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计算机模拟全基因组鉴定野油菜黄单胞菌野油菜致病变种Ⅲ型效应物基因

摘要第1-4页
ABSTRACT第4-9页
第一章 前言第9-33页
   ·植物病原菌研究概述第9-14页
     ·土壤杆菌属第10-11页
     ·欧文氏菌属第11页
     ·假单胞菌属第11-12页
     ·罗尔斯通氏菌第12页
     ·黄单胞菌属第12-13页
     ·木质部小菌属第13页
     ·泛生菌属第13-14页
     ·棒状杆菌属第14页
   ·植物病原细菌的致病因子和致病基因第14-19页
     ·植物病原细菌的致病因子及编码致病因子的基因第14-19页
       ·胞外多糖第15页
       ·脂多糖第15页
       ·胞外酶第15-16页
       ·植物毒素第16-17页
       ·三型分泌的效应物第17-19页
   ·hrp基因研究进展第19-23页
     ·hrp基因概述第19-23页
       ·hrp致病岛—效应物蛋白运输的遗传学基础第20-22页
       ·hrp基因的表达第22-23页
   ·效应物的相关概念第23-24页
   ·依赖Hrp TTSS系统得效应物的研究进展第24-27页
   ·野油菜黄单胞菌野油菜致病变种分子遗传学研究概况第27-32页
     ·野油菜黄单胞菌野油菜致病变种特征及其分类现状第27-28页
     ·黄单胞菌的致病机制及其引起的主要病害第28-29页
     ·野油菜黄单胞菌的研究现状第29-30页
     ·Xcc 800 hrp基因簇及效应物第30-32页
   ·本研究工作的目的、内容及意义第32-33页
     ·目的与内容第32页
     ·意义第32-33页
第二章 材料与方法第33-43页
   ·生物信息学部分第33-34页
     ·材料第33页
     ·预测方法第33-34页
   ·分子生物学实验部分第34-43页
     ·材料第34-36页
       ·菌株和质粒第34页
       ·抗生素和其它药剂第34-35页
       ·培养基第35页
       ·溶液与缓冲液第35-36页
       ·试材第36页
     ·方法第36-37页
       ·菌株培养条件及保存第36-37页
       ·三亲本接合第37页
     ·PCR反应第37-38页
       ·引物设计第37页
       ·模板制备第37-38页
       ·反应体系第38页
       ·反应条件:第38页
       ·PCR扩增产物检测第38页
     ·琼脂糖凝胶电泳第38-39页
     ·总DNA的提取第39页
     ·DNA的纯化和DNA的沉淀第39-40页
     ·限制性内切酶酶切第40页
     ·DNA片段的回收第40页
       ·试剂盒回收第40页
     ·DNA连接第40页
     ·感受态细胞的制备第40-41页
       ·电脉冲感受态细胞的制备第40-41页
     ·转化第41页
       ·电脉冲转化第41页
     ·质粒的提取第41-42页
       ·快速碱裂解法少量提取质粒DNA第41-42页
     ·过敏性反应第42-43页
第三章 结果与分析第43-52页
   ·对Pseudomonas syringae pv.tomato DC3000已知效应物的分析第43-44页
   ·对Xanthomonas已知效应物的分析第44-45页
   ·对Xanthomonas campestris pv.campestris 8004效应物的分析第45-46页
     ·候选基因的确定第45页
     ·Pro,Ser,Leu含量的确定第45页
     ·Loosely hrp_Ⅱ box的搜索第45页
     ·SignalP3.0 TMHMM2.0的预测结果第45页
     ·43个候选效应物基因的注释信息第45-46页
   ·对预测的候选基因的实验验证第46-52页
     ·TypeⅢ型效应物验证的技术路线第46页
     ·效应物候选基因重组质粒的构建第46-49页
     ·三亲接合子的植株致病性试验第49-50页
     ·XC2995突变体的验证及致病性检测第50-52页
第四章 讨论第52-55页
   ·效应物基因的特征第52页
   ·关于Xcc 8004效应物的预测第52-53页
   ·效应物的生物学验证第53-55页
参考文献第55-67页
附录第67-78页
致谢第78-79页
攻读学位期间论文发表情况第79页

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