| 引言 | 第1-10页 |
| 第一章 生物信息学与基因结构 | 第10-17页 |
| 1 生物信息学 | 第10-13页 |
| ·生物学数据库 | 第11页 |
| ·生物信息学的主要研究内容 | 第11-13页 |
| 2 基因的一般特征 | 第13-17页 |
| ·原核生物的基因结构 | 第13-14页 |
| ·真核生物的基因结构 | 第14-17页 |
| 第二章 基因识别基础及目前的算法评价 | 第17-21页 |
| 1 基因识别基础 | 第17-18页 |
| 2 目前存在的识别算法及其计算精度 | 第18-21页 |
| 第三章 参数定义 | 第21-26页 |
| 1 非均匀指标(IHI) | 第21页 |
| 2 多样性增量 | 第21-22页 |
| 3 多样性增量的推广 | 第22-24页 |
| 4 算法精度评估系数 | 第24-26页 |
| 第四章 酵母基因组中ORF的识别及特征研究 | 第26-39页 |
| 1 数据库 | 第27页 |
| 2 结果和讨论 | 第27-39页 |
| ·框架随机性和独立性 | 第27-30页 |
| ·ORF重叠的统计分析 | 第30-31页 |
| ·第一ATG规则 | 第31-35页 |
| ·编码倾向性预测 | 第35-36页 |
| ·假ORF的判别 | 第36-39页 |
| 第五章 线虫基因组中外显子与内含子序列特征研究 | 第39-46页 |
| 1 数据库 | 第39页 |
| 2 非均匀性指标的推广 | 第39-40页 |
| 3 统计与分析 | 第40-45页 |
| ·同类组合 | 第40-43页 |
| ·异类组合 | 第43-45页 |
| 4 讨论 | 第45-46页 |
| 第六章 大肠杆菌、酵母和线虫基因组中ORF和exon的识别 | 第46-55页 |
| 1 数据库 | 第46-47页 |
| 2 方法 | 第47-48页 |
| 3 结果 | 第48-50页 |
| ·大肠杆菌和酵母基因组中ORF和基因间序列的识别 | 第48-49页 |
| ·线虫基因组中内含子、外显子及基因间序列的识别 | 第49-50页 |
| 4 讨论 | 第50-55页 |
| 第七章 几种模式生物和人类基因的剪切位点的预测及Intron和Exon的识别 | 第55-70页 |
| 1 数据库 | 第56-57页 |
| 2 识别算法的参数定义 | 第57-58页 |
| 3 基于多样性增量的二次判别分析法(IDQD)方法 | 第58-60页 |
| 4 结果 | 第60-67页 |
| ·衡量预测精度的敏感性、特异性系数与预测正确的百分数 | 第60页 |
| ·应用2-fold交叉检验的预测结果 | 第60-62页 |
| ·应用10-fold交叉检验的预测结果 | 第62-64页 |
| ·与GeneSplicer的比较 | 第64-67页 |
| 5 讨论 | 第67-70页 |
| 进一步工作思路 | 第70-73页 |
| 参考文献 | 第73-79页 |
| 英文摘要 | 第79-82页 |
| 致谢 | 第82页 |
