| 摘要 | 第1-8页 |
| Abstract | 第8-13页 |
| 1 前言 | 第13-40页 |
| ·洋脊概况 | 第13-14页 |
| ·洋脊的地球化学性质研究 | 第14-17页 |
| ·热液口周围生态环境微生物研究 | 第17-21页 |
| ·热液微生物在物质循环中的作用 | 第21-24页 |
| ·微生物分子生态学研究的主要方法 | 第24-31页 |
| ·分子进化的研究方法 | 第31-32页 |
| ·系统进化树的构建方法 | 第32-35页 |
| ·系统进化树构建常用软件 | 第35-36页 |
| ·系统进化树构建方法及软件的选择 | 第36-38页 |
| ·研究目的和意义 | 第38-40页 |
| 2 材料与方法 | 第40-59页 |
| ·试验材料与所用设备 | 第40-49页 |
| ·试验基本方法 | 第49-59页 |
| 3 结果与分析 | 第59-112页 |
| ·胡安得富卡热液场硫化物矿物组成分析 | 第59-60页 |
| ·4148 烟囱矿物分析 | 第59页 |
| ·4136-1 硫化物矿物分析 | 第59-60页 |
| ·4143-1 硫化物矿物分析 | 第60页 |
| ·胡安得富卡热液场中氨氧化古菌的多样性及其定量研究 | 第60-73页 |
| ·胡安得富卡热液场硫化物岩石中氨氧化古菌定量 | 第60-64页 |
| ·胡安得富卡热液场硫化物岩石中氨氧化古菌多样性分析 | 第64-68页 |
| ·胡安得富卡热液场硫化物4136-1 古菌多样性分析 | 第68-73页 |
| ·洋脊热液区沉积物氨氧化古菌多样性及其定量研究 | 第73-100页 |
| ·洋脊热液地区15 个沉积物和西太平洋1 个沉积物的化学参数测定结果 | 第73-75页 |
| ·洋脊热液地区15 个沉积物和西太平洋1 个沉积物的165 rRNA、古菌和细菌amoA 的定量结果与分析 | 第75-78页 |
| ·基因定量结果与化学数据及硝化潜势的相关和回归关系分析 | 第78-83页 |
| ·洋脊热液区沉积物氨氧化古菌amoA 多样性分析 | 第83-91页 |
| ·洋脊热液区沉积物古菌165 rRNA 多样性分析 | 第91-100页 |
| ·胡安得富卡热液场甲烷菌多样性研究及其与环境的关系 | 第100-106页 |
| ·甲烷菌甲基辅酶M 编码基因mcrA 的文库构建及测序 | 第101页 |
| ·甲烷菌甲基辅酶M 编码基因mcrA 序列分析及多样性评估 | 第101-103页 |
| ·甲烷菌甲基辅酶M 编码基因mcrA 系统进化分析 | 第103-105页 |
| ·热液口金属硫化物甲烷菌类型分析 | 第105页 |
| ·金属硫化物岩石中甲烷菌类型与环境的关系 | 第105-106页 |
| ·墨西哥湾甲烷菌多样性研究及其与环境的关系 | 第106-112页 |
| ·墨西哥湾沉积物mcrA 基因的文库构建、RFLP 分析与测序 | 第106-107页 |
| ·墨西哥湾沉积物mcrA 基因序列分析及多样性评估 | 第107页 |
| ·墨西哥湾沉积物甲烷菌mcrA 基因同源比对结果与分析 | 第107-108页 |
| ·墨西哥湾沉积物甲烷菌mcrA 基因系统进化分析 | 第108-110页 |
| ·墨西哥湾沉积物不同层次甲烷菌类型比较 | 第110页 |
| ·墨西哥湾沉积物甲烷菌类型分析 | 第110-112页 |
| 4. 讨论 | 第112-117页 |
| ·海洋中古菌与细菌在氨氧化过程中的作用 | 第112-113页 |
| ·海洋中的甲烷产生与厌氧甲烷氧化作用 | 第113-115页 |
| ·微生物分子生态研究的定量研究方法 | 第115-117页 |
| 5 总结 | 第117-118页 |
| 参考文献 | 第118-132页 |
| 附录1 缩写词表（Abbreviations） | 第132-133页 |
| 附录2 载体pMD-18T 图谱: | 第133-134页 |
| 附录3 主要采样设备 | 第134-136页 |
| 致谢 | 第136-137页 |
| 个人简历、在学期间发表的学术论文与研究成果 | 第137页 |
