| 摘要 | 第1-7页 |
| ABSTRACT | 第7-15页 |
| 第一章 文献综述 | 第15-47页 |
| 第1节 植物根际促生细菌 | 第15-18页 |
| ·植物根际促生细菌 | 第15-17页 |
| ·PGPR 生物防治 | 第17页 |
| ·假单胞菌－最佳的生防菌 | 第17-18页 |
| 第2节 假单胞菌的生防机制 | 第18-24页 |
| ·根际定殖 | 第18-19页 |
| ·系统抗性的诱导 | 第19页 |
| ·分泌铁载体 | 第19-20页 |
| ·分泌抗生素 | 第20-24页 |
| ·抗生素的种类及多样性 | 第20-22页 |
| ·抑制疾病的作用机制 | 第22页 |
| ·几种典型抗生素的特点 | 第22-24页 |
| 第3节 吩嗪合成及分子调控机制 | 第24-35页 |
| ·吩嗪的简介 | 第24-25页 |
| ·吩嗪的生物合成和功能 | 第25-28页 |
| ·吩嗪生物合成的调控 | 第28-35页 |
| ·全局调控系统 | 第28-29页 |
| ·群体感应 | 第29-32页 |
| ·环境因素的调控 | 第32-33页 |
| ·Small RNA 的调控 | 第33-35页 |
| 第4节 商业化农用抗生素的发展 | 第35-44页 |
| ·菌株的筛选与改良 | 第36-37页 |
| ·发酵培养基的优化 | 第37-40页 |
| ·发酵过程优化的代谢调控 | 第40-44页 |
| ·系统生物学方法整体提高菌株和发酵优化 | 第44页 |
| 第5节 本课题研究目的、内容及意义 | 第44-47页 |
| 第二章 假单胞菌M18 吩嗪合成基因簇特点及功能分析 | 第47-62页 |
| ·引言 | 第47-48页 |
| ·材料与方法 | 第48-52页 |
| ·菌株及引物 | 第48-49页 |
| ·培养基与培养条件 | 第49页 |
| ·PCR 的引物及反应条件 | 第49-50页 |
| ·DNA 提取，胶回收，质粒抽提 | 第50页 |
| ·酶切和酶连反应 | 第50-51页 |
| ·细菌接合转移 | 第51页 |
| ·生长曲线测定及PCA 定量 | 第51-52页 |
| ·结果与分析 | 第52-59页 |
| ·phz 合成基因簇PCR 扩增与测序 | 第52-53页 |
| ·phz 合成基因簇上下游基因PCR 扩增与测序 | 第53-54页 |
| ·两个phz 基因簇扩增，体外突变 | 第54-57页 |
| ·构建两个phz 基因突变菌株M18P1 和M18P2 和验证 | 第57-58页 |
| ·phz1 和 phz2 基因簇对 PCA 合成的影响 | 第58-59页 |
| ·讨论 | 第59-62页 |
| 第三章 GacA 和QS 对假单胞菌M18 两个phz 基因簇调控 | 第62-87页 |
| ·引言 | 第62-63页 |
| ·材料和方法 | 第63-71页 |
| ·菌株和质粒 | 第63-64页 |
| ·构建两个phz 基因的突变菌株M18GP1 和M18GP2 及验证 | 第64-65页 |
| ·RNA 提取步骤 | 第65-66页 |
| ·DNase 处理 RNA 样品 | 第66页 |
| ·反转录 | 第66-67页 |
| ·5’race 方法确定转录起始位点 | 第67-69页 |
| ·RT-PCR 测定phz 基因簇表达的转录物 | 第69-70页 |
| ·转录融合 phz1-lacZ 及 phz2-lacZ 的构建 | 第70页 |
| ·β-半乳糖苷酶活性测定 | 第70-71页 |
| ·结果与分析 | 第71-83页 |
| ·GacA 对两个phz 吩嗪簇产PCA 的调控 | 第71-73页 |
| ·RT-PCR 检测 gacA 对 phz1，phz2 表达的调控作用 | 第73-74页 |
| ·确定两个phz 基因簇转录起始位点 | 第74-76页 |
| ·GacA 对两个phz 合成基因簇的区别性调控 | 第76-77页 |
| ·两个phz 基因簇调控区域系统缺失及GacA 的调控作用 | 第77-81页 |
| ·群体感应系统 RhlR 和 LasR 对 phz1 和 phz2 基因簇的调控作用 | 第81-83页 |
| ·讨论 | 第83-87页 |
| 第四章 环境条件对PCA 合成的调控 | 第87-101页 |
| ·引言 | 第87-88页 |
| ·材料和方法 | 第88-89页 |
| ·菌株、培养基和培养条件 | 第88页 |
| ·环境条件对细胞生长和PCA 产量的影响 | 第88-89页 |
| ·营养条件对细胞生长和PCA 产量的影响 | 第89页 |
| ·细胞浓度和PCA 测定 | 第89页 |
| ·统计分析 | 第89页 |
| ·结果和分析 | 第89-98页 |
| ·假单胞菌 M18 中 PCA 生产依赖于细胞的生长，并受gacA 基因负调控 | 第89-90页 |
| ·环境条件（pH，温度，氧浓度）的影响 | 第90-94页 |
| ·营养因素对细胞生长和PCA 产量的影响 | 第94-98页 |
| ·讨论 | 第98-101页 |
| 第五章 响应面方法优化M18G 菌株发酵培养基 | 第101-115页 |
| ·引言 | 第101-102页 |
| ·材料和方法 | 第102-104页 |
| ·菌种和培养基 | 第102页 |
| ·试验方法 | 第102-104页 |
| ·结果与分析 | 第104-113页 |
| ·PB 设计筛选关键营养组分 | 第104-106页 |
| ·RSM 优化培养基组分模型的建立及分析 | 第106-109页 |
| ·营养成分的影响及其相互关系 | 第109-112页 |
| ·发酵罐验证 | 第112-113页 |
| ·讨论 | 第113-115页 |
| 第六章分批发酵和流加发酵优化控制策略 | 第115-142页 |
| ·引言 | 第115-116页 |
| ·材料与方法 | 第116-119页 |
| ·菌株、培养基和培养条件 | 第116页 |
| ·发酵罐发酵 | 第116-117页 |
| ·发酵液中残糖的测定 | 第117-118页 |
| ·pH 值和溶氧浓度(DO )控制 | 第118页 |
| ·葡萄糖流加的控制 | 第118页 |
| ·发酵参数测量方法 | 第118-119页 |
| ·结果与分析 | 第119-139页 |
| ·转速的影响 | 第119-124页 |
| ·分批发酵动力学及模型建立 | 第124-127页 |
| ·发酵模型的分析和验证 | 第127-129页 |
| ·分批发酵过程的pH 控制 | 第129-131页 |
| ·转速和pH 值联合控制 | 第131-132页 |
| ·初糖浓度的影响 | 第132-133页 |
| ·溶氧浓度控制 | 第133-135页 |
| ·以溶氧浓度变化为反馈指标流加发酵 | 第135-137页 |
| ·流加发酵控制结果分析 | 第137-139页 |
| ·讨论 | 第139-142页 |
| 总结及展望 | 第142-145页 |
| 创新点 | 第145-146页 |
| 参考文献 | 第146-166页 |
| 附录II 实验所使用的主要仪器及设备 | 第166-168页 |
| 致谢 | 第168-169页 |
| 攻读学位期间(待)发表的学术论文 | 第169-171页 |
