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天蓝色链霉菌SigT的多效调控作用及其机制研究

摘要第1-5页
Abstract第5-8页
缩写和术语表第8-9页
目录第9-13页
第一章 绪论第13-28页
   ·σ因子概述第13-14页
   ·ECF σ因子第14-17页
   ·σ因子及其相互作用蛋白第17-18页
   ·营养胁迫和天蓝色链霉菌的次级代谢第18-25页
     ·次级代谢调控概述第18-20页
     ·氮源胁迫和次级代谢调控第20-22页
     ·磷酸盐胁迫和次级代谢调控第22-24页
     ·磷酸盐胁迫下次级代谢全局调控子之间的相互作用第24-25页
     ·次级代谢的磷酸盐,碳源和氮源调控之间的关系第25页
   ·细菌中Clp蛋白酶降解途径第25-28页
第二章 rstA缺失株中SigT的降解机制研究第28-63页
   ·引言第28-30页
   ·材料与方法第30-53页
     ·菌种和载体第30-35页
     ·培养基第35-37页
     ·主要试剂和溶液第37-38页
     ·主要仪器设备第38-39页
     ·链霉菌培养第39页
     ·主要PCR程序第39-40页
     ·孢子悬液制备第40页
     ·天蓝色链霉菌基因组提取第40-41页
     ·天蓝色链霉菌结合转导实验第41页
     ·切胶回收第41页
     ·PCR产物纯化第41页
     ·大肠杆菌质粒及柯斯质粒提取第41-42页
     ·高效大肠杆菌感受态的制作第42页
     ·大肠杆菌感受态细胞的转化第42页
     ·DNA片断回收第42-43页
     ·DNA片段去磷酸化第43页
     ·Southern blot实验操作第43-46页
     ·Western blot检测目的蛋白的表达第46-47页
     ·PCR靶向敲除系统第47-53页
   ·结果与讨论第53-62页
     ·将sigT基因导入⊿rstA缺失株以及WT株第53-54页
     ·rstA缺失株中clpP1/clpP2基因的敲除第54-56页
     ·rstA缺失株和野生型中ssrA基因的敲除第56-58页
     ·将sigT基因导入基因型为⊿ssrA⊿rstA和⊿clpP⊿rstA的链霉菌株第58-59页
     ·将sigT基因导入clpP缺失株和ssrA缺失株第59-60页
     ·将rstA-sigT基因导入rstA缺失株第60-61页
     ·Western blot验证rstA缺失株中SigT的降解途径第61-62页
   ·本章小结第62-63页
第三章 SigT在营养胁迫条件下对次级代谢的调控第63-110页
   ·引言第63-65页
   ·材料第65-67页
     ·菌株及载体第65页
     ·药品和试剂第65-66页
     ·主要仪器设备第66-67页
   ·方法第67-77页
     ·链霉菌菌株培养第67页
     ·抗生素测定第67-68页
     ·天蓝色链霉菌RNA的提取第68-69页
     ·逆转录及RT-PCR第69页
     ·5'RACE分析转录起始位点第69-71页
     ·荧光定量PCR(Real-Time qPCR)第71-72页
     ·邻苯二酚双加氧酶报告基因(xyIE)活性检测方法第72-73页
     ·蛋白浓度测定第73页
     ·氧化还原胁迫实验第73页
     ·大肠杆菌中表达目的蛋白第73-76页
     ·体外pull-down实验第76-77页
   ·结果和讨论第77-108页
     ·sigT的生物信息学分析第77-79页
     ·rstB的基因敲除第79-80页
     ·rstB缺失株的回复突变株构建第80-81页
     ·RstA与RstB体外pull-down实验第81-82页
     ·转录水平分析sigT操纵子的结构以及各基因相互调控关系第82-84页
     ·5'RACE分析转录起始位点第84-88页
     ·sigT操纵子各基因缺失株及其回复株的形态分析第88-93页
     ·磷酸盐和氮源缺陷条件下SigT对次级代谢的影响第93-97页
     ·sigT的启动子活性研究第97-99页
     ·转录水平分析SigT调控基因第99-108页
   ·本章小结第108-110页
第四章 本文研究成果及展望第110-112页
参考文献第112-123页
攻读博士学位期间的主要研究成果第123-124页
致谢第124页

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