| 摘要 | 第5-8页 |
| ABSTRACT | 第8-10页 |
| 第一章 绪论 | 第15-37页 |
| 1.1 引言 | 第15-19页 |
| 1.1.1 凡纳滨对虾产业发展面临的问题 | 第16-19页 |
| 1.1.2 凡纳滨对虾产业发展对策 | 第19页 |
| 1.2 选择育种概述 | 第19-25页 |
| 1.2.1 选择育种的常用策略 | 第20-21页 |
| 1.2.2 选择育种常用选择方法 | 第21-23页 |
| 1.2.3 凡纳滨对虾选育进展 | 第23-25页 |
| 1.3 分子标记辅助选择 | 第25-28页 |
| 1.3.1 分子标记辅助选择概念 | 第25-26页 |
| 1.3.2 分子标记辅助选择应用进展 | 第26-27页 |
| 1.3.3 分子标记辅助选择效率的影响因素 | 第27-28页 |
| 1.4 全基因组关联分析 | 第28-31页 |
| 1.4.1 全基因组关联分析概念 | 第28页 |
| 1.4.2 全基因组关联分析的方法 | 第28-29页 |
| 1.4.3 全基因组关联分析研究现状 | 第29-31页 |
| 1.5 基因组选择 | 第31-36页 |
| 1.5.1 基因组选择概念 | 第31页 |
| 1.5.2 基因组选择方法 | 第31-34页 |
| 1.5.3 基因组选择研究现状 | 第34-36页 |
| 1.6 研究目的和意义 | 第36-37页 |
| 第二章 基于单家系对凡纳滨对虾生长性状进行全基因组关联分析 | 第37-57页 |
| 2.1 实验材料和方法 | 第37-45页 |
| 2.1.1 实验材料制备 | 第37-38页 |
| 2.1.2 表型测定 | 第38-39页 |
| 2.1.3 DNA提取 | 第39-40页 |
| 2.1.4 标记分型 | 第40-41页 |
| 2.1.5 群体分层评估 | 第41页 |
| 2.1.6 统计分析 | 第41-42页 |
| 2.1.7 基因注释 | 第42页 |
| 2.1.8 候选基因SNP位点筛选及验证 | 第42-43页 |
| 2.1.9 候选基因的组织表达特征分析 | 第43-45页 |
| 2.2 结果与分析 | 第45-55页 |
| 2.2.1 表型信息 | 第45-46页 |
| 2.2.2 标记信息 | 第46-47页 |
| 2.2.3 群体结构分析 | 第47-48页 |
| 2.2.4 全基因组关联分析 | 第48-51页 |
| 2.2.5 基因注释和候选基因SNP位点筛选 | 第51-54页 |
| 2.2.6 PKC基因表达特征 | 第54-55页 |
| 2.3 讨论 | 第55-57页 |
| 第三章 基于多家系对凡纳滨对虾生长性状进行全基因组关联分析 | 第57-88页 |
| 3.1 实验材料与方法 | 第57-61页 |
| 3.1.1 实验材料 | 第57页 |
| 3.1.2 表型测定和DNA提取 | 第57页 |
| 3.1.3 标记分型 | 第57-58页 |
| 3.1.4 标记在基因组上的物理距离的获取 | 第58-59页 |
| 3.1.5 连锁不平衡分析 | 第59-60页 |
| 3.1.6 群体分层评估 | 第60页 |
| 3.1.7 统计分析 | 第60-61页 |
| 3.2 结果与分析 | 第61-85页 |
| 3.2.1 表型信息 | 第61页 |
| 3.2.2 标记信息 | 第61-62页 |
| 3.2.3 连锁不平衡分析 | 第62-64页 |
| 3.2.4 群体分层评估 | 第64-65页 |
| 3.2.5 全基因组关联分析 | 第65-85页 |
| 3.3 讨论 | 第85-88页 |
| 第四章 凡纳滨对虾对弧菌抗性性状的全基因组关联分析 | 第88-97页 |
| 4.1 实验材料与方法 | 第88-89页 |
| 4.1.1 实验材料 | 第88页 |
| 4.1.2 对虾弧菌抗性与易感材料制备 | 第88-89页 |
| 4.1.3 对虾体内弧菌携带量的检测 | 第89页 |
| 4.1.4 统计分析 | 第89页 |
| 4.2 结果与分析 | 第89-95页 |
| 4.2.1 表型信息 | 第89-90页 |
| 4.2.2 弧菌载量测定 | 第90-91页 |
| 4.2.3 全基因组关联分析 | 第91-95页 |
| 4.3 讨论 | 第95-97页 |
| 第五章 基于单家系对凡纳滨对虾生长性状进行基因组选择研究 | 第97-103页 |
| 5.1 实验材料与方法 | 第97-99页 |
| 5.1.1 实验材料制备 | 第97页 |
| 5.1.2 表型测定和标记分型 | 第97页 |
| 5.1.3 基因组预测模型 | 第97-98页 |
| 5.1.4 交叉验证 | 第98-99页 |
| 5.1.5 基因组选择模型的预测能力 | 第99页 |
| 5.2 结果与分析 | 第99-100页 |
| 5.3 讨论 | 第100-103页 |
| 第六章 基于多家系对凡纳滨对虾生长性状进行基因组选择研究 | 第103-111页 |
| 6.1 实验材料与方法 | 第103-105页 |
| 6.1.1 实验材料制备 | 第103页 |
| 6.1.2 表型测定和标记分型 | 第103页 |
| 6.1.3 遗传力估计 | 第103-104页 |
| 6.1.4 基因组预测模型 | 第104页 |
| 6.1.5 交叉验证 | 第104-105页 |
| 6.2 结果与分析 | 第105-108页 |
| 6.2.1 生长性状的遗传力 | 第105-106页 |
| 6.2.2 不同标记密度下的基因组预测准确性 | 第106-107页 |
| 6.2.3 不同参考群体下的基因组预测准确性 | 第107-108页 |
| 6.3 讨论 | 第108-111页 |
| 结论 | 第111-113页 |
| 参考文献 | 第113-127页 |
| 致谢 | 第127-129页 |
| 作者简历及攻读学位期间发表的学术论文与研究成果 | 第129-130页 |
