摘要 | 第1-5页 |
Abstract | 第5-8页 |
引言 | 第8-9页 |
1. 理论背景 | 第9-24页 |
·分子力学 | 第9-14页 |
·分子力学概述 | 第10页 |
·分子力场作用项的一般形式 | 第10-14页 |
·密度泛函理论(Density Functional Theory,DFT) | 第14页 |
·电负性及电负性均衡原理 | 第14-16页 |
·分子动力学模拟概述 | 第16-19页 |
·并行计算 | 第19-24页 |
·操作系统与并行编程环境 | 第21-22页 |
·并行算法 | 第22页 |
·并行算法的性能 | 第22-24页 |
2. 原子-键电负性均衡方法 | 第24-31页 |
3. ABEEMσπ型静电相互作用能程序的并行化设计 | 第31-35页 |
·串行程序分析 | 第31-32页 |
·并行程序设计 | 第32页 |
·并行策略 | 第32-33页 |
·测试体系的选取 | 第33-35页 |
4 结果与讨论 | 第35-59页 |
·静电相互作用能并行程序的并行时间、并行加速比与并行效率分析 | 第35-46页 |
·所有能量项并行程序的并行时间、并行加速比与并行效率分析 | 第46-59页 |
结论 | 第59-60页 |
参考文献 | 第60-63页 |
攻读硕士学位期间发表学术论文情况 | 第63-64页 |
致谢 | 第64页 |