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蛋白质和配体相互作用研究以及小肽抑制剂设计方法初探

摘要第1-8页
Abstract第8-10页
缩写表第10-11页
第一章 绪论第11-25页
   ·计算机辅助药物设计第11-14页
     ·药物筛选第13-14页
     ·小肽抑制剂设计第14页
   ·蛋白质和配体相互作用第14-19页
     ·分子对接第16-17页
     ·蛋白质全电子结构计算第17页
     ·分子动力学第17-18页
     ·蛋白质表面口袋分析第18页
     ·蛋白质和配体相互作用的两条规则第18-19页
   ·统计理论和隐马可夫模型第19-21页
     ·隐马可夫模型与小肽抑制剂设计第19-21页
 参考文献第21-25页
第一部分 蛋白质和配体相互作用第25-75页
 第二章 背景知识和相关技术第27-51页
   ·蛋白质第27-31页
     ·蛋白质重要性第27页
     ·氨基酸第27-29页
     ·蛋白质的结构第29-30页
     ·解析蛋白质结构的基本方法第30页
     ·配体小分子第30-31页
   ·分子动力学第31-40页
     ·什么是分子动力学第31-32页
     ·分子模拟势场第32-34页
     ·分子动力学模拟过程第34-40页
   ·蛋白质表面口袋计算第40-41页
   ·蛋白质全电子结构计算第41-46页
     ·ODA程序第42-45页
     ·ENFC定理第45-46页
     ·ODA计算流程第46页
   ·配体小分子电子结构计算第46页
   ·分子轨道理论第46-48页
     ·蛋白质的前线轨道第46页
     ·分子轨道理论第46-48页
  参考文献第48-51页
 第三章 蛋白质配体相互作用的两条规则第51-75页
   ·蛋白质配体相互作用的两条规则第51页
   ·结果与讨论第51-72页
     ·FK506和CsA简介第52-53页
     ·复合体CypA/CsA和FKBP12/FK506的空间构象第53-54页
     ·分子动力学第54-55页
     ·CypA/CsA电子结构计算第55-58页
     ·FKBP12/FK506电子结构计算第58-62页
     ·表面口袋计算第62-64页
     ·蛋白质和配体相互作用的两条规则第64-70页
     ·FKBP12的生物活性第70-72页
   ·小结第72-73页
  参考文献第73-75页
第二部分 新统计数学理论和小肽抑制剂设计第75-116页
 第四章 小肽抑制剂设计第77-115页
   ·小肽抑制剂第77-79页
     ·什么是小肽?第77-78页
     ·小肽抑制剂第78-79页
   ·理论知识第79-92页
     ·MJ矩阵第79-83页
     ·残基-残基接触频率第83-86页
     ·数学建模第86-87页
     ·分子对接第87-89页
     ·生物实验方法第89-92页
   ·结果与讨论第92-110页
   Ⅰ 数学模型筛选法第92-101页
     ·流程图第92-93页
     ·设计小肽抑制剂第93-101页
   Ⅱ 理性数据筛选法第101-110页
   ·小结第110-111页
  参考文献第111-115页
 第五章 总结第115-116页
博士期间主要工作和成果第116-117页
致谢第117-118页
个人简历第118-119页
附录第119-127页

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