| 摘要 | 第6-7页 |
| ABSTRACT | 第7页 |
| 缩略词表 | 第8-9页 |
| 第一篇 文献综述 | 第9-17页 |
| 第一章 猪细环病毒的研究进展 | 第9-17页 |
| 1 病原学特征 | 第9-11页 |
| 1.1 病毒基本性质 | 第9页 |
| 1.2 病毒分类 | 第9-10页 |
| 1.3 病毒基因组分析 | 第10-11页 |
| 1.3.1 病毒基因组组成 | 第10页 |
| 1.3.2 病毒基因分型情况 | 第10-11页 |
| 1.4 培养特性 | 第11页 |
| 2 流行现状研究 | 第11-12页 |
| 2.1 感染宿主 | 第11页 |
| 2.2 传播途径 | 第11-12页 |
| 2.3 流行分布 | 第12页 |
| 3 病毒致病性 | 第12-13页 |
| 4 实验室诊断技术 | 第13-15页 |
| 4.1 病原学检测 | 第13-14页 |
| 4.2 血清学检测 | 第14页 |
| 4.3 其他检测方法 | 第14-15页 |
| 4.3.1 电镜技术 | 第14-15页 |
| 4.3.2 病理组织学 | 第15页 |
| 4.3.3 动物模型 | 第15页 |
| 5 全基因组研究 | 第15-16页 |
| 6 本研究的目的与意义 | 第16-17页 |
| 第二篇 实验研究 | 第17-48页 |
| 第二章 TTSuV PCR检测方法的建立及流行病学调查 | 第17-25页 |
| 1 材料与方法 | 第17-21页 |
| 1.1 临床样品采集 | 第17页 |
| 1.2 实验材料 | 第17-18页 |
| 1.2.1 主要试剂 | 第17-18页 |
| 1.2.2 溶液的配制 | 第18页 |
| 1.3 主要仪器设备 | 第18页 |
| 1.4 引物合成 | 第18-19页 |
| 1.5 病毒总DNA提取 | 第19-20页 |
| 1.6 目的片段PCR扩增和检测 | 第20页 |
| 1.7 PCR产物胶回收 | 第20-21页 |
| 1.8 目的基因片段的克隆 | 第21页 |
| 1.8.1 纯化目的基因片段与载体连接 | 第21页 |
| 1.8.2 重组质粒转化 | 第21页 |
| 1.9 重组质粒PCR鉴定 | 第21页 |
| 2 结果 | 第21-24页 |
| 2.1 猪群血清样品中TTSuV PCR检测结果 | 第21-22页 |
| 2.2 TTSuV1和TTSuV2 UTR基因扩增片段的序列测定与分析 | 第22页 |
| 2.3 采集样品TTSuV检测感染结果统计分析 | 第22-24页 |
| 3 讨论 | 第24-25页 |
| 第三章 猪细环病毒江西分离株全基因组的克隆、测序及分析 | 第25-47页 |
| 1 材料 | 第25页 |
| 1.1 主要试剂 | 第25页 |
| 1.2 病料 | 第25页 |
| 1.3 主要仪器 | 第25页 |
| 2 方法 | 第25-30页 |
| 2.1 TTSuV1和TTSuV2全基因组的扩增 | 第25-27页 |
| 2.1.1 TTSuV全基因组引物的设计及合成 | 第25-26页 |
| 2.1.2 血清中病毒总DNA抽提 | 第26-27页 |
| 2.2 TTSuV1和TTSuV2基因组全长序列的扩增 | 第27页 |
| 2.3 全基因组PCR扩增条件优化 | 第27页 |
| 2.3.1 最佳退火温度的确定 | 第27页 |
| 2.3.2 引物浓度范围的确定 | 第27页 |
| 2.3.3 反应敏感性的测定 | 第27页 |
| 2.4 PCR产物胶回收 | 第27-28页 |
| 2.5 全基因组目的基因的连接与转化克隆 | 第28-30页 |
| 2.5.1 目的基因与载体连接 | 第28页 |
| 2.5.2 连接产物转化 | 第28页 |
| 2.5.3 菌液PCR验证重组质粒 | 第28-29页 |
| 2.5.4 全基因组阳性克隆菌液的序列测定 | 第29-30页 |
| 2.5.5 全基因组序列及蛋白结构分析 | 第30页 |
| 3 实验结果 | 第30-44页 |
| 3.1 全基因组PCR扩增条件优化结果 | 第30页 |
| 3.2 血清样全基因组PCR扩增结果 | 第30-31页 |
| 3.3 PCR纯化产物克隆和测序结果 | 第31-33页 |
| 3.4 TTSuV1和TTSuV2全基因序列分析结果 | 第33-40页 |
| 3.4.1 全基因组序列拼接 | 第33页 |
| 3.4.2 全基因组序列基本结构及ORF的预测分析 | 第33页 |
| 3.4.3 全基因组序列同源性和进化树分析 | 第33-38页 |
| 3.4.4 CpG island等结构的在线预测与查找 | 第38-39页 |
| 3.4.5 TTSuV1和TTSuV2全基因组核苷酸序列变异性的分析 | 第39-40页 |
| 3.5 TTSuV1和TTSuV2的ORF1蛋白质序列预测分析 | 第40-44页 |
| 3.5.1 TTSuV1和TTSuV2的ORF1蛋白亲疏水性结果 | 第41-42页 |
| 3.5.2 TTSuV1和TTSuV2的ORF1蛋白抗原表位分析结果 | 第42-43页 |
| 3.5.3 TTSuV1和TTSuV2的ORF1蛋白亚细胞定位分析结果 | 第43-44页 |
| 4 讨论 | 第44-47页 |
| 4.1 关于引物 | 第44-45页 |
| 4.2 关于TTSuV1和TTSuV2全基因组序列及分析 | 第45-46页 |
| 4.3 关于TTSuV1和TTSuV2 ORF1蛋白分析 | 第46-47页 |
| 第四章 全文结论 | 第47-48页 |
| 参考文献 | 第48-53页 |
| 致谢 | 第53-54页 |
| 附录 | 第54-68页 |
