| 摘要 | 第3-5页 |
| Abstract | 第5-6页 |
| 第1章 绪论 | 第9-19页 |
| 1.1 本文的研究背景和意义 | 第9-10页 |
| 1.2 国内外关于合成生物学相关领域的研究现状 | 第10-16页 |
| 1.2.1 基因线路的设计和构建 | 第10-11页 |
| 1.2.2 合成代谢网络及合成化合物 | 第11-13页 |
| 1.2.3 病毒、细菌基因组合成及基因组的简化和重构 | 第13-14页 |
| 1.2.4 关于多细胞群体系统的研究及功能预测 | 第14页 |
| 1.2.5 合成生物学用于药物研发、疾病治疗及合成传感器 | 第14-15页 |
| 1.2.6 设计和构建生物组成成分的标准化、模块化 | 第15-16页 |
| 1.3 本文的研究内容 | 第16-17页 |
| 1.4 本文的结构 | 第17-19页 |
| 第2章 软件应用的发展与研究 | 第19-31页 |
| 2.1 引言 | 第19页 |
| 2.2 基础工具和软件 | 第19-21页 |
| 2.2.1 Perl语言及iGEM | 第19-20页 |
| 2.2.2 SQL Server | 第20-21页 |
| 2.2.3 PlasMpper | 第21页 |
| 2.2.4 BLAST | 第21页 |
| 2.3 GenoCAD软件 | 第21-24页 |
| 2.3.1 GenoCAD软件原理 | 第21-22页 |
| 2.3.2 GenoCAD软件在各个领域中的应用 | 第22-24页 |
| 2.4 逻辑门的原理与发展 | 第24-26页 |
| 2.4.1 逻辑门原理 | 第24-25页 |
| 2.4.2 简单的逻辑结构 | 第25页 |
| 2.4.3 组合与级联逻辑电路 | 第25-26页 |
| 2.5 逻辑门的研究现状 | 第26-29页 |
| 2.6 本章总结 | 第29-31页 |
| 第3章 数据处理及基于GenoCAD、有序逻辑门的质粒部件的构建 | 第31-55页 |
| 3.1 引言 | 第31-32页 |
| 3.2 数据处理过程及分析 | 第32-39页 |
| 3.2.1 数据处理方法 | 第32-36页 |
| 3.2.2 化简数据分析 | 第36-39页 |
| 3.3 GenoCAD质粒设计的原理 | 第39-43页 |
| 3.4 基于有序逻辑门的质粒部件的构造 | 第43-45页 |
| 3.4.1 引言 | 第43-44页 |
| 3.4.2 有序逻辑门的模型及其设计 | 第44页 |
| 3.4.3 有序逻辑门设计质粒构造过程 | 第44-45页 |
| 3.5 结果分析 | 第45-53页 |
| 3.5.1 BLAST序列比对分析 | 第45-51页 |
| 3.5.2 PlasMapper序列比对分析 | 第51-53页 |
| 3.6 本章总结 | 第53-55页 |
| 第4章 结论与展望 | 第55-57页 |
| 4.1 结论 | 第55-56页 |
| 4.2 展望 | 第56-57页 |
| 参考文献 | 第57-69页 |
| 致谢 | 第69-71页 |
| 攻读学位期间的研究成果 | 第71页 |
