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猪脂蛋白脂酶(LPL)和激素敏感脂肪酶(HSL)基因的序列和多态性分析及体外表达的研究

摘要第1-11页
Abstract第11-13页
第一章 文献综述第13-35页
 1 导言第13-23页
  1.1 概述第13页
  1.2 分子育种研究策略第13-14页
  1.3 主要的分子标记第14-20页
   1.3.1 RFLP标记第14-15页
   1.3.2 RAPD标记第15页
   1.3.3 微卫星标记第15-16页
   1.3.4 AFLP标记第16-18页
   1.3.5 PCR-SSCP第18-19页
   1.3.6 SNP标记第19-20页
  1.4 分子标记在动物遗传育种中的应用第20-23页
   1.4.1 遗传多样性的研究第20-21页
   1.4.2 基因图谱的构建第21页
   1.4.3 猪的起源及群体亲缘关系的研究第21页
   1.4.4 猪的抗病育种第21-22页
   1.4.5 标记辅助选择第22-23页
   1.4.6 标记辅助导入第23页
 2 影响脂肪代谢的重要候选基因第23-27页
  2.1 心脏脂肪酸结合蛋白基因第24页
  2.1.1 H-FABP基因的序列分析及其定位第24页
  2.1.2 H-FABP基因的遗传变异第24-25页
  2.1.3 猪的H-BFAP基因的遗传变异及其与肌内脂肪含量的关系第25页
  2.2 脂肪组织脂肪酸结合蛋白基因第25页
  2.3 OB基因第25-26页
  2.4 MO4R第26页
  2.5 过氧化物酶增殖体激活受体γ(PPARγ)基因第26-27页
 3 HSL和 LPL是影响脂肪代谢的重要候选基因第27-35页
  3.1 激素敏感脂肪酶第27页
  3.1.1 HSL特性第27-28页
  3.1.2 HSL基因分子生物学的研究进展第28-29页
  3.1.3 HSL基因的分子结构特点第29-30页
  3.2 脂蛋白脂酶第30页
  3.2.1 特性第30-31页
  3.2.2 LPL基因的定位及序列分析第31-32页
  3.2.3 LPL基因分子生物学的研究进展第32-35页
第二章 实验目的和意义第35-36页
第三章 材料和方法第36-46页
 1 材料第36-38页
  1.1 试验猪群与性状测定第36页
  1.2 主要仪器和设备第36-37页
  1.3 主要试剂第37页
  1.4 缓冲液和常用试剂的配制第37-38页
 2 实验方法第38-46页
  2.1 猪基因组 DNA的提取第38页
  2.2 基因组 DNA的浓度测定和质量检测第38-39页
  2.3 实验引物设计第39页
  2.4 样品采集及猪脂肪组织总 RNA的提取第39-40页
   2.4.1 样品的采集第39页
   2.4.2 脂肪组织总 RNA的提取第39-40页
   2.4.3 RNA变性电泳第40页
  2.5 不同品种猪cDNA第一链的合成第40-41页
   2.5.1 RT-PCR试剂第40-41页
   2.5.2 RT-PCR反应体系第41页
   2.5.3 RT-PCR反应产物的检测第41页
  2.6 RT-PCR产物的回收、纯化、克隆测序第41-43页
   2.6.1 RT-PCR产物回收与纯化第41-42页
   2.6.2 RT-PCR产物的克隆第42-43页
   2.6.3 感受态细胞的制备第43页
   2.6.4 连接产物的转化第43页
   2.6.5 阳性克隆子鉴定及测序第43页
  2.7 LPL内含子3、5及 PCR-RFLP扩增引物第43-45页
   2.7.1 引物设计第43-44页
   2.7.2 PCR扩增第44页
   2.7.3 PCR反应条件第44-45页
   2.7.4 PCR产物及酶切后的检测第45页
  2.8 数据处理分析第45-46页
   2.8.1 统计软件第45页
   2.8.2 基因效应统计分析模型第45-46页
第四章 结果与分析第46-67页
 4.1 脂肪组织总 RNA的提取第46页
 4.2 RT-PCR扩增结果第46-47页
 4.3 不同品种猪cDNA片段的克隆、测序及序列分析第47-48页
 4.4 LPL内含子3、5的扩增和序列测定第48-49页
 4.5 LPL内含子3、5的多态性与性状间的关系第49-67页
  4.5.1 LPL基因内含子3中NheI中多态性位点的遗传效应分析第49-53页
  4.5.2 LPL基因内含子3中EcoT22I中多态性位点的遗传效应分析第53-55页
  4.5.3 LPL基因内含子3中NcoI中多态性位点的遗传效应分析第55-60页
  4.5.4 LPL基因内含子5中AfaI中多态性位点的遗传效应分析第60-64页
  4.5.5 LPL基因内含子5中ScaI中多态性位点的遗传效应分析第64-67页
第五章 讨论第67-72页
 5.1 脂肪组织 RNA的提取第67页
 5.2 RT-PCR及 PCR产物的克隆第67-68页
 5.3 关于HSL和 LPLcDNA的进化树分析第68-69页
 5.4 关于内含子3、5中的 SNPs第69-72页
第六章 结论第72-73页
第七章 HSL和LPL基因的克隆表达第73-87页
 7.1 大肠杆菌表达系统第74-76页
 7.2 原核表达载体的基本类型第76-77页
 7.3 大肠杆菌的表达产物第77-80页
  7.3.1 表达产物的处理-超声波处理法第77页
  7.3.2 可溶性表达产物的提取第77-78页
  7.3.3 包涵体的形成第78-79页
  7.3.4 包涵体的复性和纯化第79-80页
 7.4 嗜甲醇酵母巴斯德毕赤酵母表达系统第80-86页
  7.4.1 巴斯德毕赤酵母第81-82页
  7.4.2 表达载体第82-83页
  7.4.3 受体菌第83页
  7.4.4 表达载体与 R.pastoris基因组整合第83-84页
  7.4.5 巴斯德毕赤酵母表达菌株的生长第84-85页
  7.4.6 分泌蛋白的翻译后修饰第85-86页
 7.5 研究的目的意义第86-87页
第八章 材料与方法第87-94页
 8.1 实验材料第87-90页
  8.1.1 载体及菌株第87-88页
  8.1.2 实验所用引物第88-89页
  8.1.3 主要药品、试剂及溶液的配制第89-90页
   8.1.3.1 工具酶第89页
   8.1.3.2 抗生素类第89页
   8.1.3.3 细菌培养基第89页
   8.1.3.4 质粒抽提第89页
   8.1.3.5 SDS-聚丙烯酰胺凝胶电泳第89-90页
   8.1.3.6 包涵体的提取相关溶液第90页
   8.1.3.7 其它缓冲液第90页
 8.2 实验方法第90-94页
  8.2.1 质粒的小量制备第90页
  8.2.2 重组质粒的鉴定第90-91页
   8.2.2.1 重组质粒的快速鉴定第90-91页
   8.2.2.2 重组质粒的酶切鉴定第91页
  8.2.3 诱导表达第91页
  8.2.4 表达蛋白的鉴定第91页
   8.2.4.1 重组菌菌体的裂解第91页
   8.2.4.2 SDS-PAGE第91页
  8.2.5 包涵体提取第91-92页
  8.2.6 不可溶性表达产物的溶解和复性第92页
  8.2.7 SDS-PAGE电泳第92页
  8.2.8 LPL 酶活性测定第92-94页
第九章 结果与分析第94-102页
 9.1 HSL和LPL基因编码序列的 PCR扩增、克隆第94-95页
 9.2 表达质粒的构建与鉴定第95-97页
  9.2.1 LPL基因的表达载体的构建第95-96页
  9.2.2 HSL基因的表达质粒的构建第96-97页
 9.3 HSL和 LPL重组菌菌体裂解物的 SDS-PAGE电泳结果第97-98页
 9.4 包涵体的提取及检测第98-99页
 9.5 LPL表达产物酶活性的检测第99页
 9.6 酵母表达载体的构建与鉴定第99-100页
  9.6.1 酵母表达引物的扩增第99-100页
  9.6.2 HSL和LPL目的片段与表达载体的连接第100页
  9.6.3 重组酵母表达载体的酶切鉴定第100页
 9.7 pPIC9K-HSL/pPIC9K-LPL在巴斯德毕赤酵母菌中的诱导表达第100-101页
 9.8 蛋白浓度测定第101页
 9.9 LPL表达产物酶活性的检测第101-102页
第十章 讨论第102-104页
 10.1 表达产物的提取第102页
 10.2 影响包涵体形成的因素第102页
 10.3 包涵体的纯化第102-103页
 10.4 包涵体的溶解及复性第103页
 10.5 酵母表达蛋白的糖基化分析第103-104页
第十一章 小结第104-105页
参考文献第105-117页
附录第117-119页
致谢第119页

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