基因组序列标注的算法与理论研究
| 摘要 | 第1-8页 |
| Abstract | 第8-10页 |
| 第一章 绪论 | 第10-18页 |
| 1．1 引言 | 第10-11页 |
| 1．2 研究背景 | 第11-15页 |
| 1．2．1 基因组序列标注 | 第11-12页 |
| 1．2．2 基因识别的相关研究 | 第12-14页 |
| 1．2．3 功能元件识别的相关研究 | 第14-15页 |
| 1．3 论文的主要工作与创新 | 第15-17页 |
| 1．4 论文的结构 | 第17-18页 |
| 第二章 基因及其表达 | 第18-28页 |
| 2．1 基因组、DNA和基因 | 第18-20页 |
| 2．2 遗传密码 | 第20-22页 |
| 2．3 基因的结构 | 第22-24页 |
| 2．4 基因的表达与调控 | 第24-27页 |
| 2．5 小结 | 第27-28页 |
| 第三章 广义隐 Markov模型与基因识别 | 第28-52页 |
| 3．1 隐Markov模型的基本理论 | 第28-36页 |
| 3．1．1 隐 Markov模型 | 第28-30页 |
| 3．1．2 HMM的基本算法 | 第30-34页 |
| 3．1．3 HMM算法的数值稳定性 | 第34-36页 |
| 3．2 广义隐 Markov模型 | 第36-38页 |
| 3．3 GHMM 在原核生物基因识别中的应用 | 第38-52页 |
| 3．3．1 概述 | 第38页 |
| 3．3．2 模型 | 第38-43页 |
| 3．3．3 算法 | 第43-46页 |
| 3．3．4 后处理过程 | 第46-49页 |
| 3．3．5 测试与讨论 | 第49-52页 |
| 第四章 人类基因识别 | 第52-74页 |
| 4．1 概述 | 第52-53页 |
| 4．2 模型 | 第53-66页 |
| 4．2．1 模型框架 | 第53-55页 |
| 4．2．2 区域模型 | 第55-61页 |
| 4．2．3 信号模型 | 第61-66页 |
| 4．3 算法与实现 | 第66-70页 |
| 4．4 结果与讨论 | 第70-74页 |
| 第五章 DNA序列中的模式发现 | 第74-96页 |
| 5．1 概述 | 第74-75页 |
| 5．2 方法 | 第75-79页 |
| 5．3 算法实现 | 第79-81页 |
| 5．4 复杂度与误差分析 | 第81-86页 |
| 5．5 算法测试 | 第86-89页 |
| 5．6 算法的改进 | 第89-92页 |
| 5．7 组合模式发现 | 第92-94页 |
| 5．8 小结 | 第94-96页 |
| 第六章 重复序列识别 | 第96-110页 |
| 6．1 概述 | 第96-97页 |
| 6．2 算法 | 第97-102页 |
| 6．3 算法测试 | 第102-108页 |
| 6．4 小结 | 第108-110页 |
| 第七章 结束语 | 第110-112页 |
| 7．1 总结 | 第110-111页 |
| 7．2 进一步研究的建议 | 第111-112页 |
| 致谢 | 第112-114页 |
| 参考文献 | 第114-122页 |
| 作者在攻读博士期间撰写的论文 | 第122页 |
