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侵染花生的Cucumoviruses病毒基因组全序列分析和转基因抗性研究

摘要第1-7页
Abstract第7-12页
第一章 文献综述第12-26页
 1 花生和花生病毒病第12-14页
   ·花生的经济重要性第12页
   ·花生病毒病第12-14页
     ·花生病毒病的概况第12-13页
     ·我国花生病毒病的特点第13-14页
 2 侵染花生的两种黄瓜花叶病毒属(Cucumovirus)病毒第14-22页
   ·黄瓜花叶病毒属第14页
   ·黄瓜花叶病毒第14-19页
     ·分类地位和亚组划分第15-16页
     ·基因组的组成与结构第16-17页
     ·蛋白质的功能第17页
     ·变异和进化第17-18页
     ·蚜传机制第18-19页
   ·花生矮化病毒第19-22页
     ·基因组的结构和功能第19-20页
     ·病毒株系和亚组第20-21页
     ·PSV的变异第21-22页
 3 植物转基因病毒抗性第22-24页
   ·RNA沉默的发现第22-23页
   ·RNA沉默的机制第23-24页
   ·RNA沉默的应用第24页
 4 本研究的目的和意义第24-26页
第二章 花生矮化病毒基因组克隆和全序列分析第26-40页
 1 引言第26页
 2 实验材料第26页
   ·病毒第26页
   ·试剂第26页
 3 实验方法第26-29页
   ·病毒提纯第26-27页
   ·病毒RNA提取第27页
   ·病毒RNAs的RT-PCR扩增第27-28页
     ·病毒RNAs的5'终端片段扩增采用5'-Race方法第27-28页
     ·RT-PCR扩增病毒RNAs的cDNA第28页
   ·PCR产物回收第28页
   ·连接反应第28页
   ·大肠杆菌感受态的制备及转化第28页
   ·电击转化第28页
   ·质粒小量提取第28-29页
   ·酶切鉴定第29页
   ·cDNA的序列测定第29页
   ·cDNA序列的计算机分析第29页
 4 实验结果第29-35页
   ·5'Race的结果第29页
   ·PSV RNAs cDNA的克隆和鉴定第29-30页
   ·PSV全序列结果第30-35页
     ·病毒核酸大小和结构分析第30-34页
     ·PSV-Mi与其它PSV株系基因组结构的比较第34-35页
   ·PSV与相关病毒核苷酸和氨基酸序列同源性的比较第35页
   ·系统进化树绘制第35页
 5 讨论和分析第35-40页
第三章 侵染花生的两个黄瓜花叶病毒株系基因组克隆和全序列分析第40-63页
 1 引言第40页
 2 实验材料第40页
   ·病毒材料第40页
   ·试剂第40页
 3 实验方法第40-42页
   ·植物总RNA的提取第40-41页
   ·引物设计第41页
   ·cDNA合成第41-42页
   ·cDNA克隆和鉴定参照上一章PSV-Mi的实验方法第42页
   ·序列测定、序列同源性比较和系统进化树的绘制第42页
 4 结果与分析第42-56页
   ·CMV-CA和CS基因组的RT-PCR扩增及克隆第43-44页
   ·CMV-CA和CS基因组的核苷酸序列及蛋白翻译第44-50页
   ·核苷酸、氨基酸序列同源性比较第50-52页
   ·CA和CS与CMV不同亚组株系RNA3的5'NTRs结构比较第52-53页
   ·基因组编码的5个ORFs核苷酸序列的系统进化树分析第53-56页
 5 讨论第56-63页
第四章 单价和多价反向重复序列载体的构建和转基因抗性研究第63-86页
 1 引言第63页
 2 实验材料第63-64页
   ·质粒和菌株第63-64页
   ·试剂第64页
   ·植物材料第64页
   ·毒源第64页
   ·抗体第64页
   ·引物第64页
 3 实验方法第64-69页
   ·拼接PCR第64-65页
   ·拼接片段或PCR产物克隆至pGEM-Teasy载体第65页
   ·BP重组反应第65-66页
   ·LR重组反应第66页
   ·农杆菌感受态细胞制备及电击转化第66页
   ·烟草的转化第66页
   ·基因组DNA的小量提取第66-67页
   ·基因组DNA的PCR扩增第67页
   ·转基因植株的抗病性检测第67页
   ·转基因植株的siRNA的提取第67-68页
   ·siRNA的Northern-blot第68-69页
     ·siRNA电泳第68页
     ·siRNA转膜第68页
     ·探针制备第68页
     ·siRNA杂交第68-69页
 4 实验结果第69-83页
   ·拼接PCR第69-70页
     ·将3种病毒150bp片段拼接为450bp片段。第69-70页
     ·将3种病毒500bp片段拼接为1500bp片段。第70页
   ·拼接片段或者PStV cp基因克隆至pGEM-Teasy载体第70-71页
     ·450bp拼接片段克隆至pGEM-Teasy载体并鉴定第70-71页
     ·PStV cp克隆至pGEM-Teasy载体并鉴定第71页
     ·1500bp拼接片段克隆至pGEM-Teasy载体并鉴定第71页
   ·BP重组第71-74页
     ·pDONR450的鉴定第72-73页
     ·pDONRcp的鉴定第73页
     ·pDONP1500的鉴定第73-74页
   ·LR重组第74-77页
     ·pK450的鉴定第74-75页
     ·pKcp的鉴定第75-76页
     ·pK1500的鉴定第76-77页
   ·转基因烟草PCR检测第77页
   ·转基因烟草对病毒的抗性检测第77-81页
     ·转基因烟草T0代的抗性检测第78-79页
     ·转基因烟草T1代的抗性检测第79-81页
     ·转基因烟草T2代的抗性检测第81页
   ·转基因烟草的siRNA检测第81-83页
 5 讨论第83-86页
结论第86-87页
参考文献第87-95页
缩略词(Abbreviation)第95-96页
致谢第96-97页
作者简介第97页

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