首页--医药、卫生论文--神经病学与精神病学论文--精神病学论文--脑器质性精神障碍论文

β-淀粉样蛋白多态性的分子动力学模拟研究

摘要第4-6页
Abstract第6-8页
引言第12-13页
1 概述第13-27页
    1.1 阿尔兹海默病发病机理概述第13-17页
        1.1.1 Aβ的产生第14页
        1.1.2 Aβ级联假说第14-15页
        1.1.3 金属离子假说第15-16页
        1.1.4 离子通道假说第16-17页
    1.2 淀粉样蛋白的结构特征第17-21页
        1.2.1 Aβ单体的结构特征第18-19页
        1.2.2 Aβ寡聚体的结构特征第19-20页
        1.2.3 Aβ纤维体的结构特征第20-21页
    1.3 金属离子与淀粉样蛋白的相互作用第21-23页
    1.4 论文研究内容概述第23-27页
2 理论方法概述第27-38页
    2.1 分子动力学模拟概述第27-34页
        2.1.1 分子动力学模拟简介第27-28页
        2.1.2 分子动力学基本原理第28页
        2.1.3 分子力场第28-30页
        2.1.4 系综选择及温度、压力控制方法第30-31页
        2.1.5 周期性边界条件第31-32页
        2.1.6 溶剂模型第32-34页
    2.2 副本交换分子动力学模拟第34-35页
    2.3 二面角动力学分析方法第35-36页
        2.3.1 二面角势能分析第35页
        2.3.2 二面角主成份分析第35-36页
    2.4 马尔科夫模型的建立第36页
    2.5 MM-PBSA自由能计算第36-38页
3 单点突变对Aβ42多态性的影响第38-58页
    3.1 引言第38-39页
    3.2 模拟方法第39-40页
        3.2.1 理论模型的建立第39-40页
        3.2.2 分子动力学模拟第40页
    3.3 结果与讨论第40-57页
        3.3.1 模拟结果收敛性验证第40-43页
        3.3.2 Aβ42和Aβ42突变体的结构性质分析第43-45页
        3.3.3 二面角主成份分析第45-47页
        3.3.4 二面角势能分析及皮尔逊相关系数的计算第47-49页
        3.3.5 马尔科夫模型建立及结果分析第49-57页
    3.4 本章小结第57-58页
4 Zn~(2+)对β-淀粉样蛋白多态性的影响第58-75页
    4.1 引言第58-59页
    4.2 模拟方法第59-61页
        4.2.1 理论模型的建立第59-60页
        4.2.2 分子动力学模拟第60-61页
    4.3 结果与讨论第61-74页
        4.3.1 模拟结果收敛性验证第61-62页
        4.3.2 二面角势能分析及皮尔逊相关系数的计算第62-65页
        4.3.3 二面角主成份分析第65-69页
        4.3.4 马尔科夫模型建立及结果分析第69-74页
    4.4 本章小结第74-75页
5 含β-发夹结构的Zn~(2+)-Aβ40寡聚体的分子动力学模拟第75-89页
    5.1 引言第75-76页
    5.2 模拟方法第76-77页
        5.2.1 理论模型的建立第76页
        5.2.2 分子动力学模拟第76-77页
    5.3 结果与讨论第77-87页
        5.3.1 Zn~(2+)-Aβ40单体中β-发夹结构的稳定性分析第77-79页
        5.3.2 (Aβ40-Zn~(2+))_2中β-发夹结构的稳定性分析第79-82页
        5.3.3 Zn~(2+)对(Aβ40-Zn~(2+))_2中β-发夹结构的影响第82-84页
        5.3.4 Zn~(2+)-Aβ40寡聚体的结构分析第84-86页
        5.3.5 Zn~(2+)-Aβ40寡聚体的热力学特性分析第86-87页
    5.4 本章小结第87-89页
结论第89-91页
参考文献第91-104页
攻读硕士学位期间发表学术论文情况第104-105页
致谢第105-106页

论文共106页,点击 下载论文
上一篇:罗氟司特及其杂质的合成工艺研究
下一篇:2010年全球脑卒中发病情况分析