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Bt菌株KN11基因组及杀虫相关基因分析

摘要第8-10页
英文摘要第10-11页
1 前言第12-29页
    1.1 苏云金芽胞杆菌第12-19页
        1.1.1 杀虫晶体蛋白基因的命名第13-16页
        1.1.2 杀虫晶体蛋白的作用机理第16-18页
        1.1.3 杀虫晶体蛋白的质谱鉴定第18页
        1.1.4 苏云金芽胞杆菌商业化及KN11简介第18-19页
    1.2 微生物基因组学第19-21页
        1.2.1 基因组及基因组学第19-20页
        1.2.2 微生物基因组学及应用第20-21页
        1.2.3 苏云金芽胞杆菌基因组第21页
    1.3 高通量测序技术简介第21-24页
        1.3.1 高通量测序技术的历史及发展第21-22页
        1.3.2 高通量测序技术的优点第22页
        1.3.3 高通量测序基因的拼接方法第22-24页
    1.4 高通量测序技术在苏云金芽孢杆菌中的应用第24-28页
        1.4.1 GO功能注释和基因预测第25页
        1.4.2 比较基因组学第25-27页
        1.4.3 Blast比对本地数据库和聚类分析第27-28页
    1.5 商业菌株KN11的生物活性测试第28页
    1.6 本研究的目的与意义第28页
    1.7 技术路线第28-29页
2 材料与方法第29-42页
    2.1 实验材科第29-30页
        2.1.1 菌株第29页
        2.1.2 培养基与抗生素第29页
        2.1.3 酶与生化试剂第29-30页
        2.1.4 常用溶液和缓冲液第30页
    2.2 仪器设备第30-31页
    2.3 软件或平台第31页
    2.4 研究方法第31-42页
        2.4.1 菌株的形态学鉴定第31页
        2.4.2 KN11杀虫蛋白的SDS-PAGE分析第31-32页
        2.4.3 KN11菌株蛋白质谱第32-33页
        2.4.4 KN11基因组高通量测序拼接第33-35页
        2.4.5 KN11基因组生物信息学分析第35-40页
        2.4.6 菌株KN11的防治效果第40-42页
3 结果与分析第42-55页
    3.1 菌株的形态学鉴定第42页
    3.2 KN11杀虫蛋白的SDS-PAGE分析第42-43页
    3.3 KN11菌株蛋白质谱分析第43-44页
    3.4 KN11菌株基因组简要分析第44-53页
        3.4.1 KN11基因组提取第44-45页
        3.4.2 KN11基因组测序第45-46页
        3.4.3 KN11基因组拼接组装第46-47页
        3.4.4 KN11基因组注释与预测第47-48页
        3.4.5 菌株KN11基因组比较分析第48-50页
        3.4.6 菌株KN11编码杀虫基因情况第50-53页
    3.5 菌株KN11的防治效果第53-55页
4 讨论第55-57页
5 结论第57-58页
致谢第58-59页
参考文献第59-65页
攻读硕士学位期间发表的学术论文第65页

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