 |
| ·本章小结 | 第44页 |
| 第五章 具有先验知识的SAQL | 第44-49页 |
| ·模糊综合决策 | 第45页 |
| ·模型描述 | 第45-48页 |
| ·实验 | 第48-49页 |
| ·本章小结 | 第49页 |
| 第六章 结论 | 第49-51页 |
| ·本文已经完成的主要工作 | 第49-50页 |
| ·存在的问题 | 第50页 |
| ·今后改进的方向 | 第50-51页 |
| 参考文献 | 第51-55页 |
| 攻读硕士学位期间发表的论文 | 第55-56页 |
| 致谢 | 第56页 |