| 摘要 | 第1-8页 |
| ABSTRACT | 第8-19页 |
| 第一章 绪论 | 第19-25页 |
| ·复杂体系 | 第19页 |
| ·复杂体系的定义、特点及研究方法 | 第19页 |
| ·本文所涉及的复杂体系 | 第19页 |
| ·计算机辅助药物设计的相关原理及意义 | 第19-21页 |
| ·计算机辅助药物设计的的产生背景及相关原理 | 第19-20页 |
| ·计算机辅助药物设计的分类 | 第20页 |
| ·计算机辅助药物设计的意义及发展前景 | 第20-21页 |
| ·计算机辅助药物设计的理论应用 | 第21-22页 |
| ·分子动力学模拟 | 第21页 |
| ·定量构效关系 | 第21-22页 |
| ·分子对接 | 第22页 |
| ·复杂体系生物物理化学行为理论研究的意义 | 第22-23页 |
| ·人造螺旋理论研究的意义 | 第22-23页 |
| ·TTR淀粉化抑制剂分子研究的意义 | 第23页 |
| ·论文研究的主要内容 | 第23-25页 |
| 第二章 理论计算的原理与方法 | 第25-35页 |
| ·分子模拟 | 第25-29页 |
| ·分子模拟简介 | 第25页 |
| ·分子动力学方法 | 第25-26页 |
| ·分子力学能量最小化方法 | 第26页 |
| ·分子力场 | 第26-29页 |
| ·定量构效关系研究 | 第29-32页 |
| ·QSAR的发展历史 | 第29-30页 |
| ·常用的QSAR研究方法 | 第30-31页 |
| ·3D-QSAR研究的基本步骤 | 第31-32页 |
| ·分子对接 | 第32-35页 |
| ·分子对接的发展历史及基本原理 | 第32-33页 |
| ·分子对接方法 | 第33页 |
| ·常用的分子对接软件 | 第33-35页 |
| 第三章 芳香氨基折叠体双螺旋和四螺旋的稳定性和组装机理的动力学模拟研究 | 第35-63页 |
| ·人造螺旋的设计初衷 | 第35页 |
| ·人造螺旋的合成策略 | 第35-43页 |
| ·芳基和氨基键的旋转限制 | 第36-38页 |
| ·单体初步结合形成低聚物 | 第38-40页 |
| ·由低聚物形成人造螺旋 | 第40-42页 |
| ·低聚物折叠体组成超分子结构 | 第42-43页 |
| ·人造螺旋的研究现状 | 第43-44页 |
| ·本工作研究意义 | 第44-45页 |
| ·材料和方法 | 第45-49页 |
| ·AMBER程序包简介 | 第45-46页 |
| ·7-氨基-8 氟-2-喹啉羧酸单体力场的拟合 | 第46-48页 |
| ·动力学模拟方案 | 第48-49页 |
| ·动力学模拟结果与讨论 | 第49-62页 |
| ·动力学模拟结果 | 第49-57页 |
| ·模拟结果的讨论 | 第57-62页 |
| ·结论 | 第62-63页 |
| 第四章 TTR淀粉化抑制剂分子的3D-QSAR和分子对接研究 | 第63-83页 |
| ·TTR及淀粉化疾病简介 | 第63-65页 |
| ·TTR结构与功能 | 第63页 |
| ·TTR淀粉化疾病治病原因及治疗策略 | 第63-65页 |
| ·TTR淀粉化抑制剂研究现状 | 第65-66页 |
| ·双芳基肟醚类抑制剂分子 | 第65-66页 |
| ·2-芳基苯并恶唑类抑制剂 | 第66页 |
| ·本工作的研究方案 | 第66-67页 |
| ·研究涉及软件介绍 | 第67-70页 |
| ·Schrodinger软件包介绍 | 第67-68页 |
| ·DOCK5.1软件包介绍 | 第68-69页 |
| ·X-Score程序包介绍 | 第69-70页 |
| ·材料及方法 | 第70-74页 |
| ·数据处理 | 第70页 |
| ·工作流程 | 第70-74页 |
| ·结果与讨论 | 第74-82页 |
| ·3D-QSAR研究结果与讨论 | 第74-76页 |
| ·Dock研究结果与讨论 | 第76-80页 |
| ·X-Score重新打分研究 | 第80-82页 |
| ·本章结论 | 第82-83页 |
| 第五章 结论 | 第83-87页 |
| ·人造螺旋体系 | 第83-84页 |
| ·研究取得的成果 | 第83页 |
| ·研究的创新之处 | 第83-84页 |
| ·研究工作的不足 | 第84页 |
| ·TTR淀粉化抑制剂研究 | 第84-87页 |
| ·研究取得的成果 | 第84-85页 |
| ·研究的创新之处 | 第85页 |
| ·研究工作的不足 | 第85-87页 |
| 参考文献 | 第87-92页 |
| 致谢 | 第92-93页 |
| 研究成果及发表的学术论文 | 第93-94页 |
| 作者简介 | 第94页 |
| 导师简介 | 第94-95页 |
| 北京化工大学硕士研究生学位论文答辩委员会决议书 | 第95-96页 |