| 摘要 | 第5-7页 |
| Abstract | 第7-9页 |
| 第一章 绪论 | 第13-29页 |
| 1.1 多环芳烃污染概况 | 第13-15页 |
| 1.1.1 多环芳烃(PAHs)简介 | 第13-14页 |
| 1.1.2 多环芳烃(PAHs)污染环境修复现状 | 第14-15页 |
| 1.2 表面活性剂影响微生物修复PAHs污染的研究进展 | 第15-20页 |
| 1.2.1 菌体表面吸附 | 第16-19页 |
| 1.2.2 跨膜转运 | 第19-20页 |
| 1.2.3 菌体细胞内降解 | 第20页 |
| 1.3 PAHs污染环境微生物修复的分子生物学研究 | 第20-26页 |
| 1.3.1 微生物基因组学研究 | 第21页 |
| 1.3.2 微生物基因组测序技术的发展 | 第21-23页 |
| 1.3.3 微生物的转录组学研究 | 第23-24页 |
| 1.3.4 微生物的蛋白组学研究 | 第24-25页 |
| 1.3.5 PAHs微生物降解的分子生物学研究进展 | 第25-26页 |
| 1.4 选题依据及研究内容 | 第26-29页 |
| 第二章 非离子表面活性剂对Sphingomonas sp.GY2B细胞特性及降解菲的能力的影响研究 | 第29-47页 |
| 2.1 实验材料 | 第29-30页 |
| 2.2 实验方法 | 第30-33页 |
| 2.2.1 菲降解菌Sphingomonas sp. GY2B的培养 | 第30页 |
| 2.2.2 表面活性剂对菌GY2B降解菲的影响 | 第30-31页 |
| 2.2.3 流式细胞仪检测GY2B细胞活性 | 第31-32页 |
| 2.2.4 GY2B细胞形态观察 | 第32页 |
| 2.2.5 GY2B细胞表面特性分析 | 第32-33页 |
| 2.3 实验结果与讨论 | 第33-46页 |
| 2.3.1 表面活性剂对GY2B生长和细胞活性的影响 | 第33-39页 |
| 2.3.2 表面活性剂对GY2B细胞膜通透性的影响 | 第39-40页 |
| 2.3.3 表面活性剂对GY2B细胞表面元素组成和官能团的影响 | 第40-43页 |
| 2.3.4 表面活性剂对GY2B降解菲的影响 | 第43-46页 |
| 2.4 本章小结 | 第46-47页 |
| 第三章 蛋白质组学研究Tween80促进Sphingomonas sp. GY2B降解菲的作用机理 | 第47-69页 |
| 3.1 实验材料 | 第47-48页 |
| 3.2 实验方法 | 第48-53页 |
| 3.2.1 菲降解菌Sphingomonas sp.GY2B的培养 | 第48页 |
| 3.2.2 差异表达蛋白分析 | 第48-53页 |
| 3.3 结果与讨论 | 第53-68页 |
| 3.3.1 Tween80对GY2B蛋白质表达的影响 | 第53-59页 |
| 3.3.2 差异表达蛋白质的功能分类 | 第59-61页 |
| 3.3.3 Tween80促进GY2B降解菲的功能蛋白分析 | 第61-66页 |
| 3.3.4 Tween80促进GY2B降解菲的作用机制（蛋白质表达水平） | 第66-68页 |
| 3.4 本章小结 | 第68-69页 |
| 第四章 Sphingomonas sp. GY2B的全基因组测序 | 第69-78页 |
| 4.1 实验菌株 | 第69页 |
| 4.2 实验方法 | 第69-72页 |
| 4.2.1 GY2B基因组DNA的提取 | 第69-70页 |
| 4.2.2 GY2B基因组测序流程 | 第70页 |
| 4.2.3 GY2B基因组测序数据的生物信息分析 | 第70-71页 |
| 4.2.4 GY2B基因组测序数据的生物信息分析 | 第71-72页 |
| 4.3 结果与讨论 | 第72-77页 |
| 4.3.1 GY2B基因组测序数据的组装 | 第72-74页 |
| 4.3.2 GY2B基因组组分分析 | 第74-75页 |
| 4.3.3 GY2B基因组功能注释 | 第75-77页 |
| 4.4 本章小结 | 第77-78页 |
| 第五章 转录组学研究Tween80促进Sphingomonas sp. GY2B降解菲的作用机理 | 第78-120页 |
| 5.1 实验材料 | 第78-79页 |
| 5.2 实验方法 | 第79-83页 |
| 5.2.1 菲降解菌Sphingomonas sp.GY2B的培养 | 第79页 |
| 5.2.2 GY2B的转录组学测序 | 第79-83页 |
| 5.3 结果与讨论 | 第83-119页 |
| 5.3.1 总RNA质量评估 | 第83-84页 |
| 5.3.2 转录组测序质量评估 | 第84-85页 |
| 5.3.3 Tween80对GY2B基因表达的影响 | 第85-86页 |
| 5.3.4 差异表达基因的GO功能和KEGG代谢通路分析 | 第86-89页 |
| 5.3.5 差异基因表达的qRT-PCR验证 | 第89页 |
| 5.3.6 Tween80促进GY2B降解菲的功能基因分析 | 第89-117页 |
| 5.3.7 Tween80促进GY2B降解菲的调控机理（基因表达水平） | 第117-119页 |
| 5.4 本章小结 | 第119-120页 |
| 结论与展望 | 第120-123页 |
| 本文结论 | 第120-122页 |
| 本文主要创新点 | 第122页 |
| 研究展望 | 第122-123页 |
| 参考文献 | 第123-152页 |
| 附录 | 第152-164页 |
| 攻读博士学位期间取得的研究成果 | 第164-166页 |
| 致谢 | 第166-168页 |
| 附件 | 第168页 |
