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蛋白质折叠动力学参数预测研究

中文摘要第1-6页
英文摘要第6-9页
第一章 引言第9-17页
   ·蛋白质结构第9-10页
   ·蛋白质折叠第10-14页
     ·体外蛋白质折叠第11页
     ·体内蛋白质折叠第11-12页
     ·分子伴侣第12页
     ·蛋白质折叠的热力学与动力学控制第12-14页
   ·蛋白质去折叠第14页
   ·蛋白质折叠速率预测第14-15页
   ·生物信息学数据源与计算工具第15页
   ·研究设想第15-17页
第二章 以氨基酸序列预测双态蛋白质的折叠速率第17-24页
   ·材料与方法第17-21页
     ·数据来源第17-20页
     ·模型第20-21页
   ·结果与讨论第21-24页
第三章 以排斥势能预测蛋白质去折叠速率和活化自由能第24-35页
   ·材料与方法第24-29页
     ·蛋白质的去折叠速率常数第24-25页
     ·蛋白质的活化自由能第25-26页
     ·蛋白质中的原子坐标第26-27页
     ·折叠模型的建立第27-29页
   ·结果与讨论第29-35页
     ·去折叠速率是势能的函数第29-31页
     ·活化自由能是势能的函数第31-33页
     ·对折叠排斥势能的分析第33-35页
第四章 以两面角预测蛋白质折叠动力学参数第35-43页
   ·材料与方法第35-40页
     ·两面角及拉氏构象图第35-36页
     ·模型的建立第36页
     ·蛋白质的折叠速率常数第36-39页
     ·蛋白质的去折叠速率常数第39页
     ·蛋白质的活化自由能第39-40页
   ·结果与讨论第40-43页
     ·折叠速率是两面角总距离的函数第40-41页
     ·去折叠速率是两面角总距离的函数第41-42页
     ·活化自由能是两面角总距离的函数第42-43页
第五章 总结论第43-44页
参考文献第44-48页
攻读硕士期间发表的论文第48-49页
致谢第49-50页
附录一 20 种标准氨基酸中英文名称第50-51页
附录二 计算折叠排斥势能的Matlab 源程序第51-54页

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