基于子图密度的序列模体发现算法研究
| 摘要 | 第1-4页 |
| Abstract | 第4-7页 |
| 第一章 绪论 | 第7-13页 |
| ·研究背景 | 第7-10页 |
| ·研究目的和意义 | 第10-12页 |
| ·本文的主要研究内容和结构 | 第12-13页 |
| 第二章 DNA序列模体发现算法研究 | 第13-31页 |
| ·模体的相关定义及表示方法 | 第13-18页 |
| ·DNA序列模体的建模 | 第18-21页 |
| ·模体相关的图问题 | 第18-19页 |
| ·得分函数的构造 | 第19-21页 |
| ·模体发现算法设计 | 第21-23页 |
| ·动态规划方法 | 第21-22页 |
| ·贪心算法 | 第22页 |
| ·数学统计方法 | 第22-23页 |
| ·模体发现算法分析 | 第23-31页 |
| ·统计模型发现算法 | 第23-27页 |
| ·一致序列模型发现算法 | 第27-31页 |
| 第三章 稠密子图搜索的序列模体发现算法 | 第31-41页 |
| ·问题定义 | 第31-33页 |
| ·算法设计 | 第33-37页 |
| ·算法思想 | 第33页 |
| ·图的建立 | 第33-34页 |
| ·最大密度子图搜索 | 第34-36页 |
| ·算法性能评价标准的选择 | 第36-37页 |
| ·复杂度分析 | 第37-38页 |
| ·小结 | 第38-41页 |
| 第四章 实验结果及分析 | 第41-49页 |
| ·合成数据 | 第41-44页 |
| ·LexA数据库 | 第44-46页 |
| ·比较与分析 | 第46-47页 |
| ·小结 | 第47-49页 |
| 第五章 总结与展望 | 第49-51页 |
| 致谢 | 第51-53页 |
| 参考文献 | 第53-57页 |
| 研究成果 | 第57页 |