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西瓜重要农艺性状的全基因组关联分析

致谢第4-7页
摘要第7-8页
第一章 文献综述第8-13页
    1.1 我国西瓜发展概况第8-10页
        1.1.1 西瓜概述第8-9页
        1.1.2 西瓜研究现状第9-10页
    1.2 常用遗传标记的比较第10页
        1.2.1 SSR微卫星标记(Simple Sequence Repeat)第10页
        1.2.2 单核苷酸多态性标记(Single Nucleotide Polymorphism)第10页
    1.3 关联分析第10-12页
        1.3.1 关联分析的理论基础和优势第10-11页
        1.3.2 关联分析的方法第11页
        1.3.3 关联分析在西瓜中的应用第11-12页
    1.4 西瓜全基因组关联分析第12-13页
        1.4.1 研究的目的与意义第12页
        1.4.2 研究内容第12页
        1.4.3 技术路线第12-13页
第二章 遗传多样性分析第13-32页
    2.1 试验材料第13-18页
        2.1.1 试验所用的引物第17页
        2.1.2 试验所用主要试剂第17-18页
        2.1.3 试验所用主要仪器第18页
    2.2 试验方法第18-19页
        2.2.1 西瓜DNA提取及检测第18-19页
        2.2.2 PCR反应体系第19页
        2.2.3 扩增引物的检测第19页
        2.2.4 扩增引物的银染显色第19页
    2.3 数据统计与分析第19-20页
        2.3.1 带型统计第19页
        2.3.2 数据分析第19-20页
    2.4 结果与分析第20-30页
        2.4.1 SSR引物筛选第20页
        2.4.2 SSR标记多态性分析第20-28页
        2.4.3 聚类分析第28-29页
        2.4.4 主成分分析第29-30页
        2.4.5 群体结构分析第30页
    2.5 讨论第30-31页
    2.6 小结第31-32页
第三章 表型数据分析第32-45页
    3.1 试验材料第32-33页
        3.1.1 试验时间和地点第32页
        3.1.2 田间种植第32-33页
    3.2 试验方法第33-34页
        3.2.1 西瓜表型数据统计描述第33页
        3.2.2 数据统计标准化第33页
        3.2.3 参数计算第33-34页
    3.3 结果与分析第34-44页
        3.3.1 西瓜26个表型性状的频率分布及变异分析第34-37页
        3.3.2 西瓜26个数量性状的相关性分析第37-40页
        3.3.3 西瓜26个表型性状的主成分分析第40-41页
        3.3.4 西瓜26个表型性状的广义遗传力和方差分析第41-44页
    3.4 讨论第44页
    3.5 小结第44-45页
第四章 全基因组关联分析第45-59页
    4.1 试验材料第45页
    4.2 试验方法第45页
        4.2.1 参数估计第45页
        4.2.2 连锁不平衡分析第45页
        4.2.3 标记与性状的关联分析第45页
    4.3 结果与分析第45-56页
        4.3.1 西瓜基因组LD状态及其衰减第45-46页
        4.3.2 两种模型的比较第46-47页
        4.3.3 与西瓜表型性状关联的位点第47-56页
    4.4 讨论第56-58页
    4.5 小结第58-59页
全文结论第59-60页
参考文献第60-64页
Abstract第64-65页

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