中文摘要 | 第1-6页 |
英文摘要 | 第6-9页 |
第一章 引言 | 第9-17页 |
·蛋白质结构 | 第9-10页 |
·蛋白质折叠 | 第10-14页 |
·体外蛋白质折叠 | 第11页 |
·体内蛋白质折叠 | 第11-12页 |
·分子伴侣 | 第12页 |
·蛋白质折叠的热力学与动力学控制 | 第12-14页 |
·蛋白质去折叠 | 第14页 |
·蛋白质折叠速率预测 | 第14-15页 |
·生物信息学数据源与计算工具 | 第15页 |
·研究设想 | 第15-17页 |
第二章 以氨基酸序列预测双态蛋白质的折叠速率 | 第17-24页 |
·材料与方法 | 第17-21页 |
·数据来源 | 第17-20页 |
·模型 | 第20-21页 |
·结果与讨论 | 第21-24页 |
第三章 以排斥势能预测蛋白质去折叠速率和活化自由能 | 第24-35页 |
·材料与方法 | 第24-29页 |
·蛋白质的去折叠速率常数 | 第24-25页 |
·蛋白质的活化自由能 | 第25-26页 |
·蛋白质中的原子坐标 | 第26-27页 |
·折叠模型的建立 | 第27-29页 |
·结果与讨论 | 第29-35页 |
·去折叠速率是势能的函数 | 第29-31页 |
·活化自由能是势能的函数 | 第31-33页 |
·对折叠排斥势能的分析 | 第33-35页 |
第四章 以两面角预测蛋白质折叠动力学参数 | 第35-43页 |
·材料与方法 | 第35-40页 |
·两面角及拉氏构象图 | 第35-36页 |
·模型的建立 | 第36页 |
·蛋白质的折叠速率常数 | 第36-39页 |
·蛋白质的去折叠速率常数 | 第39页 |
·蛋白质的活化自由能 | 第39-40页 |
·结果与讨论 | 第40-43页 |
·折叠速率是两面角总距离的函数 | 第40-41页 |
·去折叠速率是两面角总距离的函数 | 第41-42页 |
·活化自由能是两面角总距离的函数 | 第42-43页 |
第五章 总结论 | 第43-44页 |
参考文献 | 第44-48页 |
攻读硕士期间发表的论文 | 第48-49页 |
致谢 | 第49-50页 |
附录一 20 种标准氨基酸中英文名称 | 第50-51页 |
附录二 计算折叠排斥势能的Matlab 源程序 | 第51-54页 |